Post-transcriptional modification of RNA (RNA editing, RNAe) results in differences between the RNA transcript and the genomic DNA sequence (RDD). Enzymatic modification of adenosine to inosine (A2I) by ADAR is the most studied type of RNAe. However, few genetic association studies with A2I RNAe events have been conducted. Some studies have analyzed the inter-population RNAe-QTL diversity in humans, but the sample size of these studies was limited. Other types of RNA and DNA differences have been reported but are largely understudied. Here, we report a comprehensive analysis of all types of RDD, based on two independent datasets. We found that A2I was by far the most observed type of RDD. Moreover, manual curation suggests that A2I is likely the only enzymatically driven RNAe type observed in blood derived DNA, all other non-A2I RDD could either be attributed to sequencing and processing artifacts, or are a result of somatic DNA rearrangements. We then conducted an in-cis genetic association study and identified 472 genetic associations (RNAe-QTL), that were replicated in both datasets. We confirm the potential effect of the RNAe-QTL on RNA structure by showing that allele specific RNAe occurs in heterozygotes. Although the generally assumed function of RNAe is to destabilize double stranded RNA structure, we found clear evidence for the potential additional involvement of RNAe in maintaining RNA hairpin that has been altered by the RNAe-QTL. Our study confirms, in two independent datasets, the potential role of RNAe in maintaining RNA structure in the presence of genetic variation.

RNA 的转录后修饰（RNA 编辑，RNAe）导致 RNA 转录物和基因组 DNA 序列 (RDD) 之间存在差异。通过 ADAR 将腺苷酶促修饰为肌苷 (A2I) 是研究最多的 RNAe 类型。然而，很少进行与 A2I RNAe 事件的遗传关联研究。一些研究分析了人类的种群间 RNAe-QTL 多样性，但这些研究的样本量有限。已经报道了其他类型的 RNA 和 DNA 差异，但在很大程度上没有得到充分研究。在这里，我们报告了基于两个独立数据集的所有类型 RDD 的综合分析。我们发现 A2I 是迄今为止观察最多的 RDD 类型。此外，人工管理表明 A2I 可能是在血液来源的 DNA 中观察到的唯一酶驱动的 RNAe 类型，所有其他非 A2I RDD 可能归因于测序和处理伪影，或者是体细胞 DNA 重排的结果。然后，我们进行了顺式遗传关联研究，并确定了 472 个遗传关联 (RNAe-QTL)，它们在两个数据集中复制。我们通过显示杂合子中出现等位基因特异性 RNAe 来证实 RNAe-QTL 对 RNA 结构的潜在影响。尽管通常认为 RNAe 的功能是破坏双链 RNA 结构的稳定性，但我们发现了明确的证据，表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。或者是体细胞 DNA 重排的结果。然后，我们进行了顺式遗传关联研究，并确定了 472 个遗传关联 (RNAe-QTL)，它们在两个数据集中复制。我们通过显示杂合子中出现等位基因特异性 RNAe 来证实 RNAe-QTL 对 RNA 结构的潜在影响。尽管通常认为 RNAe 的功能是破坏双链 RNA 结构的稳定性，但我们发现了明确的证据，表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。或者是体细胞 DNA 重排的结果。然后，我们进行了顺式遗传关联研究，并确定了 472 个遗传关联 (RNAe-QTL)，它们在两个数据集中复制。我们通过显示杂合子中出现等位基因特异性 RNAe 来证实 RNAe-QTL 对 RNA 结构的潜在影响。尽管通常认为 RNAe 的功能是破坏双链 RNA 结构的稳定性，但我们发现了明确的证据，表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。在两个数据集中复制。我们通过显示杂合子中出现等位基因特异性 RNAe 来证实 RNAe-QTL 对 RNA 结构的潜在影响。尽管通常认为 RNAe 的功能是破坏双链 RNA 结构的稳定性，但我们发现了明确的证据，表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。在两个数据集中复制。我们通过显示杂合子中出现等位基因特异性 RNAe 来证实 RNAe-QTL 对 RNA 结构的潜在影响。尽管通常认为 RNAe 的功能是破坏双链 RNA 结构的稳定性，但我们发现了明确的证据，表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。我们发现了明确的证据表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。我们发现了明确的证据表明 RNAe 可能额外参与维持已被 RNAe-QTL 改变的 RNA 发夹。我们的研究在两个独立的数据集中证实了 RNAe 在存在遗传变异的情况下在维持 RNA 结构方面的潜在作用。