Liquid-liquid phase separation (LLPS) leads to a conversion of homogeneous solution into a dense phase that often resembles liquid droplets, and a dilute phase. An increasing number of investigations have shown that biomolecular condensates formed by LLPS play important roles in both physiology and pathology. It has been suggested the phase behavior of proteins would be not only determined by sequences, but controlled by micro-environmental conditions. Here, we introduce LLPSDB (http://bio-comp.ucas.ac.cn/llpsdb or http://bio-comp.org.cn/llpsdb), a web-accessible database providing comprehensive, carefully curated collection of proteins involved in LLPS as well as corresponding experimental conditions in vitro from published literatures. The current release of LLPSDB incorporates 1182 entries with 273 independent proteins and 2394 specific conditions. The database provides a variety of data including biomolecular information (protein sequence, protein modification, nucleic acid, etc.), specific phase separation information (experimental conditions, phase behavior description, etc.) and comprehensive annotations. To our knowledge, LLPSDB is the first available database designed for LLPS related proteins specifically. It offers plenty of valuable resources for exploring the relationship between protein sequence and phase behavior, and will enhance the development of phase separation prediction methods, which may further provide more insights into a comprehensive understanding of LLPS in cellular function and related diseases.

中文翻译：

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LLPSDB：蛋白质在体外进行液-液相分离的数据库。

液-液相分离（LLPS）导致均相溶液转化为通常类似于液滴的致密相和稀相。越来越多的研究表明，由LLPS形成的生物分子缩合物在生理和病理学中均起着重要作用。已经提出蛋白质的相行为不仅将由序列确定，而且将由微环境条件控制。在这里，我们介绍LLPSDB（http://bio-comp.ucas.ac.cn/llpsdb或http://bio-comp.org.cn/llpsdb），这是一个可通过网络访问的数据库，可提供全面，精心策划的蛋白质集合从已发表的文献中参与了LLPS以及相应的体外实验条件。当前版本的LLPSDB包含1182个条目以及273个独立蛋白和2394个特定条件。该数据库提供了多种数据，包括生物分子信息（蛋白质序列，蛋白质修饰，核酸等），特定的相分离信息（实验条件，相行为描述等）和全面的注释。据我们所知，LLPSDB是第一个专门为LLPS相关蛋白设计的数据库。它为探索蛋白质序列与相行为之间的关系提供了大量有价值的资源，并将促进相分离预测方法的发展，这可能进一步为深入了解细胞功能和相关疾病中的LLPS提供更多见解。该数据库提供了多种数据，包括生物分子信息（蛋白质序列，蛋白质修饰，核酸等），特定的相分离信息（实验条件，相行为描述等）和全面的注释。据我们所知，LLPSDB是第一个专门为LLPS相关蛋白设计的数据库。它为探索蛋白质序列与相行为之间的关系提供了大量有价值的资源，并将促进相分离预测方法的发展，这可能进一步为深入了解细胞功能和相关疾病中的LLPS提供更多见解。该数据库提供了多种数据，包括生物分子信息（蛋白质序列，蛋白质修饰，核酸等），特定的相分离信息（实验条件，相行为描述等）和全面的注释。据我们所知，LLPSDB是第一个专门为LLPS相关蛋白设计的数据库。它为探索蛋白质序列与相行为之间的关系提供了大量有价值的资源，并将促进相分离预测方法的发展，这可能进一步为深入了解细胞功能和相关疾病中的LLPS提供更多见解。等）和综合注释。据我们所知，LLPSDB是第一个专门为LLPS相关蛋白设计的数据库。它为探索蛋白质序列与相行为之间的关系提供了大量有价值的资源，并将促进相分离预测方法的发展，这可能进一步为深入了解细胞功能和相关疾病中的LLPS提供更多见解。等）和综合注释。据我们所知，LLPSDB是第一个专门为LLPS相关蛋白设计的数据库。它为探索蛋白质序列与相行为之间的关系提供了大量有价值的资源，并将促进相分离预测方法的发展，这可能进一步为深入了解细胞功能和相关疾病中的LLPS提供更多见解。