使用 PacBio 测序的淡色库蚊（双翅目：Culicidae）基因组组装草案,Genome Biology and Evolution

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使用 PacBio 测序的淡色库蚊（双翅目：Culicidae）基因组组装草案
Genome Biology and Evolution ( IF 3.3 ) Pub Date : 2021-01-06 , DOI: 10.1093/gbe/evab005
Cheng Peng _{1,

2} , Zhang Qian _{1,

3} , Zhang Xinyu _{1,

3} , Le Qianqian _{1,

3} , Gong Maoqing _{1,

2} , Zhang Zhong _{1,

3} , Zhang Ruiling _{1,

3}

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北方家蚊（Culex pipiens pallens）是几种疾病的重要温带媒介，特别是流行性脑炎和淋巴丝虫病。Cx 的参考基因组。pipiens pallens 有助于了解蚊子生物学复杂性背后的基因组基础。使用 142 Gb（~250×）的 PacBio 长读长，我们组装了 567.56 Mb 的基因组草图。该组件包括 1,714 个重叠群，N50 长度为 0.84 Mb，基准通用单拷贝直系同源基因 (BUSCO) 完整性为 95.6% (n = 1,367)。我们将 60.63% (344.11 Mb) 的基因组掩盖为重复元件，并鉴定了 2,032 个非编码 RNA。共有 18,122 个蛋白质编码基因捕获了 94.1% 的 BUSCO 基因集。

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更新日期：2021-01-06

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