HIV-1 genetic diversity and drug resistance mutations (DRMs) remain a public health concern mainly in low- and middle-income countries. In this review, we estimated the HIV-1 molecular evolution over the past 40 years (1980-2019) in Angola to help guide affordable strategies for HIV-1 epidemic surveillance. We searched for studies written in English or Portuguese on HIV-1 diversity and DRMs carried out in Angola and published between 1980 and 2019. This review yielded eight studies describing a total of 493 samples. No HIV-1 Group N, O, and P were identified, whereas a ll non-B subtypes f rom Group M were identified. About 66% of HIV-1 subtypes were pure subtype and 34% recombinant strains. The frequency of recombinant strains increases from 1980 to 2019 (23.6%-41.4%, p<0.001). The subtypes C, F1, CRF02_AG, and the recombinant U/H were the most frequent. One DRM in the PIs was found (I54 M), 22 in the nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs), and 18 in the non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs). The major DRM in the NRTIs was the M184V, whereas the G190A, K103N, and Y181C were the major DRMs in the NNRTIs. Over the past 40 years, the frequency of the DRM M184V (50-64.3%, p=0.363), G190A (17.2-46.2%, p=0.021), and K103N (34.5-42.3%, p=0.551) increased, while the frequency of Y181C (17.2-7.7%, p=0.289) decreased. The current review shows an increase in HIV-1 genetic complexity and DRMs in Angola. Our findings suggest the need to include PIs or integrase strand transfer inhibitors in the first-line antiretroviral therapy regimens in Angola.

中文翻译：

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安哥拉 HIV 基因多样性和耐药性突变的临床和公共卫生影响：系统评价。

HIV-1 遗传多样性和耐药性突变 (DRM) 仍然是主要在低收入和中等收入国家的公共卫生问题。在这篇综述中，我们估计了安哥拉过去 40 年（1980-2019 年）的 HIV-1 分子进化，以帮助指导负担得起的 HIV-1 流行病监测策略。我们检索了在 1980 年至 2019 年间在安哥拉开展并发表的关于 HIV-1 多样性和 DRM 的英语或葡萄牙语研究。该综述产生了八项研究，共描述了 493 个样本。未鉴定出 HIV-1 组 N、O 和 P，而鉴定出来自 M 组的所有非 B 亚型。大约 66% 的 HIV-1 亚型是纯亚型，34% 是重组株。重组菌株的频率从 1980 年到 2019 年增加（23.6%-41.4%，p<0.001）。亚型 C、F1、CRF02_AG、重组 U/H 最为常见。在 PI 中发现了 1 个 DRM (I54 M)，在核苷逆转录酶抑制剂 (NRTIs) 中发现了 22 个，在非核苷逆转录酶抑制剂 (NNRTIs) 中发现了 18 个。NRTI 中的主要 DRM 是 M184V，而 G190A、K103N 和 Y181C 是 NNRTI 中的主要 DRM。在过去的 40 年中，DRM M184V（50-64.3%，p=0.363）、G190A（17.2-46.2%，p=0.021）和 K103N（34.5-42.3%，p=0.551）的频率增加，而Y181C (17.2-7.7%, p=0.289) 的频率下降。目前的审查表明，安哥拉 HIV-1 遗传复杂性和 DRM 有所增加。我们的研究结果表明，需要在安哥拉的一线抗逆转录病毒治疗方案中加入 PI 或整合酶链转移抑制剂。在核苷逆转录酶抑制剂 (NRTIs) 中为 22，在非核苷逆转录酶抑制剂 (NNRTIs) 中为 18。NRTI 中的主要 DRM 是 M184V，而 G190A、K103N 和 Y181C 是 NNRTI 中的主要 DRM。在过去的 40 年中，DRM M184V（50-64.3%，p=0.363）、G190A（17.2-46.2%，p=0.021）和 K103N（34.5-42.3%，p=0.551）的频率增加，而Y181C (17.2-7.7%, p=0.289) 的频率下降。目前的审查表明，安哥拉 HIV-1 遗传复杂性和 DRM 有所增加。我们的研究结果表明，需要在安哥拉的一线抗逆转录病毒治疗方案中加入 PI 或整合酶链转移抑制剂。在核苷逆转录酶抑制剂 (NRTIs) 中为 22，在非核苷逆转录酶抑制剂 (NNRTIs) 中为 18。NRTI 中的主要 DRM 是 M184V，而 G190A、K103N 和 Y181C 是 NNRTI 中的主要 DRM。在过去的 40 年中，DRM M184V（50-64.3%，p=0.363）、G190A（17.2-46.2%，p=0.021）和 K103N（34.5-42.3%，p=0.551）的频率增加，而Y181C (17.2-7.7%, p=0.289) 的频率下降。目前的审查表明，安哥拉 HIV-1 遗传复杂性和 DRM 有所增加。我们的研究结果表明，需要在安哥拉的一线抗逆转录病毒治疗方案中加入 PI 或整合酶链转移抑制剂。和 Y181C 是 NNRTI 中的主要 DRM。在过去的 40 年中，DRM M184V（50-64.3%，p=0.363）、G190A（17.2-46.2%，p=0.021）和 K103N（34.5-42.3%，p=0.551）的频率增加，而Y181C (17.2-7.7%, p=0.289) 的频率下降。目前的审查表明，安哥拉 HIV-1 遗传复杂性和 DRM 有所增加。我们的研究结果表明，需要在安哥拉的一线抗逆转录病毒治疗方案中加入 PI 或整合酶链转移抑制剂。和 Y181C 是 NNRTI 中的主要 DRM。在过去的 40 年中，DRM M184V（50-64.3%，p=0.363）、G190A（17.2-46.2%，p=0.021）和 K103N（34.5-42.3%，p=0.551）的频率增加，而Y181C (17.2-7.7%, p=0.289) 的频率下降。目前的审查表明，安哥拉 HIV-1 遗传复杂性和 DRM 有所增加。我们的研究结果表明，需要在安哥拉的一线抗逆转录病毒治疗方案中加入 PI 或整合酶链转移抑制剂。