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显微镜元数据统一用例中的OMERO.mde:通过元数据注释工具促进实际应用中的FAIR原则
arXiv - CS - Digital Libraries Pub Date : 2021-03-04 , DOI: arxiv-2103.02942
Susanne Kunis, Sebastian Hänsch, Christian Schmidt, Frances Wong, Stefanie Weidtkamp-Peters

尽管FAIR原则在科学界已广为接受,但为了确保FAIR研究数据在实践中的实施,适当的元数据编辑和传输的实施明显滞后。一方面,它在很大程度上取决于有效支持研究数据管理这一步骤的工具的可用性。另一方面,它取决于有关元数据可解释性的可用标准。在这里,我们介绍了一种工具OMERO.mde,该工具用于以轻松舒适的方式编辑显微成像数据的元数据,该工具在调整元数据集方面具有很高的灵活性。许多应用微观技术的研究人员都非常需要此功能。OMERO.mde已成为映像数据库OMERO的标准安装包的一部分。该数据库有助于组织和可视化微观图像数据,并跟踪它们的进一步处理以及与其他数据集的链接。因此,许多成像核心设施向其用户提供了OMERO。我们提供了一个针对OMERO.mde量身定制的应用案例,以对基于机构OMERO的膜染料数据库的数据进行成像,这需要特定的实验元数据。与公共图像数据存储库(例如,图像数据资源IDR)相似,此数据库有助于图像数据存储,其中包括丰富的元数据,这使得数据挖掘和重用成为FAIR原则的主要目标之一。我们提供了一个针对OMERO.mde量身定制的应用案例,以对基于机构OMERO的膜染料数据库的数据进行成像,这需要特定的实验元数据。与公共图像数据存储库(例如,图像数据资源IDR)相似,此数据库有助于图像数据存储,其中包括丰富的元数据,这使得数据挖掘和重用成为FAIR原则的主要目标之一。我们提供了一个针对OMERO.mde量身定制的应用案例,以对基于机构OMERO的膜染料数据库的数据进行成像,这需要特定的实验元数据。与公共图像数据存储库(例如,图像数据资源IDR)相似,此数据库有助于图像数据存储,其中包括丰富的元数据,这使得数据挖掘和重用成为FAIR原则的主要目标之一。



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更新日期:2021-03-05
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