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图像到图像翻译的一种新应用:通过从单个图像中学习来实现染色体校正框架
arXiv - CS - Artificial Intelligence Pub Date : 2021-03-04 , DOI: arxiv-2103.02835
Sifan Song, Daiyun Huang, Yalun Hu, Chunxiao Yang, Jia Meng, Fei Ma, Jiaming Zhang, Jionglong Su

在医学成像中,染色体拉直在染色体的病理研究和细胞遗传图谱的开发中起着重要作用。尽管存在用于矫直任务的不同方法,但它们大多是几何算法,其输出以锯齿状边缘或具有不连续带状图案的碎片为特征。为了解决几何算法中的缺陷,我们提出了一种基于图像到图像转换的新颖框架,以学习相关的映射依赖性,以合成具有不间断条带模式和保留细节的直化染色体。此外,为了避免输入染色体不足的陷阱,我们仅使用一个弯曲的染色体图像作为训练模型来构建增强的数据集。基于此框架,我们应用了两种流行的图像到图像翻译体系结构,U形网络和条件生成对抗网络,以评估其效果。在包含642个现实世界染色体的数据集上进行的实验证明,与几何方法相比,通过渲染逼真的和连续的染色体详细信息,我们的框架在矫直性能方面具有优越性。此外,我们经过整理的结果改善了染色体分类,平均准确度达到了0.98%-1.39%。



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更新日期:2021-03-05
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