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The association between serine hydroxymethyl transferase 1 gene hypermethylation and ischemic stroke.
Biomolecules and Biomedicine ( IF 3.4 ) Pub Date : 2020-11-30 , DOI: 10.17305/bjbms.2020.5188
Junnan Wang 1 , Junqing Gu 2 , Yi Huang 3 , Yuanjian Fang 4 , Jinhui Lin 3
Affiliation  

This study aimed to determine the correlation between serine hydroxymethyl transferase 1 (SHMT1) gene methylation and ischemic stroke. A total of 202 age- and sex-matched individuals were included. Quantitative methylation-specific polymerase chain reaction (qMSP-PCR) was used to analyze the DNA methylation level. The plasma homocysteine (Hcy) concentration was much higher in ischemic cases than in controls (p = 0.009), while the HDL levels in stroke cases were considerably lower than in controls (p = 0.005). A significantly higher level of SHMT1 methylation was observed in the ischemic strokes (58.82 ± 17.83 %) compared to that in the controls (42.59 ± 20.76 %, p < 0.001). The SHMT1 methylation level was strongly correlated with HDL concentration in the healthy controls (r = 0.517, p < 0.001), while the high plasma level of Hcy showed strong association with SHMT1 methylation in ischemic strokes (r = 0.346, p < 0.001). Receiver operating characteristic (ROC) analysis of curve indicated that SHMT1 methylation have been an acceptable indicator for ischemic stroke in female patients [all sexes, area under the curve (AUC) = 0.71, p < 0.001; male patients AUC = 0.62, p = 0.032; and female patients AUC = 0.79, p < 0.001] and in all ages (AUC = 0.71, p < 0.001). In our samples, DNA methylation levels of the STHMI gene were significantly correlated with ischemic stroke in Han Chinese. STHMI hypermethylation was significantly associated with the high Hcy concentration in ischemic stroke and had value as a potential indicator for female ischemic stroke.

中文翻译:

丝氨酸羟甲基转移酶 1 基因高甲基化与缺血性卒中的关系。

本研究旨在确定丝氨酸羟甲基转移酶 1 (SHMT1) 基因甲基化与缺血性中风之间的相关性。总共包括 202 名年龄和性别匹配的个体。定量甲基化特异性聚合酶链反应 (qMSP-PCR) 用于分析 DNA 甲基化水平。缺血病例的血浆同型半胱氨酸 (Hcy) 浓度远高于对照组 (p = 0.009),而中风病例的 HDL 水平远低于对照组 (p = 0.005)。与对照组 (42.59 ± 20.76 %, p < 0.001) 相比,在缺血性中风 (58.82 ± 17.83 %) 中观察到显着更高水平的 SHMT1 甲基化。SHMT1 甲基化水平与健康对照中的 HDL 浓度密切相关(r = 0.517,p < 0.001),而高血浆 Hcy 水平与缺血性卒中中的 SHMT1 甲基化密切相关(r = 0.346,p < 0.001)。曲线的受试者工作特征 (ROC) 分析表明 SHMT1 甲基化已成为女性患者缺血性卒中的可接受指标 [所有性别,曲线下面积 (AUC) = 0.71,p < 0.001;男性患者 AUC = 0.62,p = 0.032;和女性患者的 AUC = 0.79,p < 0.001] 和所有年龄段(AUC = 0.71,p < 0.001)。在我们的样本中,STHMI 基因的 DNA 甲基化水平与汉族缺血性中风显着相关。STHMI 高甲基化与缺血性卒中的高 Hcy 浓度显着相关,并且具有作为女性缺血性卒中的潜在指标的价值。曲线的受试者工作特征 (ROC) 分析表明 SHMT1 甲基化已成为女性患者缺血性卒中的可接受指标 [所有性别,曲线下面积 (AUC) = 0.71,p < 0.001;男性患者 AUC = 0.62,p = 0.032;和女性患者的 AUC = 0.79,p < 0.001] 和所有年龄段(AUC = 0.71,p < 0.001)。在我们的样本中,STHMI 基因的 DNA 甲基化水平与汉族缺血性中风显着相关。STHMI 高甲基化与缺血性卒中的高 Hcy 浓度显着相关,并且具有作为女性缺血性卒中的潜在指标的价值。曲线的受试者工作特征 (ROC) 分析表明 SHMT1 甲基化已成为女性患者缺血性卒中的可接受指标 [所有性别,曲线下面积 (AUC) = 0.71,p < 0.001;男性患者 AUC = 0.62,p = 0.032;和女性患者的 AUC = 0.79,p < 0.001] 和所有年龄段(AUC = 0.71,p < 0.001)。在我们的样本中,STHMI 基因的 DNA 甲基化水平与汉族缺血性中风显着相关。STHMI 高甲基化与缺血性卒中的高 Hcy 浓度显着相关,并且具有作为女性缺血性卒中的潜在指标的价值。p < 0.001;男性患者 AUC = 0.62,p = 0.032;和女性患者的 AUC = 0.79,p < 0.001] 和所有年龄段(AUC = 0.71,p < 0.001)。在我们的样本中,STHMI 基因的 DNA 甲基化水平与汉族缺血性中风显着相关。STHMI 高甲基化与缺血性卒中的高 Hcy 浓度显着相关,并且具有作为女性缺血性卒中的潜在指标的价值。p < 0.001;男性患者 AUC = 0.62,p = 0.032;和女性患者的 AUC = 0.79,p < 0.001] 和所有年龄段(AUC = 0.71,p < 0.001)。在我们的样本中,STHMI 基因的 DNA 甲基化水平与汉族缺血性中风显着相关。STHMI 高甲基化与缺血性卒中的高 Hcy 浓度显着相关,并且具有作为女性缺血性卒中的潜在指标的价值。
更新日期:2020-12-03
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