Meat quality of Iberian pigs is defined by the combination of their genetic characteristics and the particular production system. To carry out a genetic analysis of the main meat quality traits, we estimated their heritabilities, genetic correlations and the association effects of 32 selected SNPs of 12 candidate genes. A total of ten traits were measured in longissimus dorsi samples from 1,199 Iberian pigs fattened in the traditional free-range system: water holding capacity (thawing, cooking and centrifuge force water losses), instrumental colour (lightness L*, redness a* and yellowness b*), myoglobin content, shear force on cooked meat, and shear force and maximum compression force on dry-cured loin. Estimated heritability values were low to moderate (0.01 to 0.43) being the lowest for L* and the highest for cooking loss. Strong genetic correlations between water holding capacity traits (0.93 to 0.96) and between myoglobin content and a* (0.94) were observed. The association analyses revealed 19 SNPs significantly associated with different traits. Consistent and strong effects were observed between PRKAG3 SNPs (rs319678464G > C and rs330427832C > T), MYH3_rs81437544T > C, CASP3_rs319658214G > T and CTSL_rs332171512A > G and water losses. Also for CAPN1_rs81358667G > A and CASP3_rs319658214G > T and shear force. The SNPs mapping on PRKAG3 showed the highest effects on Minolta colour traits. Genotyping of these SNPs could be useful for the selection of Iberian young boars with similar estimated breeding values for productive traits.

中文翻译：

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露天散养伊比利亚猪肉质性状的遗传参数估计和基因关联分析

伊比利亚猪的肉质由其遗传特征和特定生产系统的组合决定。为了对主要肉质性状进行遗传分析，我们估计了它们的遗传力、遗传相关性以及 12 个候选基因的 32 个选定 SNP 的关联效应。在传统自由放养系统中饲养的 1,199 头伊比利亚猪的背最长肌样本中，总共测量了 10 个性状：保水能力（解冻、烹饪和离心力失水）、仪器颜色（亮度 L*、红色 a* 和黄色b*)、肌红蛋白含量、熟肉的剪切力以及干腌腰肉的剪切力和最大压缩力。估计的遗传力值从低到中等（0.01 到 0.43），L* 最低，烹饪损失最高。观察到持水能力性状（0.93 至 0.96）之间以及肌红蛋白含量与 a* (0.94) 之间的强遗传相关性。关联分析显示 19 个 SNP 与不同的性状显着相关。在 PRKAG3 SNP（rs319678464G > C 和 rs330427832C > T）、MYH3_rs81437544T > C、CASP3_rs319658214G > T 和 CTSL_rs332171512A 之间观察到一致且强烈的影响。也适用于 CAPN1_rs81358667G > A 和 CASP3_rs319658214G > T 和剪切力。PRKAG3 上的 SNP 映射显示对 Minolta 颜色性状的影响最大。这些 SNP 的基因分型可用于选择具有相似的生产性状估计育种值的伊比利亚幼猪。关联分析显示 19 个 SNP 与不同的性状显着相关。在 PRKAG3 SNP（rs319678464G > C 和 rs330427832C > T）、MYH3_rs81437544T > C、CASP3_rs319658214G > T 和 CTSL_rs332171512A 之间观察到一致且强烈的影响。也适用于 CAPN1_rs81358667G > A 和 CASP3_rs319658214G > T 和剪切力。PRKAG3 上的 SNP 映射显示对 Minolta 颜色性状的影响最大。这些 SNP 的基因分型可用于选择具有相似的生产性状估计育种值的伊比利亚幼猪。关联分析显示 19 个 SNP 与不同的性状显着相关。在 PRKAG3 SNP（rs319678464G > C 和 rs330427832C > T）、MYH3_rs81437544T > C、CASP3_rs319658214G > T 和 CTSL_rs332171512A 之间观察到一致且强烈的影响。也适用于 CAPN1_rs81358667G > A 和 CASP3_rs319658214G > T 和剪切力。PRKAG3 上的 SNP 映射显示对 Minolta 颜色性状的影响最大。这些 SNP 的基因分型可用于选择具有相似的生产性状估计育种值的伊比利亚幼猪。T 和 CTSL_rs332171512A > G 和水损失。也适用于 CAPN1_rs81358667G > A 和 CASP3_rs319658214G > T 和剪切力。PRKAG3 上的 SNP 映射显示对 Minolta 颜色性状的影响最大。这些 SNP 的基因分型可用于选择具有相似的生产性状估计育种值的伊比利亚幼猪。T 和 CTSL_rs332171512A > G 和水损失。也适用于 CAPN1_rs81358667G > A 和 CASP3_rs319658214G > T 和剪切力。PRKAG3 上的 SNP 映射显示对 Minolta 颜色性状的影响最大。这些 SNP 的基因分型可用于选择具有相似的生产性状估计育种值的伊比利亚幼猪。