Analyses of publicly available structural data reveal interesting insights into the impact of the three-dimensional (3D) structures of protein targets important for discovery of new drugs (e.g., G-protein-coupled receptors, voltage-gated ion channels, ligand-gated ion channels, transporters, and E3 ubiquitin ligases). The Protein Data Bank (PDB) archive currently holds > 155,000 atomic-level 3D structures of biomolecules experimentally determined using crystallography, nuclear magnetic resonance spectroscopy, and electron microscopy. The PDB was established in 1971 as the first open-access, digital-data resource in biology, and is now managed by the Worldwide PDB partnership (wwPDB; wwPDB.org). US PDB operations are the responsibility of the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics PDB (RCSB PDB). The RCSB PDB serves millions of RCSB.org users worldwide by delivering PDB data integrated with ∼40 external biodata resources, providing rich structural views of fundamental biology, biomedicine, and energy sciences. Recently published work showed that the PDB archival holdings facilitated discovery of ∼90% of the 210 new drugs approved by the US Food and Drug Administration 2010-2016. We review user-driven development of RCSB PDB services, examine growth of the PDB archive in terms of size and complexity, and present examples and opportunities for structure-guided drug discovery for challenging targets (e.g., integral membrane proteins).

中文翻译：

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RCSB蛋白质数据库：支持生物医学研究和药物发现。

对公开可用结构数据的分析揭示了对蛋白质靶标的三维（3D）结构的影响的有趣见解，这些蛋白质靶标对于发现新药非常重要（例如，G蛋白偶联受体，电压门控离子通道，配体门控离子通道，转运蛋白和E3泛素连接酶）。蛋白质数据库（PDB）档案库目前拥有超过155,000个原子级3D结构的生物分子，这些结构是通过晶体学，核磁共振波谱和电子显微镜实验确定的。PDB成立于1971年，是生物学中第一个开放获取的数字数据资源，现在由Worldwide PDB合作伙伴（wwPDB; wwPDB.org）管理。美国PDB的运作由结构生物信息学PDB研究合作社（RCSB PDB）负责。RCSB PDB通过提供与约40种外部生物数据资源集成的PDB数据，为全球数百万RCSB.org用户提供服务，提供了基础生物学，生物医学和能源科学的丰富结构视图。最近发表的工作表明，PDB档案馆藏促进了美国食品药品监督管理局2010-2016年批准的210种新药中约90％的发现。我们审查了由用户驱动的RCSB PDB服务的开发，从大小和复杂性方面检查了PDB档案的增长，并提供了针对具有挑战性的靶标（例如，整合膜蛋白）的结构指导药物发现的实例和机会。最近发表的工作表明，PDB档案馆藏促进了美国食品药品监督管理局2010-2016年批准的210种新药中约90％的发现。我们审查了由用户驱动的RCSB PDB服务的开发，从大小和复杂性方面检查了PDB档案的增长，并提供了针对具有挑战性的靶标（例如，整合膜蛋白）的结构指导药物发现的实例和机会。最近发表的工作表明，PDB档案馆藏促进了美国食品药品监督管理局2010-2016年批准的210种新药中约90％的发现。我们审查了由用户驱动的RCSB PDB服务的开发，从大小和复杂性方面检查了PDB档案的增长，并提供了针对具有挑战性的靶标（例如，整合膜蛋白）的结构指导药物发现的实例和机会。