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Limited genetic signal from potential cloning and selfing within wild populations of coral-eating crown-of-thorns seastars (Acanthaster cf. solaris)
Coral Reefs ( IF 3.5 ) Pub Date : 2020-10-28 , DOI: 10.1007/s00338-020-02022-5
Sven Uthicke , Morgan S. Pratchett , Vanessa Messmer , Hugo Harrison

Population outbreaks of crown-of-thorns seastars (CoTS; Acanthaster spp.) are contributing to extensive coral loss and reef degradation throughout the Indo-Pacific, but the causes and underlying mechanisms of population maintenance and outbreaks are equivocal. Two recent publications suggest that, in addition to outbreeding sexual reproduction, asexual reproduction through larval fission and selfing may contribute to rapid increases in the local abundance of Acanthaster spp. We re-analysed two large microsatellite datasets (collectively representing 3714 individuals) that investigated connectivity in the Great Barrier Reef and wider Pacific region to investigate if potential cloning or selfing can be evidenced in the population genetic structure. Within this dataset, we identified only a small number (18, < 0.5%) of putative clones (repeated multilocus genotypes). We argue that several of these are due to sampling and processing errors rather than direct evidence of cloning. Analysis of the population genetic structure (i.e. pairwise genetic differences between individuals, deviations from Hardy–Weinberg Equilibrium, and linkage disequilibrium) also yielded no genetic evidence for asexual reproduction. There was a tendency towards slight heterozygote deficits, so we cannot refute that selfing does occur, but observed patterns are most likely attributable to sampling artefacts. Although we cannot exclude that asexual reproduction occurs to some extent in Acanthaster populations, we find no evidence that these processes make a contribution to population structure or directly enhance larval supply.

中文翻译:

在吃珊瑚的棘冠海星(Acanthaster cf. solaris)的野生种群中,来自潜在克隆和自交的有限遗传信号

棘冠海星(CoTS;Acanthaster spp.)的种群爆发正在导致整个印度-太平洋地区的珊瑚大量流失和珊瑚礁退化,但种群维持和爆发的原因和潜在机制尚不清楚。最近的两份出版物表明,除了远交有性繁殖外,通过幼虫裂变和自交进行的无性繁殖可能有助于 Acanthaster spp 的当地丰度迅速增加。我们重新分析了两个大型微卫星数据集(总共代表 3714 个人),这些数据集调查了大堡礁和更广泛的太平洋地区的连通性,以调查是否可以在种群遗传结构中证明潜在的克隆或自交。在这个数据集中,我们只确定了一小部分 (18, < 0. 5%) 的推定克隆(重复多位点基因型)。我们认为其中一些是由于采样和处理错误而不是克隆的直接证据。对种群遗传结构的分析(即个体之间的成对遗传差异、Hardy-Weinberg 平衡的偏差和连锁不平衡)也没有产生无性繁殖的遗传证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。我们认为其中一些是由于采样和处理错误而不是克隆的直接证据。对种群遗传结构的分析(即个体之间的成对遗传差异、Hardy-Weinberg 平衡的偏差和连锁不平衡)也没有产生无性繁殖的遗传证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。我们认为其中一些是由于采样和处理错误而不是克隆的直接证据。对种群遗传结构的分析(即个体之间的成对遗传差异、Hardy-Weinberg 平衡的偏差和连锁不平衡)也没有产生无性繁殖的遗传证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。对种群遗传结构的分析(即个体之间的成对遗传差异、Hardy-Weinberg 平衡的偏差和连锁不平衡)也没有产生无性繁殖的遗传证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。对种群遗传结构的分析(即个体之间的成对遗传差异、Hardy-Weinberg 平衡的偏差和连锁不平衡)也没有产生无性繁殖的遗传证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。有轻微杂合子缺陷的趋势,所以我们不能反驳自交确实发生,但观察到的模式很可能归因于采样人工制品。虽然我们不能排除 Acanthaster 种群在某种程度上发生无性繁殖,但我们没有发现这些过程对种群结构做出贡献或直接增加幼虫供应的证据。
更新日期:2020-10-28
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