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Interannual dynamics, diversity and evolution of the virome in Sclerotinia sclerotiorum from a single crop field
Virus Evolution ( IF 5.3 ) Pub Date : 2021-03-30 , DOI: 10.1093/ve/veab032
Jichun Jia 1, 2 , Yanping Fu 2 , Daohong Jiang 1, 2 , Fan Mu 1, 2 , Jiasen Cheng 1, 2 , Yang Lin 2 , Bo Li 1, 2 , Shin-Yi Lee Marzano 3 , Jiatao Xie 1, 2
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Mycovirus diversity is generally analyzed from isolates of fungal culture isolates at a single point in time as a snapshot. The stability of mycovirus composition within the same geographical location over time remains unclear. Not knowing how the population fluctuates in the field can be a source of unpredictability in the successful application of virocontrol. To better understand the changes over time, we monitored the interannual dynamics and abundance of mycoviruses infecting Sclerotinia sclerotiorum at a rapeseed-growing field for three years. We found that the virome in S. sclerotiorum harbors unique mycovirus compositions each year. In total, sixty-eight mycoviruses were identified, among which twenty-four were detected in all three successive years. These twenty-four mycoviruses can be classified as the members of the core virome in this S. sclerotiorum population, which show persistence and relatively high transmissibility under field conditions. Nearly two-thirds of the mycoviruses have positive-sense, single-stranded RNA genomes and were found consistently across all three years. Moreover, twenty-eight mycoviruses are newly described, including four novel, multi-segmented narnaviruses, and four unique bunyaviruses. Overall, the newly discovered mycoviruses in this study belong to as many as twenty families, into which eight were first identified in S. sclerotiorum, demonstrating evolutionarily diverse viromes. Our findings not only shed light on the annual variation of mycovirus diversity but also provide important virus evolutionary clues.

中文翻译:

单一农田核盘菌病毒组的年际动态、多样性和进化

通常在单个时间点从真菌培养分离物的分离物中分析真菌病毒多样性作为快照。随着时间的推移,同一地理位置内的真菌病毒成分的稳定性仍不清楚。不知道该领域的种群如何波动可能是病毒控制成功应用的不可预测性的来源。为了更好地了解随时间的变化,我们在油菜种植田中监测了感染核盘菌的真菌病毒的年际动态和丰度,为期三年。我们发现核盘菌中的病毒组每年都含有独特的真菌病毒成分。总共鉴定出 68 种真菌病毒,其中连续三年检测到 24 种。这 24 种真菌病毒可归类为该核盘菌种群的核心病毒组成员,它们在田间条件下表现出持久性和相对较高的传播性。近三分之二的真菌病毒具有正义的单链 RNA 基因组,并且在所有三年中始终如一地被发现。此外,新描述了 28 种真菌病毒,包括 4 种新的多节段纳纳病毒和 4 种独特的布尼亚病毒。总体而言,本研究中新发现的真菌病毒属于多达 20 个科,其中 8 个首次在 S. sclerotiorum 中发现,证明了进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。在野外条件下表现出持久性和相对较高的传播性。近三分之二的真菌病毒具有正义的单链 RNA 基因组,并且在所有三年中始终如一地被发现。此外,新描述了 28 种真菌病毒,包括 4 种新的多节段纳纳病毒和 4 种独特的布尼亚病毒。总体而言,本研究中新发现的真菌病毒属于多达 20 个科,其中 8 个首次在 S. sclerotiorum 中发现,证明了进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。在野外条件下表现出持久性和相对较高的传播性。近三分之二的真菌病毒具有正义的单链 RNA 基因组,并且在所有三年中始终如一地被发现。此外,新描述了 28 种真菌病毒,包括 4 种新的多节段纳纳病毒和 4 种独特的布尼亚病毒。总体而言,本研究中新发现的真菌病毒属于多达 20 个科,其中 8 个首次在 S. sclerotiorum 中发现,证明了进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。单链 RNA 基因组,并且在所有三年中始终如一地被发现。此外,新描述了 28 种真菌病毒,包括 4 种新的多节段纳纳病毒和 4 种独特的布尼亚病毒。总体而言,本研究中新发现的真菌病毒属于多达 20 个科,其中 8 个首次在 S. sclerotiorum 中发现,证明了进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。单链 RNA 基因组,并且在所有三年中始终如一地被发现。此外,新描述了 28 种真菌病毒,包括 4 种新的多节段纳纳病毒和 4 种独特的布尼亚病毒。总体而言,本研究中新发现的真菌病毒属于多达 20 个科,其中 8 个首次在 S. sclerotiorum 中发现,证明了进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。sclerotiorum,表现出进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。sclerotiorum,表现出进化上多样化的病毒组。我们的研究结果不仅揭示了真菌病毒多样性的年度变异,还提供了重要的病毒进化线索。
更新日期:2021-03-30
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