Fission yeast Erh1 exists in a complex with RNA-binding protein Mmi1. Deletion of erh1 upregulates the phosphate homeostasis gene pho1, which is normally repressed by transcription in cis of a 5' flanking prt lncRNA. Here we present evidence that de-repression of pho1 by erh1∆ is achieved through precocious 3'-processing/termination of prt lncRNA synthesis, to wit: (i) erh1∆ does not affect the activity of the prt or pho1 promoters per se; (ii) de-repression by erh1∆ depends on CPF (cleavage and polyadenylation factor) subunits Ctf1, Dis2, Ssu72, Swd22, and Ppn1 and on termination factor Rhn1; (iii) de-repression requires synthesis by the Asp1 IPP kinase of inositol 1-pyrophosphates (1-IPPs); (iv) de-repression is effaced by mutating Thr4 of the RNA polymerase II CTD to alanine; and (v) erh1∆ exerts an additive effect on pho1 de-repression in combination with mutating CTD Ser7 to alanine and with deletion of the IPP pyrophosphatase Aps1. These findings point to Erh1 as an antagonist of lncRNA termination in the prt-pho1 axis. By contrast, in mmi1∆ cells there is a reduction in pho1 mRNA and increase in the formation of a prt-pho1 read-through transcript, consistent with Mmi1 being an agonist of prt termination. We envision that Erh1 acts as a brake on Mmi1's ability to promote CPF-dependent termination during prt lncRNA synthesis. Consistent with this idea, erh1∆ de-repression of pho1 was eliminated by mutating the Mmi1-binding sites in the prt lncRNA.

中文翻译：

---

裂殖酵母 Erh1 的失活抑制 pho1 的表达：证据表明 Erh1 是 prt lncRNA 终止的负调节因子

裂殖酵母 Erh1 与 RNA 结合蛋白 Mmi1 存在于复合物中。erh1 的缺失上调了磷酸盐稳态基因 pho1，该基因通常被 5' 侧翼 prt lncRNA 的顺式转录所抑制。在这里，我们提供的证据表明，erh1Δ 对 pho1 的去抑制是通过早熟的 3'-加工/终止 prt lncRNA 合成实现的，也就是说：（i）erh1Δ 不影响 prt 或 pho1 启动子本身的活性；(ii) erh1∆ 的去抑制取决于 CPF（切割和聚腺苷酸化因子）亚基 Ctf1、Dis2、Ssu72、Swd22 和 Ppn1 以及终止因子 Rhn1；(iii) 去抑制需要通过 Asp1 IPP 激酶合成 1-焦磷酸肌醇 (1-IPP)；(iv) 通过将 RNA 聚合酶 II CTD 的 Thr4 突变为丙氨酸来消除去抑制；(v) erh1Δ 与 CTD Ser7 突变为丙氨酸和 IPP 焦磷酸酶 Aps1 缺失相结合，对 pho1 去抑制产生累加效应。这些发现表明 Erh1 是 prt-pho1 轴中 lncRNA 终止的拮抗剂。相比之下，在 mmi1Δ 细胞中，pho1 mRNA 减少，prt-pho1 通读转录本的形成增加，与 Mmi1 是 prt 终止的激动剂一致。我们设想 Erh1 在 prt lncRNA 合成过程中对 Mmi1 促进 CPF 依赖性终止的能力起到制动作用。与这个想法一致，通过突变 prt lncRNA 中的 Mmi1 结合位点，消除了 pho1 的 erh1∆ 去抑制。这些发现表明 Erh1 是 prt-pho1 轴中 lncRNA 终止的拮抗剂。相比之下，在 mmi1Δ 细胞中，pho1 mRNA 减少，prt-pho1 通读转录本的形成增加，与 Mmi1 是 prt 终止的激动剂一致。我们设想 Erh1 在 prt lncRNA 合成过程中对 Mmi1 促进 CPF 依赖性终止的能力起到制动作用。与这个想法一致，通过突变 prt lncRNA 中的 Mmi1 结合位点，消除了 pho1 的 erh1∆ 去抑制。这些发现表明 Erh1 是 prt-pho1 轴中 lncRNA 终止的拮抗剂。相比之下，在 mmi1Δ 细胞中，pho1 mRNA 减少，prt-pho1 通读转录本的形成增加，与 Mmi1 是 prt 终止的激动剂一致。我们设想 Erh1 在 prt lncRNA 合成过程中对 Mmi1 促进 CPF 依赖性终止的能力起到制动作用。与这个想法一致，通过突变 prt lncRNA 中的 Mmi1 结合位点，消除了 pho1 的 erh1∆ 去抑制。在 prt lncRNA 合成过程中促进 CPF 依赖性终止的能力。与这个想法一致，通过突变 prt lncRNA 中的 Mmi1 结合位点，消除了 pho1 的 erh1∆ 去抑制。在 prt lncRNA 合成过程中促进 CPF 依赖性终止的能力。与这个想法一致，通过突变 prt lncRNA 中的 Mmi1 结合位点，消除了 pho1 的 erh1∆ 去抑制。