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大规模胎盘DNA甲基化的大规模分析揭示了胎儿性别特异性差异甲基化CpG位点和区域
bioRxiv - Genomics Pub Date : 2021-03-08 , DOI: 10.1101/2021.03.04.433985
Shan V. Andrews , Irene J. Yang , Karolin Froehlich , Tomiko Oskotsky , Marina Sirota

尽管已经观察到胎盘结构和功能的男女差异,但对其分子基础的了解却很少。在这里,我们提出了14个可公开获得的胎盘DNA甲基化(DNAm)微阵列数据集的大型分析,以识别单个CpGs和与胎儿性别相关的区域。在足月妊娠胎盘的发现数据集中(N = 532个样本),有5,212个CpGs达到了全基因组范围的意义(p <1E-8),并且富含诸如角质化等途径(FDR p值= 7.37E-14)。 ,趋化因子活性(FDR p值= 1.56E-2)和嗜酸性粒细胞迁移(FDR p值= 1.83E-2)。鉴定出9个差异甲基化区域(fwerArea <0。1)在ZNF300启动子中包含一个区域,该区域从怀孕的早期时间点开始在样品中显示出一致的DNAm差异,并且似乎主要受滋养层细胞类型的影响所驱动。我们描述了迄今为止最大的胎盘DNAm中胎儿性别差异的研究,揭示了表征性别的胎盘功能和生命后期健康结局的基因和途径。



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更新日期:2021-03-09
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