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The evolutionary genomics of species’ responses to climate change
Nature Ecology & Evolution ( IF 16.8 ) Pub Date : 2021-08-09 , DOI: 10.1038/s41559-021-01526-9
Jonás A Aguirre-Liguori 1 , Santiago Ramírez-Barahona 2 , Brandon S Gaut 1
Affiliation  

Climate change is a threat to biodiversity. One way that this threat manifests is through pronounced shifts in the geographical range of species over time. To predict these shifts, researchers have primarily used species distribution models. However, these models are based on assumptions of niche conservatism and do not consider evolutionary processes, potentially limiting their accuracy and value. To incorporate evolution into the prediction of species’ responses to climate change, researchers have turned to landscape genomic data and examined information about local genetic adaptation using climate models. Although this is an important advancement, this approach currently does not include other evolutionary processes—such as gene flow, population dispersal and genomic load—that are critical for predicting the fate of species across the landscape. Here, we briefly review the current practices for the use of species distribution models and for incorporating local adaptation. We next discuss the rationale and theory for considering additional processes, reviewing how they can be incorporated into studies of species’ responses to climate change. We summarize with a conceptual framework of how manifold layers of information can be combined to predict the potential response of specific populations to climate change. We illustrate all of the topics using an exemplar dataset and provide the source code as potential tutorials. This Perspective is intended to be a step towards a more comprehensive integration of population genomics with climate change science.



中文翻译:

物种对气候变化反应的进化基因组学

气候变化是对生物多样性的威胁。这种威胁表现出来的一种方式是随着时间的推移物种地理范围的明显变化。为了预测这些变化,研究人员主要使用物种分布模型。然而,这些模型基于利基保守主义的假设,没有考虑进化过程,可能会限制它们的准确性和价值。为了将进化纳入物种对气候变化反应的预测,研究人员转向了景观基因组数据,并使用气候模型检查了有关当地遗传适应的信息。虽然这是一个重要的进步,但这种方法目前不包括其他进化过程——例如基因流、种群扩散和基因组负荷——这些对于预测整个景观中物种的命运至关重要。在这里,我们简要回顾了目前使用物种分布模型和纳入当地适应的做法。我们接下来讨论考虑额外过程的基本原理和理论,回顾如何将它们纳入物种对气候变化的反应的研究。我们总结了一个概念框架,该框架说明如何结合多层次信息来预测特定人群对气候变化的潜在反应。我们使用示例数据集来说明所有主题,并提供源代码作为潜在的教程。该观点旨在成为人口基因组学与气候变化科学更全面整合的一步。我们接下来讨论考虑额外过程的基本原理和理论,回顾如何将它们纳入物种对气候变化的反应的研究。我们总结了一个概念框架,该框架说明如何结合多层次信息来预测特定人群对气候变化的潜在反应。我们使用示例数据集来说明所有主题,并提供源代码作为潜在的教程。该观点旨在成为人口基因组学与气候变化科学更全面整合的一步。我们接下来讨论考虑额外过程的基本原理和理论,回顾如何将它们纳入物种对气候变化的反应的研究。我们总结了一个概念框架,该框架说明如何结合多层次信息来预测特定人群对气候变化的潜在反应。我们使用示例数据集来说明所有主题,并提供源代码作为潜在的教程。该观点旨在成为人口基因组学与气候变化科学更全面整合的一步。我们总结了一个概念框架,该框架说明如何结合多层次信息来预测特定人群对气候变化的潜在反应。我们使用示例数据集来说明所有主题,并提供源代码作为潜在的教程。该观点旨在成为人口基因组学与气候变化科学更全面整合的一步。我们总结了一个概念框架,该框架说明如何结合多层次信息来预测特定人群对气候变化的潜在反应。我们使用示例数据集来说明所有主题,并提供源代码作为潜在的教程。该观点旨在成为人口基因组学与气候变化科学更全面整合的一步。

更新日期:2021-08-10
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