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淋巴肿瘤易感基因位点测序绘制了六个骨髓瘤风险基因
Human Molecular Genetics ( IF 3.5 ) Pub Date : 2021-03-02 , DOI: 10.1093/hmg/ddab066
Rosalie Griffin Waller 1 , Robert J Klein 2 , Joseph Vijai 3, 4 , James D McKay 5 , Alyssa Clay-Gilmour 6, 7 , Xiaomu Wei 4 , Michael J Madsen 8 , Douglas W Sborov 8 , Karen Curtin 8 , Susan L Slager 9 , Kenneth Offit 3, 4 , Celine M Vachon 6 , Steven M Lipkin 4 , Charles Dumontet 10 , Nicola J Camp 8
Affiliation  

遗传性遗传风险因素在多发性骨髓瘤 (MM) 中发挥作用,但存在大量缺失的遗传力。全基因组关联研究 (GWAS) 基因座的罕见风险变异是探索的新途径。家族史和遗传研究中已经提出淋巴肿瘤 (LNs) 之间的多效性,但没有研究质疑多效性基因或罕见风险变异的测序。对基因富集的病例进行测序可以帮助发现更罕见的变异。我们分析了家族性或早发性 MM 病例的外显子组测序,以确定 GWAS 基因座附近的罕见、功能相关变异,用于一系列 LN。共发布了 149 个不同且重要的 LN GWAS 基因座。我们在 75 例 MM 病例中,在 5 kb 的显着 GWAS 单核苷酸多态性中鉴定了 6 个复发的、罕见的、潜在有害的变异。在 BTNL2、EOMES、TNFRSF13B、IRF8、ACOXL 和 TSPAN32 中观察到突变。所有六个基因在一组独立的 255 个早发性 MM 或家族性 MM 或前体病例中复制。将我们的分析扩展到这六个基因的全长,产生了 39 个稀有和有害变异的列表,其中 7 个在 MM 家族中分离。与 935 名对照个体相比,在 733 名散发性 MM 病例中,三个基因也具有显着的罕见变异负担:IRF8 (P = 1.0 × 10-6)、EOMES (P = 6.0 × 10-6) 和 BTNL2 (P = 2.1 × 10-3) )。总之,我们的结果涉及 MM 风险中的六个基因,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供支持,并证明对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。所有六个基因在一组独立的 255 个早发性 MM 或家族性 MM 或前体病例中复制。将我们的分析扩展到这六个基因的全长,产生了 39 个罕见和有害变异的列表,其中 7 个在 MM 家族中分离。与 935 名对照个体相比,在 733 名散发性 MM 病例中,三个基因也具有显着的罕见变异负荷:IRF8 (P = 1.0 × 10-6)、EOMES (P = 6.0 × 10-6) 和 BTNL2 (P = 2.1 × 10-3) )。总之,我们的结果表明 6 个基因与 MM 风险有关,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供了支持,并证明了对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。所有六个基因在一组独立的 255 个早发性 MM 或家族性 MM 或前体病例中复制。将我们的分析扩展到这六个基因的全长,产生了 39 个罕见和有害变异的列表,其中 7 个在 MM 家族中分离。与 935 名对照个体相比,在 733 名散发性 MM 病例中,三个基因也具有显着的罕见变异负荷:IRF8 (P = 1.0 × 10-6)、EOMES (P = 6.0 × 10-6) 和 BTNL2 (P = 2.1 × 10-3) )。总之,我们的结果表明 6 个基因与 MM 风险有关,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供了支持,并证明了对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。将我们的分析扩展到这六个基因的全长,产生了 39 个罕见和有害变异的列表,其中 7 个在 MM 家族中分离。与 935 名对照个体相比,在 733 名散发性 MM 病例中,三个基因也具有显着的罕见变异负荷:IRF8 (P = 1.0 × 10-6)、EOMES (P = 6.0 × 10-6) 和 BTNL2 (P = 2.1 × 10-3) )。总之,我们的结果表明 6 个基因与 MM 风险有关,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供了支持,并证明了对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。将我们的分析扩展到这六个基因的全长,产生了 39 个罕见和有害变异的列表,其中 7 个在 MM 家族中分离。与 935 名对照个体相比,在 733 名散发性 MM 病例中,三个基因也具有显着的罕见变异负荷:IRF8 (P = 1.0 × 10-6)、EOMES (P = 6.0 × 10-6) 和 BTNL2 (P = 2.1 × 10-3) )。总之,我们的结果表明 6 个基因与 MM 风险有关,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供了支持,并证明了对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。1 × 10−3)。总之,我们的结果表明 6 个基因与 MM 风险有关,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供了支持,并证明了对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。1 × 10−3)。总之,我们的结果表明 6 个基因与 MM 风险有关,为 LN 亚型之间的遗传多效性提供了支持,并证明了对基因富集的病例进行测序以识别 GWAS 基因座附近的功能相关变异的实用性。



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更新日期:2021-03-02
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