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RNA-Seq reveals placental growth factor regulates the human retinal endothelial cell barrier integrity by transforming growth factor (TGF-β) signaling.
Molecular and Cellular Biochemistry ( IF 4.3 ) Pub Date : 2020-08-19 , DOI: 10.1007/s11010-020-03862-z
Hu Huang 1 , Madhu Sudhana Saddala 1 , Anton Lennikov 1 , Anthony Mukwaya 2 , Lijuan Fan 1
Affiliation  

Placental growth factor (PlGF or PGF) is a member of the VEGF (vascular endothelial growth factor) family. It plays a pathological role in inflammation, vascular permeability, and pathological angiogenesis. The molecular signaling by which PlGF mediates its effects in non-proliferative diabetic retinopathy (DR) remains elusive. This study aims to characterize the transcriptome changes of human retinal endothelial cells (HRECs) with the presence and the absence of PlGF signaling. Primary HRECs were treated with the PlGF antibody (ab) to block its activity. The total RNA was isolated and subjected to deep sequencing to quantify the transcripts and their changes in both groups. We performed transcriptome-wide analysis, gene ontology, pathway enrichment, and gene–gene network analyses. The results showed that a total of 3760 genes were significantly differentially expressed and were categorized into cell adhesion molecules, cell junction proteins, chaperone, calcium-binding proteins, and membrane traffic proteins. Functional pathway analyses revealed that the TGF-β pathway, pentose phosphate pathway, and cell adhesion pathway play pivotal roles in the blood-retina barrier and antioxidant defense system. Collectively, the data provide new insights into the molecular mechanisms of PlGF’s biological functions in HRECs relevant to DR and diabetic macular edema (DME). The newly identified genes and pathways may act as disease markers and target molecules for therapeutic interventions for the patients with DR and DME refractory to the current anti-VEGF therapy.



中文翻译:

RNA-Seq 揭示胎盘生长因子通过转化生长因子 (TGF-β) 信号传导调节人视网膜内皮细胞屏障的完整性。

胎盘生长因子(PlGF 或 PGF)是 VEGF(血管内皮生长因子)家族的成员。它在炎症、血管通透性和病理性血管生成中起病理作用。PlGF 介导其在非增殖性糖尿病视网膜病变 (DR) 中的作用的分子信号仍然难以捉摸。本研究旨在表征存在和不存在 PlGF 信号的人视网膜内皮细胞 (HRECs) 的转录组变化。用 PlGF 抗体 (ab) 处理初级 HREC 以阻断其活性。分离总 RNA 并进行深度测序,以量化两组的转录本及其变化。我们进行了全转录组分析、基因本体论、通路富集和基因-基因网络分析。结果表明,共有3760个基因显着差异表达,分为细胞粘附分子、细胞连接蛋白、分子伴侣、钙结合蛋白和膜运输蛋白。功能通路分析表明,TGF-β通路、磷酸戊糖通路和细胞粘附通路在血液-视网膜屏障和抗氧化防御系统中起关键作用。总的来说,这些数据为 PlGF 在与 DR 和糖尿病性黄斑水肿 (DME) 相关的 HREC 中的生物学功能的分子机制提供了新的见解。新发现的基因和通路可以作为疾病标志物和靶分子,用于对当前抗 VEGF 治疗无效的 DR 和 DME 患者进行治疗干预。细胞连接蛋白、分子伴侣、钙结合蛋白和膜运输蛋白。功能通路分析表明,TGF-β通路、磷酸戊糖通路和细胞粘附通路在血液-视网膜屏障和抗氧化防御系统中起关键作用。总的来说,这些数据为 PlGF 在与 DR 和糖尿病性黄斑水肿 (DME) 相关的 HREC 中的生物学功能的分子机制提供了新的见解。新发现的基因和通路可以作为疾病标志物和靶分子,用于对当前抗 VEGF 治疗无效的 DR 和 DME 患者进行治疗干预。细胞连接蛋白、分子伴侣、钙结合蛋白和膜运输蛋白。功能通路分析表明,TGF-β通路、磷酸戊糖通路和细胞粘附通路在血液-视网膜屏障和抗氧化防御系统中起关键作用。总的来说,这些数据为 PlGF 在与 DR 和糖尿病性黄斑水肿 (DME) 相关的 HREC 中的生物学功能的分子机制提供了新的见解。新发现的基因和通路可以作为疾病标志物和靶分子,用于对当前抗 VEGF 治疗无效的 DR 和 DME 患者进行治疗干预。和细胞粘附途径在血-视网膜屏障和抗氧化防御系统中起关键作用。总的来说,这些数据为 PlGF 在与 DR 和糖尿病性黄斑水肿 (DME) 相关的 HREC 中的生物学功能的分子机制提供了新的见解。新发现的基因和通路可以作为疾病标志物和靶分子,用于对当前抗 VEGF 治疗无效的 DR 和 DME 患者进行治疗干预。和细胞粘附途径在血-视网膜屏障和抗氧化防御系统中起关键作用。总的来说,这些数据为 PlGF 在与 DR 和糖尿病性黄斑水肿 (DME) 相关的 HREC 中的生物学功能的分子机制提供了新的见解。新发现的基因和通路可以作为疾病标志物和靶分子,用于对当前抗 VEGF 治疗无效的 DR 和 DME 患者进行治疗干预。

更新日期:2020-08-19
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