We present cognate base pair selectivity in template‐dependent ligation by T4 DNA ligase using a hydrophobic unnatural base pair (UBP), Ds‐Pa. T4 DNA ligase efficiently recognizes the Ds‐Pa pairing at the conjugation position, and Ds excludes the noncognate pairings with the natural bases. Our results indicate that the hydrophobic base pairing is allowed in enzymatic ligation with higher cognate base‐pair selectivity, relative to the hydrogen‐bond interactions between pairing bases. The efficient ligation using Ds‐Pa can be employed in recombinant DNA technology using genetic alphabet expansion, toward the creation of semi‐synthetic organisms containing UBPs.

中文翻译：

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T4 DNA 连接酶连接 DNA 中疏水性非天然碱基的同源碱基对选择性

我们使用疏水性非天然碱基对 (UBP) Ds-Pa 展示了 T4 DNA 连接酶在模板依赖性连接中的同源碱基对选择性。T4 DNA 连接酶有效识别缀合位置的 Ds-Pa 配对，并且 Ds 排除了与天然碱基的非同源配对。我们的结果表明，相对于配对碱基之间的氢键相互作用，酶促连接中允许疏水性碱基配对具有更高的同源碱基对选择性。使用 Ds-Pa 的有效连接可用于使用遗传字母扩展的重组 DNA 技术，以创建含有 UBP 的半合成生物。