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Isoptericola sediminis sp. nov., Isolated from Chilika Lagoon
Current Microbiology ( IF 2.6 ) Pub Date : 2021-01-21 , DOI: 10.1007/s00284-020-02325-4
Dhanesh Kumar , Jagadeeshwari U. , Krishnaiah A. , Suresh G. , Ch. Sasikala , Ch. Venkata Ramana

A yellow-colored, Gram-stain-positive, rod shaped, non-motile bacterium, designated as strain JC619T, was isolated from the sediment of Chilika lagoon, India. Strain JC619T shows highest 16S rRNA gene sequence similarity (99.08%) with Isoptericola chiayiensis KCTC 19740T followed by Isoptericola halotolerans KCTC 19046T (98.6%) and other members of the genus Isoptericola (< 98%). NaCl is required for growth of strain JC619T and tolerates up to 18% (w/v) and pH up to 10. Strain JC619T grows optimally at temperature 30 °C, NaCl concentration of 3% (w/v), and at pH 7.5. The genome size of strain JC619T is 3.2 Mb with G+C content of 73.0 mol%. ANI scores of strain JC619T are 81.9% and 80.1% and dDDH values are 24.4% and 22.7% with I. chiayiensis KCTC 19740T and I. halotolerans KCTC 19046T, respectively. Respiratory quinones are MK-9(H4) and MK-9(H2). Predominant fatty acids (> 10%) are anteiso-C15:0, iso-C16:0, and iso-C15:0. Major polar lipids of strain JC619T are phosphatidylglycerol, phosphatidylinositolmannoside, diphosphatidylglycerol, and phosphatidylinositol. Strain JC619T is catalase positive but cytochrome oxidase negative and reduces nitrate. The genomic distinction of strain JC619T with its nearest related species of the genus Isoptericola is well supported with chemotaxonomic characteristics and differential physiological properties. Therefore, strain JC619T represents a new species under the genus Isoptericola for which Isoptericola sediminis sp. nov. is proposed. Type strain is JC619T (=KCTC 49244T =NBRC 114063T).

中文翻译:

Isoptericola sediminis sp. 十一月,与奇利卡泻湖隔离

从印度 Chilika 泻湖的沉积物中分离出一种黄色、革兰氏染色阳性、杆状、非运动性细菌,命名为 JC619T 菌株。菌株 JC619T 显示出最高的 16S rRNA 基因序列相似性 (99.08%) 与 Isoptericola chiayiensis KCTC 19740T 其次是 Isoptericola halotolerans KCTC 19046T (98.6%) 和 Isoptericola 属的其他成员 (< 98%)。菌株 JC619T 的生长需要 NaCl,可耐受高达 18% (w/v) 和高达 10 的 pH。菌株 JC619T 在温度 30 °C、NaCl 浓度为 3% (w/v) 和 pH 7.5 时生长最佳. JC619T 菌株的基因组大小为 3.2 Mb,G+C 含量为 73.0 mol%。JC619T 菌株的 ANI 得分分别为 81.9% 和 80.1%,dDDH 值分别为嘉义 I. chiayiensis KCTC 19740T 和 I. halotolerans KCTC 19046T 的 24.4% 和 22.7%。呼吸醌是 MK-9(H4) 和 MK-9(H2)。主要的脂肪酸 (> 10%) 是反异 C15:0、异 C16:0 和异 C15:0。JC619T 菌株的主要极性脂质是磷脂酰甘油、磷脂酰肌醇甘露糖苷、二磷脂酰甘油和磷脂酰肌醇。菌株 JC619T 为过氧化氢酶阳性但细胞色素氧化酶为阴性并减少硝酸盐。菌株 JC619T 与其最近的异翅目相关物种的基因组差异得到了化学分类学特征和差异生理特性的充分支持。因此,菌株 JC619T 代表 Isoptericola 属下的一个新物种,其中 Isoptericola sediminis sp。十一月 被提议。类型菌株是 JC619T (=KCTC 49244T =NBRC 114063T)。JC619T 菌株的主要极性脂质是磷脂酰甘油、磷脂酰肌醇甘露糖苷、二磷脂酰甘油和磷脂酰肌醇。菌株 JC619T 为过氧化氢酶阳性但细胞色素氧化酶为阴性并减少硝酸盐。菌株 JC619T 与其最近的异翅目相关物种的基因组差异得到了化学分类学特征和差异生理特性的充分支持。因此,菌株 JC619T 代表 Isoptericola 属下的一个新物种,其中 Isoptericola sediminis sp。十一月 被提议。类型菌株是 JC619T (=KCTC 49244T =NBRC 114063T)。JC619T 菌株的主要极性脂质是磷脂酰甘油、磷脂酰肌醇甘露糖苷、二磷脂酰甘油和磷脂酰肌醇。菌株 JC619T 为过氧化氢酶阳性但细胞色素氧化酶为阴性并减少硝酸盐。菌株 JC619T 与其最近的异翅目相关物种的基因组差异得到了化学分类学特征和差异生理特性的充分支持。因此,菌株 JC619T 代表 Isoptericola 属下的一个新物种,其中 Isoptericola sediminis sp。十一月 被提议。类型菌株是 JC619T (=KCTC 49244T =NBRC 114063T)。菌株 JC619T 与其最近的异翅目相关物种的基因组差异得到了化学分类学特征和差异生理特性的充分支持。因此,菌株 JC619T 代表了 Isoptericola 属下的一个新物种,Isoptericola sediminis sp。十一月 被提议。类型菌株是 JC619T (=KCTC 49244T =NBRC 114063T)。菌株 JC619T 与其最近的异翅目相关物种的基因组差异得到了化学分类学特征和差异生理特性的充分支持。因此,菌株 JC619T 代表 Isoptericola 属下的一个新物种,其中 Isoptericola sediminis sp。十一月 被提议。类型菌株是 JC619T (=KCTC 49244T =NBRC 114063T)。
更新日期:2021-01-21
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