微观藻类将有机化合物释放到紧邻其细胞的区域，称为藻圈，从而构成了异养细菌定居的利基。这些细菌吸收藻类的光同化物并为其宿主提供有益的功能，其过程类似于建立与陆地植物根部和根际相关的微生物群落。在这里，我们表征了藻类莱茵衣藻的微生物群，并揭示了与陆地植物根部微生物群的广泛分类和功能重叠。使用源自莱茵衣藻和拟南芥的合成群落进行的重建实验表明，在任一宿主上，藻圈和根细菌都组装成分类学上等效的群落。我们显示，提供扩散性代谢物不足以建立藻圈群落，这还需要与宿主物理接近。我们的数据表明，光合生物的微生物群（包括绿藻和开花植物）是根据核心生态原理组装的。



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