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Target recognition and network pharmacology for revealing anti-diabetes mechanisms of natural product
Journal of Computational Science ( IF 3.3 ) Pub Date : 2020-07-12 , DOI: 10.1016/j.jocs.2020.101186
Ying Wang , Baichun Hu , Shasha Feng , Jian Wang , Fengjiao Zhang

Diabetes is a metabolic disease characterized by persistent hyperglycemia, which results in serious complications such as cardiovascular disorder, neuropathy, renal failure, and retinopathy. Various anti-diabetic drugs have been developed, however, their therapeutic effect is far from satisfactory. Therefore, increasing attention has been paid to natural products, whose multi-targets characteristics might contribute to treating polygenetic disease like diabetes. Indeed, valuable implications for anti-diabetic drug discovery can be obtained through exploring the molecular mechanism of these natural products, however, it could be a formidable task with traditional experimental approaches. As such, computational approaches are applied in predicting the compound-target interactions, including molecular docking, molecular dynamics (MD) simulations, and other computer aided drug design (CADD) methods. Furthermore, network pharmacology strategy is introduced for exploring natural products with anti-diabetic activities, including the general workflow of network pharmacology, its application in anti-diabetic traditional Chinese medicine formula research, and the application of natural products in diabetic complications. In particular, a promising prospective insight of combining computational methods and network pharmacology in anti-diabetic drug discovery is discussed. In summary, the combination of computational approaches and network pharmacology has already produced fruitful natural products with anti-diabetic effect, and will hopefully initiate novel anti-diabetic drug development with advanced therapeutic effect and less side effect.



中文翻译:

目标识别和网络药理学揭示天然产物的抗糖尿病机制

糖尿病是一种以持续性高血糖为特征的代谢疾病,会导致严重的并发症,例如心血管疾病,神经病,肾衰竭和视网膜病变。已经开发了各种抗糖尿病药,但是它们的治疗效果远不能令人满意。因此,人们越来越关注天然产物,其多目标特征可能有助于治疗糖尿病等多基因疾病。确实,可以通过探索这些天然产物的分子机制来获得抗糖尿病药物发现的宝贵启示,但是,使用传统的实验方法可能是一项艰巨的任务。因此,计算方法可用于预测化合物与目标的相互作用,包括分子对接,分子动力学(MD)模拟,和其他计算机辅助药物设计(CADD)方法。此外,还介绍了用于探索具有抗糖尿病活性的天然产物的网络药理策略,包括网络药理学的一般工作流程,其在抗糖尿病中药配方研究中的应用以及天然产物在糖尿病并发症中的应用。特别是,讨论了将计算方法和网络药理学相结合在抗糖尿病药物发现中的有希望的前瞻性见解。总之,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。此外,还介绍了用于探索具有抗糖尿病活性的天然产物的网络药理策略,包括网络药理学的一般工作流程,其在抗糖尿病中药配方研究中的应用以及天然产物在糖尿病并发症中的应用。特别是,讨论了将计算方法和网络药理学相结合在抗糖尿病药物发现中的有希望的前瞻性见解。总之,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。此外,还介绍了用于探索具有抗糖尿病活性的天然产物的网络药理策略,包括网络药理学的一般工作流程,其在抗糖尿病中药配方研究中的应用以及天然产物在糖尿病并发症中的应用。特别是,讨论了将计算方法和网络药理学相结合用于抗糖尿病药物发现的有前途的前瞻性见解。总之,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。包括网络药理学的一般工作流程,其在抗糖尿病中药配方研究中的应用以及天然产物在糖尿病并发症中的应用。特别是,讨论了将计算方法和网络药理学相结合用于抗糖尿病药物发现的有前途的前瞻性见解。综上所述,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。包括网络药理学的一般工作流程,其在抗糖尿病中药配方研究中的应用以及天然产物在糖尿病并发症中的应用。特别是,讨论了将计算方法和网络药理学相结合用于抗糖尿病药物发现的有前途的前瞻性见解。总之,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。讨论了将计算方法与网络药理学相结合在抗糖尿病药物发现中的有前途的前瞻性见解。总之,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。讨论了将计算方法与网络药理学相结合在抗糖尿病药物发现中的有前途的前瞻性见解。总之,计算方法和网络药理学的结合已经产生了具有抗糖尿病作用的丰富的天然产物,并有望启动具有先进治疗作用和较少副作用的新型抗糖尿病药物的开发。

更新日期:2020-07-12
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