The Javan mongoose (Urva javanica) is a mesopredator native to Java island that has been rarely studied. The limited information raises questions as to its ecological roles, particularly in terms of its effects on agriculture and biodiversity. These questions are critical as its congeneric species, the small Indian mongoose, has been listed among the 100 worst invasive species. To disclose its ecological function, a new approach that is capable of revealing the diet of the Javan mongoose at the species level is required. We conducted this study to identify the prey species of the Javan mongoose using next-generation sequencing methodology. Our study was conducted in a forested area of the southern mountains of Java, Indonesia. We collected fecal samples during the dry season of March–October 2018, extracting DNA using a QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit. We performed Illumina sequencing using a 133 bp mini-barcode of the Cytochrome Oxidase I gene. Our rigorous analysis found 17 species, 14 genera, and 12 families of vertebrates and invertebrates in the mongoose feces. The greater bandicoot rat (Bandicota indica) and the domestic chicken (Gallus gallus) made up the primary diet of the Javan mongoose. Cricket, ant, moth, and fly species were also found in the feces. In effect, our results suggested that this species has a relatively diverse diet, one that includes mammals, birds, amphibians, snakes, fish, and many invertebrates. It confirms that the Javan mongoose has an opportunistic diet, which is most likely related to the availability of putative prey.

中文翻译：

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使用下一代测序从粪便样本中识别爪哇猫鼬 (Urva javanica) 的猎物

爪哇猫鼬（Urva javanica）是一种原产于爪哇岛的食肉动物，很少被研究。有限的信息对其生态作用提出了质疑，特别是在其对农业和生物多样性的影响方面。这些问题至关重要，因为它的同属物种印度小猫鼬已被列为 100 种最严重的入侵物种之一。为了揭示其生态功能，需要一种能够在物种水平上揭示爪哇猫鼬饮食的新方法。我们进行了这项研究，以使用下一代测序方法识别爪哇猫鼬的猎物种类。我们的研究是在印度尼西亚爪哇南部山区的森林地区进行的。我们在 2018 年 3 月至 10 月的旱季收集了粪便样本，使用 QIAamp Fast DNA Stool Mini Kit 提取 DNA。我们使用细胞色素氧化酶 I 基因的 133 bp 迷你条形码进行了 Illumina 测序。我们经过严格的分析，在猫鼬粪便中发现了脊椎动物和无脊椎动物 17 种、14 属、12 科。大袋狸鼠 (Bandicota indica) 和家鸡 (Gallus gallus) 是爪哇猫鼬的主要食物。粪便中还发现了蟋蟀、蚂蚁、飞蛾和苍蝇。实际上，我们的结果表明该物种的饮食相对多样化，其中包括哺乳动物、鸟类、两栖动物、蛇、鱼和许多无脊椎动物。它证实爪哇猫鼬具有机会主义饮食，这很可能与假定的猎物的可用性有关。我们使用细胞色素氧化酶 I 基因的 133 bp 迷你条形码进行了 Illumina 测序。我们经过严格的分析，在猫鼬粪便中发现了脊椎动物和无脊椎动物 17 种、14 属、12 科。大袋狸鼠 (Bandicota indica) 和家鸡 (Gallus gallus) 是爪哇猫鼬的主要食物。粪便中还发现了蟋蟀、蚂蚁、飞蛾和苍蝇。实际上，我们的结果表明该物种的饮食相对多样化，其中包括哺乳动物、鸟类、两栖动物、蛇、鱼和许多无脊椎动物。它证实爪哇猫鼬具有机会主义饮食，这很可能与假定的猎物的可用性有关。我们使用细胞色素氧化酶 I 基因的 133 bp 迷你条形码进行了 Illumina 测序。我们经过严格的分析，在猫鼬粪便中发现了脊椎动物和无脊椎动物 17 种、14 属、12 科。大袋狸鼠 (Bandicota indica) 和家鸡 (Gallus gallus) 是爪哇猫鼬的主要食物。粪便中还发现了蟋蟀、蚂蚁、飞蛾和苍蝇。实际上，我们的结果表明该物种的饮食相对多样化，其中包括哺乳动物、鸟类、两栖动物、蛇、鱼和许多无脊椎动物。它证实爪哇猫鼬具有机会主义饮食，这很可能与假定的猎物的可用性有关。大袋狸鼠 (Bandicota indica) 和家鸡 (Gallus gallus) 是爪哇猫鼬的主要食物。粪便中还发现了蟋蟀、蚂蚁、飞蛾和苍蝇。实际上，我们的结果表明该物种的饮食相对多样化，其中包括哺乳动物、鸟类、两栖动物、蛇、鱼和许多无脊椎动物。它证实爪哇猫鼬具有机会主义饮食，这很可能与假定的猎物的可用性有关。大袋狸鼠 (Bandicota indica) 和家鸡 (Gallus gallus) 是爪哇猫鼬的主要食物。粪便中还发现了蟋蟀、蚂蚁、飞蛾和苍蝇。实际上，我们的结果表明该物种的饮食相对多样化，其中包括哺乳动物、鸟类、两栖动物、蛇、鱼和许多无脊椎动物。它证实爪哇猫鼬具有机会主义饮食，这很可能与假定的猎物的可用性有关。