Amphibian skin bacteria may confer protection against the fungus Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), but responses of skin bacteria to different Bd lineages are poorly understood. The global panzootic lineage (Bd-GPL) has caused amphibian declines and extinctions globally. However, other lineages are enzootic (Bd-Asia-2/Brazil). Increased contact rates between Bd-GPL and enzootic lineages via globalization pose unknown consequences for host-microbiome-pathogen dynamics. We conducted a laboratory experiment and used 16S rRNA amplicon-sequencing to assess: (i) whether two lineages (Bd-Asia-2/Brazil and Bd-GPL) and their recombinant, in single and mixed infections, differentially affect amphibian skin bacteria; (ii) and the changes associated with the transition to laboratory conditions. We determined no clear differences in bacterial diversity among Bd treatments, despite differences in infection intensity. However, we observed an additive effect of mixed infections on bacterial alpha diversity and a potentially antagonistic interaction between Bd genotypes. Additionally, observed changes in community composition suggest a higher ability of Bd-GPL to alter skin bacteria. Lastly, we observed a drastic reduction in bacterial diversity and a change in community structure in laboratory conditions. We provide evidence for complex interactions between Bd genotypes and amphibian skin bacteria during coinfections, and expand on the implications of experimental conditions in ecological studies.

中文翻译：

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共同感染的病原体谱系对宿主细菌群落具有累加效应

两栖动物皮肤细菌可能对真菌 Batrachochytrium dendrobatidis (Bd) 具有保护作用，但皮肤细菌对不同 Bd 谱系的反应知之甚少。全球泛动物谱系 (Bd-GPL) 已导致全球两栖动物数量减少和灭绝。然而，其他谱系是地方动物（Bd-Asia-2/Brazil）。通过全球化增加 Bd-GPL 和地方动物谱系之间的接触率对宿主-微生物组-病原体动力学造成了未知的后果。我们进行了一项实验室实验并使用 16S rRNA 扩增子测序来评估：（i）两种谱系（Bd-Asia-2/Brazil 和 Bd-GPL）及其重组体在单一和混合感染中是否对两栖动物皮肤细菌有不同的影响；(ii) 以及与过渡到实验室条件相关的变化。尽管感染强度存在差异，但我们确定 Bd 治疗之间的细菌多样性没有明显差异。然而，我们观察到混合感染对细菌 α 多样性的累加效应以及 Bd 基因型之间潜在的拮抗相互作用。此外，观察到的群落组成变化表明 Bd-GPL 改变皮肤细菌的能力更高。最后，我们观察到实验室条件下细菌多样性的急剧减少和群落结构的变化。我们提供了 Bd 基因型和两栖动物皮肤细菌在共感染期间复杂相互作用的证据，并扩展了实验条件在生态学研究中的影响。我们观察到混合感染对细菌α多样性的累加效应以及 Bd 基因型之间潜在的拮抗相互作用。此外，观察到的群落组成变化表明 Bd-GPL 改变皮肤细菌的能力更高。最后，我们观察到实验室条件下细菌多样性的急剧减少和群落结构的变化。我们提供了 Bd 基因型和两栖动物皮肤细菌在共感染期间复杂相互作用的证据，并扩展了实验条件在生态学研究中的影响。我们观察到混合感染对细菌α多样性的累加效应以及 Bd 基因型之间潜在的拮抗相互作用。此外，观察到的群落组成变化表明 Bd-GPL 改变皮肤细菌的能力更高。最后，我们观察到实验室条件下细菌多样性的急剧减少和群落结构的变化。我们提供了 Bd 基因型和两栖动物皮肤细菌在共感染期间复杂相互作用的证据，并扩展了实验条件在生态学研究中的影响。我们观察到实验室条件下细菌多样性的急剧减少和群落结构的变化。我们提供了 Bd 基因型和两栖动物皮肤细菌在共感染期间复杂相互作用的证据，并扩展了实验条件在生态学研究中的影响。我们观察到实验室条件下细菌多样性的急剧减少和群落结构的变化。我们提供了 Bd 基因型和两栖动物皮肤细菌在共感染期间复杂相互作用的证据，并扩展了实验条件在生态学研究中的影响。