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Genomic alterations in gynecological malignancies: histotype-associated driver mutations, molecular subtyping schemes, and tumorigenic mechanisms
Journal of Human Genetics ( IF 3.5 ) Pub Date : 2021-06-07 , DOI: 10.1038/s10038-021-00940-y
Seiichi Mori 1 , Osamu Gotoh 1 , Kazuma Kiyotani 2 , Siew Kee Low 2
Affiliation  

There are numerous histological subtypes (histotypes) of gynecological malignancies, with each histotype considered to largely reflect a feature of the “cell of origin,” and to be tightly linked with the clinical behavior and biological phenotype of the tumor. The recent advances in massive parallel sequencing technologies have provided a more complete picture of the range of the genomic alterations that can persist within individual tumors, and have highlighted the types and frequencies of driver-gene mutations and molecular subtypes often associated with these histotypes. Several large-scale genomic cohorts, including the Cancer Genome Atlas (TCGA), have been used to characterize the genomic features of a range of gynecological malignancies, including high-grade serous ovarian carcinoma, uterine corpus endometrial carcinoma, uterine cervical carcinoma, and uterine carcinosarcoma. These datasets have also been pivotal in identifying clinically relevant molecular targets and biomarkers, and in the construction of molecular subtyping schemes. In addition, the recent widespread use of clinical sequencing for the more ubiquitous types of gynecological cancer has manifested in a series of large genomic datasets that have allowed the characterization of the genomes, driver mutations, and histotypes of even rare cancer types, with sufficient statistical power. Here, we review the field of gynecological cancer, and seek to describe the genomic features by histotype. We also will demonstrate how these are linked with clinicopathological attributes and highlight the potential tumorigenic mechanisms.



中文翻译:

妇科恶性肿瘤的基因组改变:组织型相关驱动突变、分子亚型方案和致瘤机制

妇科恶性肿瘤有许多组织学亚型(histotypes),每一种组织型都被认为在很大程度上反映了“起源细胞”的特征,并与肿瘤的临床行为和生物学表型密切相关。大规模平行测序技术的最新进展提供了一个更完整的图片,说明了可以在单个肿瘤中持续存在的基因组改变的范围,并突出了驱动基因突变的类型和频率,以及通常与这些组织型相关的分子亚型。包括癌症基因组图谱 (TCGA) 在内的几个大规模基因组队列已被用于表征一系列妇科恶性肿瘤的基因组特征,包括高级别浆液性卵巢癌、子宫体部子宫内膜癌、子宫颈癌和子宫癌肉瘤。这些数据集在确定临床相关的分子靶标和生物标志物以及构建分子亚型方案方面也至关重要。此外,最近对更普遍的妇科癌症类型的临床测序的广泛使用已经体现在一系列大型基因组数据集上,这些数据集允许对基因组、驱动突变和甚至罕见癌症类型的组织类型进行表征,并具有足够的统计数据。力量。在这里,我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。这些数据集在确定临床相关的分子靶标和生物标志物以及构建分子亚型方案方面也至关重要。此外,最近对更普遍的妇科癌症类型的临床测序的广泛使用已经体现在一系列大型基因组数据集上,这些数据集允许对基因组、驱动突变和甚至罕见癌症类型的组织类型进行表征,并具有足够的统计数据。力量。在这里,我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。这些数据集在确定临床相关的分子靶标和生物标志物以及构建分子亚型方案方面也至关重要。此外,最近对更普遍的妇科癌症类型的临床测序的广泛使用已经体现在一系列大型基因组数据集上,这些数据集允许对基因组、驱动突变和甚至罕见癌症类型的组织类型进行表征,并具有足够的统计数据。力量。在这里,我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。最近,临床测序广泛应用于更普遍的妇科癌症类型,这体现在一系列大型基因组数据集上,这些数据集允许对基因组、驱动突变和甚至罕见癌症类型的组织类型进行表征,并具有足够的统计能力。在这里,我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。最近,临床测序广泛应用于更普遍的妇科癌症类型,这体现在一系列大型基因组数据集上,这些数据集允许对基因组、驱动突变和甚至罕见癌症类型的组织类型进行表征,并具有足够的统计能力。在这里,我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。我们回顾了妇科癌症领域,并试图通过组织型来描述基因组特征。我们还将展示这些如何与临床病理学属性相关联,并强调潜在的致瘤机制。

更新日期:2021-06-07
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