ABSTRACT Old World fruit bats (Chiroptera: Yinpterochiroptera: Pteropodidae) are a diverse radiation endemic to the tropics of Africa, Asia, Australia, and nearby island archipelagos. Recent molecular analyses have provided considerable resolution of phylogenetic relationships within this group, but many points of uncertainty have remained including the position of several enigmatic taxa (e.g., Notopteris, Eidolon), relationships among species in more diverse subfamilies and genera (e.g., Pteropodinae, Pteropus, Epomophorus), and topology of the backbone of the tree. Here we provide a new, synthetic analysis including representatives of all 45 currently recognized genera and enhanced sampling in several speciose genera. Our matrix included four nuclear genes regions (vWF, RAG1, RAG2, and BRCA1) and four mitochondrial gene loci (Cytb, tRNA valine, 12S rRNA, and 16S rRNA) for a total of >8000 bp including new sequence data for 13 species. Maximum likelihood and Bayesian analyses resulted in trees supporting recognition of six main suprageneric clades similar in content to those identified in our previous studies. We did not recover strong support for relationships among the main clades along the backbone of the tree, but identified many well-supported clades within all of the major groups. Based on these results, we propose a new classification for Pteropodidae comprising eight subfamilies and 14 tribes, and including several new and/or replacement higher-level taxonomic names for which we provide morphological diagnoses.

中文翻译：

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旧世界果蝠的物种级系统发育与翼足科新的高级分类

摘要旧世界果蝠（Chiroptera：Yinpterochiroptera：Pteropodidae）是非洲、亚洲、澳大利亚和附近岛屿群岛热带地区特有的多种辐射。最近的分子分析为该组内的系统发育关系提供了相当大的分辨率，但许多不确定点仍然存在，包括几个神秘分类群（例如，Notopteris、Eidolon）的位置、更多样化的亚科和属中的物种之间的关系（例如，Pteropodinae、 Pteropus, Epomophorus)，以及树的主干拓扑。在这里，我们提供了一种新的综合分析，包括所有 45 个当前公认的属的代表和几个特殊属中的增强采样。我们的矩阵包括四个核基因区域（vWF、RAG1、RAG2 和 BRCA1）和四个线粒体基因位点（Cytb、tRNA 缬氨酸、12S rRNA 和 16S rRNA）总共 >8000 bp，包括 13 个物种的新序列数据。最大似然和贝叶斯分析导致树支持识别与我们之前研究中确定的内容相似的六个主要超基因进化枝。我们没有恢复对沿树主干的主要进化枝之间关系的强烈支持，但在所有主要组中确定了许多得到良好支持的进化枝。基于这些结果，我们提出了一个新的翼足科分类，包括 8 个亚科和 14 个部落，并包括几个新的和/或替代的高级分类名称，我们为其提供形态学诊断。最大似然和贝叶斯分析导致树支持识别与我们之前研究中确定的内容相似的六个主要超基因进化枝。我们没有恢复对沿树主干的主要进化枝之间关系的强烈支持，但在所有主要组中确定了许多得到良好支持的进化枝。基于这些结果，我们提出了一个新的翼足科分类，包括 8 个亚科和 14 个部落，并包括几个新的和/或替代的高级分类名称，我们为其提供形态学诊断。最大似然和贝叶斯分析导致树支持识别与我们之前研究中确定的内容相似的六个主要超基因进化枝。我们没有恢复对沿树主干的主要进化枝之间关系的强烈支持，但在所有主要组中确定了许多得到良好支持的进化枝。基于这些结果，我们提出了一个新的翼足科分类，包括 8 个亚科和 14 个部落，并包括几个新的和/或替代的高级分类名称，我们为其提供形态学诊断。但在所有主要群体中确定了许多得到充分支持的进化枝。基于这些结果，我们提出了一个新的翼足科分类，包括 8 个亚科和 14 个部落，并包括几个新的和/或替代的高级分类名称，我们为其提供形态学诊断。但在所有主要群体中确定了许多得到充分支持的进化枝。基于这些结果，我们提出了一个新的翼足科分类，包括 8 个亚科和 14 个部落，并包括几个新的和/或替代的高级分类名称，我们为其提供形态学诊断。