Abstract

Genetic aberrations in the epigenome are rare in pediatric AML, hence expression data in epigenetic regulation and its downstream effect is lacking in childhood AML. Our pilot study screened epigenetic modifiers and its related oncogenic signal transduction pathways concerning clinical outcomes in a small cohort of pediatric AML in KSA. RNA from diagnostic BM biopsies (n = 35) was subjected to expression analysis employing the nCounter Pan-Cancer pathway panel. The patients were dichotomized into low ASXL1 (17/35; 49%) and high ASXL1 (18/35; 51%) groups based on ROC curve analysis. Age, gender, hematological data or molecular risk factors (FLT3 mutation/molecular fusion) exposed no significant differences across these two distinct ASXL1 expression groups (P > 0.05). High ASXL1 expression showed linkage with high expression of other epigenetic modifiers (TET2/EZH2/IDH1&2). Our data showed that high ASXL1 mRNA is interrelated with increased BRCA1 associated protein-1 (BAP1) and its target gene E2F Transcription Factor 1 (E2F1) expression. High ASXL1 expression was associated with high mortality {10/18 (56%) vs. 1/17; (6%) P < 0 .002}. Low ASXL1 expressers showed better OS {740 days vs. 579 days; log-rank P= < 0.023; HR 7.54 (0.98-54.1)}. The association between high ASXL1 expression and epigenetic modifiers is interesting but unexplained and require further investigation. High ASXL1 expression is associated with BAP1 and its target genes. Patients with high ASXL1 expression showed poor OS without any association with a conventional molecular prognostic marker.

摘要

表观基因组的遗传畸变在儿科 AML 中很少见，因此在儿童 AML 中缺乏表观遗传调控及其下游效应的表达数据。我们的初步研究筛选了表观遗传修饰因子及其相关的致癌信号转导通路，这些通路与 KSA 的一小群儿科 AML 的临床结果有关。使用 nCounter Pan-Cancer 通路面板对来自诊断性 BM 活检 (n = 35) 的 RNA 进行表达分析。根据 ROC 曲线分析，将患者分为低 ASXL1（17/35；49%）和高 ASXL1（18/35；51%）组。年龄、性别、血液学数据或分子危险因素（FLT3 突变/分子融合）在这两个不同的 ASXL1 表达组之间没有显着差异（P > 0.05）。ASXL1 的高表达表明与其他表观遗传修饰符（TET2/EZH2/IDH1&2）的高表达有关。我们的数据显示高 ASXL1 mRNA 与增加的 BRCA1 相关蛋白 1 (BAP1) 及其靶基因 E2F 转录因子 1 (E2F1) 表达相关。高 ASXL1 表达与高死亡率相关 {10/18 (56%) vs. 1/17; (6%) P < 0 .002}。低 ASXL1 表达者表现出更好的 OS {740 天 vs. 579 天；对数秩 P= < 0.023；HR 7.54 (0.98-54.1)}。高 ASXL1 表达与表观遗传修饰符之间的关联很有趣，但无法解释，需要进一步调查。ASXL1 的高表达与 BAP1 及其靶基因有关。具有高 ASXL1 表达的患者显示出较差的 OS，与传统的分子预后标志物没有任何关联。我们的数据显示高 ASXL1 mRNA 与增加的 BRCA1 相关蛋白 1 (BAP1) 及其靶基因 E2F 转录因子 1 (E2F1) 表达相关。高 ASXL1 表达与高死亡率相关 {10/18 (56%) vs. 1/17; (6%) P < 0 .002}。低 ASXL1 表达者表现出更好的 OS {740 天 vs. 579 天；对数秩 P= < 0.023；HR 7.54 (0.98-54.1)}。高 ASXL1 表达与表观遗传修饰符之间的关联很有趣，但无法解释，需要进一步调查。ASXL1 的高表达与 BAP1 及其靶基因有关。具有高 ASXL1 表达的患者显示出较差的 OS，与传统的分子预后标志物没有任何关联。我们的数据显示高 ASXL1 mRNA 与增加的 BRCA1 相关蛋白 1 (BAP1) 及其靶基因 E2F 转录因子 1 (E2F1) 表达相关。高 ASXL1 表达与高死亡率相关 {10/18 (56%) vs. 1/17; (6%) P < 0 .002}。低 ASXL1 表达者表现出更好的 OS {740 天 vs. 579 天；对数秩 P= < 0.023；HR 7.54 (0.98-54.1)}。高 ASXL1 表达与表观遗传修饰符之间的关联很有趣，但无法解释，需要进一步调查。ASXL1 的高表达与 BAP1 及其靶基因有关。具有高 ASXL1 表达的患者显示出较差的 OS，与传统的分子预后标志物没有任何关联。