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Sparrows and supergenes: Ecological epigenetics in action
Molecular Ecology ( IF 4.9 ) Pub Date : 2021-06-18 , DOI: 10.1111/mec.16028 Jordan A Anderson 1 , Jenny Tung 1, 2, 3, 4
Molecular Ecology ( IF 4.9 ) Pub Date : 2021-06-18 , DOI: 10.1111/mec.16028 Jordan A Anderson 1 , Jenny Tung 1, 2, 3, 4
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Despite the promise of ecological epigenetics, there remain few cases that clearly link epigenetic variation in wild animal populations to evolutionary change. In this issue of Molecular Ecology, Sun et al. provide such an example in white-throated sparrows—a fascinating system in which a large chromosomal rearrangement generates a “supergene” polymorphism linked to plumage colour, aggression and parenting behaviour. By combining whole genome bisulphite sequencing with RNA-sequencing and chromatin accessibility data, they show that the two alleles of this chromosomal polymorphism also exhibit substantial differences in DNA methylation levels, with implications for gene expression and transposable element activity. Their results provide a compelling case study for how genetic and epigenetic evolution proceed in concert. They also demonstrate the importance of integrating multiple types of genomic information to understand how gene regulation evolves, providing a model for future work in nonmodel species.
中文翻译:
麻雀和超基因:行动中的生态表观遗传学
尽管生态表观遗传学前景广阔,但仍然很少有案例可以明确将野生动物种群的表观遗传变异与进化变化联系起来。在本期分子生态学,孙等人。在白喉麻雀中提供了这样一个例子——一个引人入胜的系统,在这个系统中,大量的染色体重排产生了与羽毛颜色、攻击性和养育行为相关的“超基因”多态性。通过将全基因组亚硫酸氢盐测序与 RNA 测序和染色质可及性数据相结合,他们表明这种染色体多态性的两个等位基因也表现出 DNA 甲基化水平的显着差异,对基因表达和转座因子活性有影响。他们的结果为遗传和表观遗传进化如何协同进行提供了令人信服的案例研究。他们还证明了整合多种类型的基因组信息以了解基因调控如何进化的重要性,为非模式物种的未来工作提供了一个模型。
更新日期:2021-07-23
中文翻译:
麻雀和超基因:行动中的生态表观遗传学
尽管生态表观遗传学前景广阔,但仍然很少有案例可以明确将野生动物种群的表观遗传变异与进化变化联系起来。在本期分子生态学,孙等人。在白喉麻雀中提供了这样一个例子——一个引人入胜的系统,在这个系统中,大量的染色体重排产生了与羽毛颜色、攻击性和养育行为相关的“超基因”多态性。通过将全基因组亚硫酸氢盐测序与 RNA 测序和染色质可及性数据相结合,他们表明这种染色体多态性的两个等位基因也表现出 DNA 甲基化水平的显着差异,对基因表达和转座因子活性有影响。他们的结果为遗传和表观遗传进化如何协同进行提供了令人信服的案例研究。他们还证明了整合多种类型的基因组信息以了解基因调控如何进化的重要性,为非模式物种的未来工作提供了一个模型。