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Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa in Chronic Lung Infection: Current Resistance Profile and Hypermutability in Patients with Cystic Fibrosis
Current Microbiology ( IF 2.6 ) Pub Date : 2021-01-06 , DOI: 10.1007/s00284-020-02337-0
Mila M. Almeida , Meyvianne T. Freitas , Tania W. Folescu , Monica C. Firmida , Ana Paula D’A. Carvalho-Assef , Elizabeth A. Marques , Robson S. Leão

Pseudomonas aeruginosa is associated with chronic and progressive lung disease and is closely related to increased morbidity and mortality in cystic fibrosis (CF) patients. Hypermutable (HPM) P. aeruginosa isolates have been described in these patients and are usually associated with antibiotic resistance. This study aimed to investigate the occurrence of carbapenem resistance and hypermutable phenotype in 179 P. aeruginosa isolates from 8 chronically CF patients assisted at two reference centers in Rio de Janeiro, Brazil. Using disk diffusion test, non-susceptible (NS) rates higher than 40% were observed for imipenem, amikacin, and gentamicin. A total of 79 isolates (44.1%), 71 (39.6%), and 8 (4.4%) were classified as carbapenem-resistant (CR resistance to at least one carbapenem), multidrug-resistant (MDR), and extensively drug-resistant (XDR), respectively. Minimal inhibitory concentration was determined for 79 CR P. aeruginosa and showed the following variations: 4 and 128 μg/mL to imipenem, 4 and 64 µg/mL to meropenem, and 4 and ≥ 32 µg/mL to doripenem. We have found only four (2.23%) HPM isolates from 4 patients. Analyzing the genetic relationship among the HPM isolates, 3 pulsed-field gel electrophoresis/pulsotypes (D, M, and J) were observed. Only M pulsotype was recovered from two patients in different years. Polymerase chain reaction screening for blaGES, blaIMP, blaKPC, blaNDM, blaOXA-48, blaSPM, and blaVIM genes was performed for all CR isolates and none of them were positive. Our results demonstrate a high occurrence of CR and MDR P. aeruginosa of CF patients follow-up in both centers studied, while the presence of HPM is still unusual.

中文翻译:

慢性肺感染中耐碳青霉烯的铜绿假单胞菌:囊性纤维化患者的当前耐药情况和高变异性

铜绿假单胞菌与慢性和进行性肺病有关,并且与囊性纤维化 (CF) 患者的发病率和死亡率增加密切相关。已经在这些患者中描述了高变异 (HPM) 铜绿假单胞菌分离株,并且通常与抗生素耐药性有关。本研究旨在调查来自巴西里约热内卢两个参考中心的 8 名慢性 CF 患者的 179 株铜绿假单胞菌分离株中碳青霉烯类耐药性和高变表型的发生情况。使用磁盘扩散试验,亚胺培南、阿米卡星和庆大霉素的非敏感 (NS) 率高于 40%。共有 79 个分离株 (44.1%)、71 个 (39.6%) 和 8 个 (4.4%) 被归类为耐碳青霉烯(至少对一种碳青霉烯耐药)、多重耐药 (MDR) 和广泛耐药(XDR), 分别。确定了 79 CR 铜绿假单胞菌的最小抑制浓度,并显示出以下变化:亚胺培南为 4 和 128 µg/mL,美罗培南为 4 和 64 µg/mL,多利培南为 4 和 ≥ 32 µg/mL。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。确定了 79 CR 铜绿假单胞菌的最小抑制浓度,并显示出以下变化:亚胺培南为 4 和 128 µg/mL,美罗培南为 4 和 64 µg/mL,多利培南为 4 和 ≥ 32 µg/mL。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。确定了 79 CR 铜绿假单胞菌的最小抑制浓度,并显示出以下变化:亚胺培南为 4 和 128 µg/mL,美罗培南为 4 和 64 µg/mL,多利培南为 4 和 ≥ 32 µg/mL。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。铜绿假单胞菌并表现出以下变化:亚胺培南为 4 和 128 µg/mL,美罗培南为 4 和 64 µg/mL,多利培南为 4 和 ≥ 32 µg/mL。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。铜绿假单胞菌并显示出以下变化:亚胺培南为 4 和 128 µg/mL,美罗培南为 4 和 64 µg/mL,多利培南为 4 和 ≥ 32 µg/mL。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。和 4 且 ≥ 32 µg/mL 至多利培南。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。和 4 且 ≥ 32 µg/mL 至多利培南。我们仅从 4 名患者中发现了 4 个 (2.23%) HPM 分离株。分析 HPM 分离株之间的遗传关系,观察到 3 种脉冲场凝胶电泳/脉冲型(D、M 和 J)。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。不同年份的两名患者仅发现 M 型脉搏。对所有 CR 分离株进行了 blaGES、blaIMP、blaKPC、blaNDM、blaOXA-48、blaSPM 和 blaVIM 基因的聚合酶链反应筛选,均未呈阳性。我们的结果表明,在两个研究中心的 CF 患者随访中,CR 和 MDR 铜绿假单胞菌的发生率很高,而 HPM 的存在仍然不常见。
更新日期:2021-01-06
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