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Fungal Diversity in Deep Sea Sediments from East Yap Trench and Their Denitrification Potential
Geomicrobiology Journal ( IF 2.3 ) Pub Date : 2020-07-23 , DOI: 10.1080/01490451.2020.1789778
Yuanhao Gao 1 , Xiaona Du 2 , Wei Xu 1 , Rui Fan 1 , Xinxu Zhang 3 , Shuai Yang 1 , Xiaoyao Chen 4 , Jie Lv 1, 2 , Zhuhua Luo 1, 5, 6
Affiliation  

Abstract In recent years, the hadal trenches have been recognized as biological hot spots for deep sea researchers. Due to high hydrostatic pressure, low temperatures, high salinity and low nutrients, the microorganisms in hadal trenches may have unique community structure with potential for biotechnical application. Compared with bacteria and archaea, the diversity and ecological roles of fungi in hadal trenches remain largely unknown. The purpose of this study was to explore fungal diversity in deep-sea sediments of the Yap trench and their denitrification potential. In the present study, a total of 106 fungal strains were isolated from six sediment samples collected in the East Yap Trench. These fungi belonged to five classes (Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Sordariomycetes, Cystobasidiomycetes, and Microbotryomycetes), thirteen genera (Acremonium, Alternaria, Aureobasidium, Aspergillus, Cladosporium, Cystobasidium, Engyodontium, Gliomastix, Lecanicillium, Penicillium, Phoma, Rhodotorula and Trichoderma) and eighteen species, based on morphological identification and ITS-rDNA sequence analysis. Among them, the dominant genus is Cladosporium, which accounting for 42.45% of the total fungal strains. Meanwhile, the denitrification potential of the fungal strains was also examined with two different denitrifying media (nitrate and nitrite as sole substrate, respectively). Two fungal strains (Acremonium sp. and Aspergillus versicolor), were found to be able to produce N2O ex situ in the presence of nitrite. No fungus was found to produce N2O by using nitrate. Our results suggest that fungi in hadal sediments, play important roles in nitrogen cycles.

中文翻译:

东雅浦海沟深海沉积物中真菌多样性及其反硝化潜力

摘要 近年来,深海海沟被认为是深海研究人员的生物热点。由于高静水压、低温、高盐度和低营养,深海沟内的微生物可能具有独特的群落结构,具有生物技术应用的潜力。与细菌和古细菌相比,真菌在海沟中的多样性和生态作用在很大程度上仍然未知。本研究的目的是探索雅浦海沟深海沉积物中的真菌多样性及其反硝化潜力。在本研究中,从东雅浦海沟收集的六个沉积物样品中总共分离出 106 株真菌。这些真菌属于五个纲(Dothideomycetes、Eurotiomycetes、Sordariomycetes、Cystobasidiomycetes 和 Microbotryomycetes),基于形态学鉴定和 ITS-rDNA 序列分析,共 13 个属(顶孢属、链格孢属、Aureobasidium、曲霉属、枝孢霉属、Cystobasidium、Engyodontium、Gliomastix、Lecanicillium、Penicillium、Phoma、Rhodotorula 和 Trichoderma)和 18 个物种。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。基于形态学鉴定和 ITS-rDNA 序列分析的 Aureobasidium、Aspergillus、Cladosporium、Cystobasidium、Engyodontium、Gliomastix、Lecanicillium、Penicillium、Phoma、Rhodotorula 和 Trichoderma)和 18 个物种。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。基于形态学鉴定和 ITS-rDNA 序列分析的 Aureobasidium、Aspergillus、Cladosporium、Cystobasidium、Engyodontium、Gliomastix、Lecanicillium、Penicillium、Phoma、Rhodotorula 和 Trichoderma)和 18 个物种。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。Engyodontium、Gliomastix、Lecanicillium、Penicillium、Phoma、Rhodotorula 和 Trichoderma) 和 18 个物种,基于形态学鉴定和 ITS-rDNA 序列分析。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。Engyodontium、Gliomastix、Lecanicillium、Penicillium、Phoma、Rhodotorula 和 Trichoderma) 和 18 个物种,基于形态学鉴定和 ITS-rDNA 序列分析。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。基于形态学鉴定和ITS-rDNA序列分析。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。基于形态学鉴定和ITS-rDNA序列分析。其中,优势属为枝孢属,占真菌总菌株的42.45%。同时,还用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)检查了真菌菌株的反硝化潜力。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。真菌菌株的反硝化潜力也用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)进行了检查。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。真菌菌株的反硝化潜力也用两种不同的反硝化介质(硝酸盐和亚硝酸盐分别作为唯一底物)进行了检查。发现两种真菌菌株(Acremonium sp. 和 Aspergillus versicolor)能够在亚硝酸盐存在下异地生产 N2O。没有发现真菌使用硝酸盐产生 N2O。我们的研究结果表明,深海沉积物中的真菌在氮循环中起着重要作用。
更新日期:2020-07-23
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