Despite increased use of genomic data in phylogenetics, morphological information remains vital for resolving evolutionary relationships, particularly for fossil taxa. The properties and models of evolution of molecular sequence data are well characterized and mature, relative to those of morphological data. Furthermore, heterogeneity, integration and relative homoplasy of empirical morphological data could prove problematic for phylogenetic reconstruction. Here we compare osteological and non-osteological characters of 28 morphological datasets of extant saurians in terms of their homoplasy relative to molecular trees. Analysis of individual avian datasets finds osteological characters to be significantly more consistent with molecular data than soft characters are. Significant differences between morphological partitions were also observed in the age at which characters resolved on molecular trees. Osteological character changes occur relatively earlier in deep branches, whilst soft-tissue character transitions are more recent in shallow branches. The combined results demonstrate differences in evolutionary dynamics between morphological partitions. This may reflect evolutionary constraints acting on osteological characters, compared with the relative lability of soft characters. Furthermore, it provides some support to phylogenetic interpretations of fossil data, including dinosaurs, which are predominately osteological. Recent advances in amphibian and mammal phylogenetics may make these patterns possible to test for all tetrapods.

中文翻译：

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鸟类和爬行动物的骨学特征与分子系统发育的一致性高于软性特征

尽管在系统发育学中越来越多地使用基因组数据，但形态信息对于解决进化关系仍然至关重要，特别是对于化石类群。相对于形态学数据，分子序列数据的演化特性和模型具有很好的特征和成熟性。此外，经验形态学数据的异质性、整合性和相对同源性可能证明系统发育重建存在问题。在这里，我们比较了 28 个现存蜥蜴形态数据集的骨学和非骨学特征，就它们相对于分子树的同源性而言。对单个鸟类数据集的分析发现，骨学特征与分子数据的一致性明显高于软特征。在分子树上解析字符的年龄也观察到了形态分区之间的显着差异。深部分支的骨性特征变化相对较早，而浅部分支的软组织特征转变较晚。综合结果证明了形态分区之间进化动力学的差异。与软性状的相对不稳定性相比，这可能反映了作用于骨学性状的进化限制。此外，它为化石数据的系统发育解释提供了一些支持，包括主要是骨学的恐龙。两栖动物和哺乳动物系统发育学的最新进展可能使这些模式可以测试所有四足动物。深部分支的骨性特征变化相对较早，而浅部分支的软组织特征转变较晚。综合结果证明了形态分区之间进化动力学的差异。与软性状的相对不稳定性相比，这可能反映了作用于骨学性状的进化限制。此外，它为化石数据的系统发育解释提供了一些支持，包括主要是骨学的恐龙。两栖动物和哺乳动物系统发育学的最新进展可能使这些模式可以测试所有四足动物。深部分支的骨性特征变化相对较早，而浅部分支的软组织特征转变较晚。综合结果证明了形态分区之间进化动力学的差异。与软性状的相对不稳定性相比，这可能反映了作用于骨学性状的进化限制。此外，它为化石数据的系统发育解释提供了一些支持，包括主要是骨学的恐龙。两栖动物和哺乳动物系统发育学的最新进展可能使这些模式可以测试所有四足动物。综合结果证明了形态分区之间进化动力学的差异。与软性状的相对不稳定性相比，这可能反映了作用于骨学性状的进化限制。此外，它为化石数据的系统发育解释提供了一些支持，包括主要是骨学的恐龙。两栖动物和哺乳动物系统发育学的最新进展可能使这些模式可以测试所有四足动物。综合结果证明了形态分区之间进化动力学的差异。与软性状的相对不稳定性相比，这可能反映了作用于骨学性状的进化限制。此外，它为化石数据的系统发育解释提供了一些支持，包括主要是骨学的恐龙。两栖动物和哺乳动物系统发育学的最新进展可能使这些模式可以测试所有四足动物。