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体内高炔丙基甘氨酸的掺入可实现拟南芥中新生的蛋白质标签,分离和鉴定
bioRxiv - Plant Biology Pub Date : 2021-03-05 , DOI: 10.1101/2021.03.04.433937
Nathan D. Tivendale , Ricarda Fenske , Owen Duncan , A. Harvey Millar

确定在给定的时间点主动合成哪些蛋白质并提取它们进行分析对于理解植物的反应很重要。在这里,我们显示蛋氨酸(Met)类似物高炔丙基甘氨酸(HPG)使在拟南芥植物或细胞培养物中合成的蛋白质的BONCAT(生物正交非规范氨基酸标记),有助于其点击化学富集以进行分析。HPG掺入位点可以通过肽质谱法在整个蛋白质AA序列的Met位点进行确认,并与15N的蛋白质标记的独立研究相关,从而验证了数据。我们提供的证据表明,在拟南芥中,基于HPG的BONCAT比基于叠氮高丙氨酸(AHA)的BONCAT更有效地标记新生植物蛋白,并显示AHA' Met代谢的诱导和对细胞生长速率的抑制比HPG更大,可能会限制拟南芥中Met位点的AHA掺入。我们显示,基于HPG的BONCAT提供了一种可验证的方法,用于确定在给定时间点正在合成哪些植物蛋白,并从大量蛋白库中富集新蛋白分子以进行鉴定,定量和随后的生化分析。发现富集的新生多肽含有比整个植物提取物中的相同蛋白质少得多的常见翻译后修饰残基,为植物中与年龄相关的PTM积累提供了证据。我们显示,基于HPG的BONCAT提供了一种可验证的方法,用于确定在给定时间点正在合成哪些植物蛋白,并从大量蛋白库中富集新蛋白分子以进行鉴定,定量和随后的生化分析。发现富集的新生多肽含有比整个植物提取物中的相同蛋白质少得多的常见翻译后修饰残基,为植物中与年龄相关的PTM积累提供了证据。我们显示,基于HPG的BONCAT提供了一种可验证的方法,用于确定在给定时间点正在合成哪些植物蛋白,并从大量蛋白库中富集新蛋白分子以进行鉴定,定量和随后的生化分析。发现富集的新生多肽含有比整个植物提取物中的相同蛋白质少得多的常见翻译后修饰残基,为植物中与年龄相关的PTM积累提供了证据。



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更新日期:2021-03-05
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