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Comparative analysis of extracellular proteomes reveals putative effectors of the boxwood blight pathogens, Calonectria henricotiae and C. pseudonaviculata.
Bioscience Reports ( IF 4 ) Pub Date : 2021-02-23 , DOI: 10.1042/bsr20203544
Xiao Yang 1, 2 , Michael B McMahon 1 , Sowmya R Ramachandran 1, 2 , Wesley M Garrett 3 , Nicholas LeBlanc 2, 4 , Jo Anne Crouch 4 , Nina Shishkoff 1 , Douglas G Luster 1
Affiliation  

Calonectria henricotiae (Che) and C. pseudonaviculata (Cps) are destructive fungal pathogens causing boxwood blight, a persistent threat to horticultural production, landscape industries, established gardens, and native ecosystems. Although extracellular proteins including effectors produced by fungal pathogens are known to play a fundamental role in pathogenesis, the composition of Che and Cps extracellular proteins has not been examined. Using liquid chromatography-tandem mass spectrometry and bioinformatic prediction tools, 630 extracellular proteins and 251 cell membrane proteins of Che and Cps were identified in the classical secretion pathway in this study. In the non-classical secretion pathway, 79 extracellular proteins were identified. The cohort of proteins belonged to 364 OrthoMCL clusters, with the majority (62%) present in both species, and a subset unique to Che (19%) and Cps (20%). These extracellular proteins were predicted to play important roles in cell structure, regulation, metabolism, and pathogenesis. A total of 124 proteins were identified as putative effectors. Many of them are orthologs of proteins with documented roles in suppressing host defense and facilitating infection processes in other pathosystems, such as SnodProt1-like proteins in the OrthoMCL cluster OG5_152723 and PhiA-like cell wall proteins in the cluster OG5_155754. This exploratory study provides a repository of secreted proteins and putative effectors that can provide insights into the virulence mechanisms of the boxwood blight pathogens.

中文翻译:

细胞外蛋白质组的比较分析揭示了黄杨枯病病原体、Calonectria henricotiae 和 C.pseudonaviculata 的推定效应物。

Calonectria henricotiae (Che) 和 C. pseudonaviculata (Cps) 是导致黄杨枯病的破坏性真菌病原体,对园艺生产、景观工业、已建花园和本地生态系统构成持续威胁。尽管已知包括由真菌病原体产生的效应物在内的细胞外蛋白在发病机制中起重要作用,但尚未检查 Che 和 Cps 细胞外蛋白的组成。使用液相色谱-串联质谱和生物信息学预测工具,在本研究的经典分泌途径中鉴定了 Che 和 Cps 的 630 种细胞外蛋白和 251 种细胞膜蛋白。在非经典分泌途径中,鉴定了 79 种细胞外蛋白。蛋白质队列属于 364 个 OrthoMCL 簇,大多数 (62%) 存在于两个物种中,以及 Che (19%) 和 Cps (20%) 独有的子集。预计这些细胞外蛋白在细胞结构、调节、代谢和发病机制中起重要作用。共有 124 种蛋白质被鉴定为推定的效应物。它们中的许多是蛋白质的直系同源物,在其他病理系统中具有抑制宿主防御和促进感染过程的作用,例如 OrthoMCL 簇 OG5_152723 中的类 SnodProt1 蛋白和簇 OG5_155754 中的 PhiA 样细胞壁蛋白。这项探索性研究提供了一个分泌蛋白和推定效应物的存储库,可以深入了解黄杨枯病病原体的毒力机制。预计这些细胞外蛋白在细胞结构、调节、代谢和发病机制中起重要作用。共有 124 种蛋白质被鉴定为推定的效应物。它们中的许多是蛋白质的直系同源物,在其他病理系统中具有抑制宿主防御和促进感染过程的作用,例如 OrthoMCL 簇 OG5_152723 中的类 SnodProt1 蛋白和簇 OG5_155754 中的 PhiA 样细胞壁蛋白。这项探索性研究提供了一个分泌蛋白和推定效应物的存储库,可以深入了解黄杨枯病病原体的毒力机制。预计这些细胞外蛋白在细胞结构、调节、代谢和发病机制中起重要作用。共有 124 种蛋白质被鉴定为推定的效应物。它们中的许多是蛋白质的直系同源物,在其他病理系统中具有抑制宿主防御和促进感染过程的作用,例如 OrthoMCL 簇 OG5_152723 中的类 SnodProt1 蛋白和簇 OG5_155754 中的 PhiA 样细胞壁蛋白。这项探索性研究提供了一个分泌蛋白和推定效应物的存储库,可以深入了解黄杨枯病病原体的毒力机制。它们中的许多是蛋白质的直系同源物,在其他病理系统中具有抑制宿主防御和促进感染过程的作用,例如 OrthoMCL 簇 OG5_152723 中的类 SnodProt1 蛋白和簇 OG5_155754 中的 PhiA 样细胞壁蛋白。这项探索性研究提供了一个分泌蛋白和推定效应物的存储库,可以深入了解黄杨枯病病原体的毒力机制。它们中的许多是蛋白质的直系同源物,在其他病理系统中具有抑制宿主防御和促进感染过程的作用,例如 OrthoMCL 簇 OG5_152723 中的类 SnodProt1 蛋白和簇 OG5_155754 中的 PhiA 样细胞壁蛋白。这项探索性研究提供了一个分泌蛋白和推定效应物的存储库,可以深入了解黄杨枯病病原体的毒力机制。
更新日期:2021-02-25
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