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Genome-wide association analysis of pro-inflammatory cytokines and gene-lifestyle interaction for invasive breast cancer risk: the WHI dbGaP Study
Cancer Prevention Research ( IF 3.3 ) Pub Date : 2020-09-14 , DOI: 10.1158/1940-6207.capr-20-0256 Su Yon Jung 1 , Peter A Scott 2 , Jeanette C Papp 3 , Eric M Sobel 3, 4 , Matteo Pellegrini 5 , Herbert Yu 6 , Sihao Han 7 , Zuo-Feng Zhang 7, 8
Cancer Prevention Research ( IF 3.3 ) Pub Date : 2020-09-14 , DOI: 10.1158/1940-6207.capr-20-0256 Su Yon Jung 1 , Peter A Scott 2 , Jeanette C Papp 3 , Eric M Sobel 3, 4 , Matteo Pellegrini 5 , Herbert Yu 6 , Sihao Han 7 , Zuo-Feng Zhang 7, 8
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The top GWA-SNPs associated with pro-inflammatory biomarkers have implications for breast carcinogenesis by interacting with obesity factors. Our findings may suggest interventions for women who carry the inflammatory-risk genotypes to reduce breast cancer risk. Immune-related etiologic pathways to influence invasive breast cancer risk may interact with lifestyle factors, but the interrelated molecular genetic pathways are incompletely characterized. We used data from the Women's Health Initiative Database for Genotypes and Phenotypes Study including 16,088 postmenopausal women, a population highly susceptible to inflammation, obesity, and increased risk for breast cancer. With 21,784,812 common autosomal single-nucleotide polymorphisms (SNP), we conducted a genome-wide association (GWA) gene–environment interaction (G × E) analysis in six independent GWA Studies for proinflammatory cytokines [IL6 and C-reactive protein (CRP)] and their gene–lifestyle interactions. Subsequently, we tested for the association of the GWA SNPs with breast cancer risk. In women overall and stratified by obesity status (body mass index, waist circumference, and waist-to-hip ratio) and obesity-related lifestyle factors (exercise and high-fat diet), 88 GWA SNPs in 10 loci were associated with proinflammatory cytokines: 3 associated with IL6 (1 index SNP in MAPK1 and 1 independent SNP in DEC1); 85 with CRP (3 index SNPs in CRPP1, CRP, RP11–419N10.5, HNF1A-AS1, HNF1A, and C1q2orf43; and two independent SNPs in APOE and APOC1). Of those, 27 in HNF1A-AS1, HNF1A, and C1q2orf43 displayed significantly increased risk for breast cancer. We found a number of novel top markers for CRP and IL6, which interacted with obesity factors. A substantial proportion of those SNPs' susceptibility influenced breast cancer risk. Our findings may contribute to better understanding of genetic associations between pro-inflammation and cancer and suggest intervention strategies for women who carry the risk genotypes, reducing breast cancer risk. Prevention Relevance: The top GWA-SNPs associated with pro-inflammatory biomarkers have implications for breast carcinogenesis by interacting with obesity factors. Our findings may suggest interventions for women who carry the inflammatory-risk genotypes to reduce breast cancer risk.
中文翻译:
促炎细胞因子和基因生活方式相互作用对浸润性乳腺癌风险的全基因组关联分析:WHI dbGaP 研究
与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。影响浸润性乳腺癌风险的免疫相关病因途径可能与生活方式因素相互作用,但相互关联的分子遗传途径尚未完全表征。我们使用了来自女性健康倡议数据库的基因型和表型研究数据,其中包括 16,088 名绝经后女性,这些女性对炎症、肥胖和乳腺癌风险增加高度敏感。具有 21,784,812 个常见的常染色体单核苷酸多态性 (SNP),我们在六项独立的 GWA 研究中对促炎细胞因子 [IL6 和 C 反应蛋白 (CRP)] 及其基因-生活方式相互作用进行了全基因组关联 (GWA) 基因-环境相互作用 (G × E) 分析。随后,我们测试了 GWA SNP 与乳腺癌风险的关联。在按肥胖状态(体重指数、腰围和腰臀比)和肥胖相关生活方式因素(运动和高脂饮食)分层的女性中,10 个位点的 88 个 GWA SNP 与促炎细胞因子相关:3 个与 IL6 相关(MAPK1 中的 1 个索引 SNP 和 DEC1 中的 1 个独立 SNP);85 个具有 CRP(CRPP1、CRP、RP11-419N10.5、HNF1A-AS1、HNF1A 和 C1q2orf43 中的 3 个索引 SNP;以及 APOE 和 APOC1 中的两个独立 SNP)。其中,27 个在 HNF1A-AS1、HNF1A、和 C1q2orf43 显示出显着增加患乳腺癌的风险。我们发现了许多新的 CRP 和 IL6 顶级标志物,它们与肥胖因素相互作用。这些 SNP 的大部分易感性影响了乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。与肥胖因素相互作用。这些 SNP 的大部分易感性影响了乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。与肥胖因素相互作用。这些 SNP 的大部分易感性影响了乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。
更新日期:2020-09-14
中文翻译:
促炎细胞因子和基因生活方式相互作用对浸润性乳腺癌风险的全基因组关联分析:WHI dbGaP 研究
与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。影响浸润性乳腺癌风险的免疫相关病因途径可能与生活方式因素相互作用,但相互关联的分子遗传途径尚未完全表征。我们使用了来自女性健康倡议数据库的基因型和表型研究数据,其中包括 16,088 名绝经后女性,这些女性对炎症、肥胖和乳腺癌风险增加高度敏感。具有 21,784,812 个常见的常染色体单核苷酸多态性 (SNP),我们在六项独立的 GWA 研究中对促炎细胞因子 [IL6 和 C 反应蛋白 (CRP)] 及其基因-生活方式相互作用进行了全基因组关联 (GWA) 基因-环境相互作用 (G × E) 分析。随后,我们测试了 GWA SNP 与乳腺癌风险的关联。在按肥胖状态(体重指数、腰围和腰臀比)和肥胖相关生活方式因素(运动和高脂饮食)分层的女性中,10 个位点的 88 个 GWA SNP 与促炎细胞因子相关:3 个与 IL6 相关(MAPK1 中的 1 个索引 SNP 和 DEC1 中的 1 个独立 SNP);85 个具有 CRP(CRPP1、CRP、RP11-419N10.5、HNF1A-AS1、HNF1A 和 C1q2orf43 中的 3 个索引 SNP;以及 APOE 和 APOC1 中的两个独立 SNP)。其中,27 个在 HNF1A-AS1、HNF1A、和 C1q2orf43 显示出显着增加患乳腺癌的风险。我们发现了许多新的 CRP 和 IL6 顶级标志物,它们与肥胖因素相互作用。这些 SNP 的大部分易感性影响了乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。与肥胖因素相互作用。这些 SNP 的大部分易感性影响了乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。与肥胖因素相互作用。这些 SNP 的大部分易感性影响了乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。我们的研究结果可能有助于更好地了解促炎症与癌症之间的遗传关联,并为携带风险基因型的女性提出干预策略,从而降低乳腺癌风险。预防相关性:与促炎生物标志物相关的顶级 GWA-SNP 通过与肥胖因素相互作用而对乳腺癌发生产生影响。我们的研究结果可能建议对携带炎症风险基因型的女性进行干预,以降低患乳腺癌的风险。