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Metagenomic characterisation of bioaerosols during the dry season in Mexico City
Aerobiologia ( IF 2 ) Pub Date : 2020-06-23 , DOI: 10.1007/s10453-020-09649-5
M. C. Calderón-Ezquerro , N. Serrano-Silva , C. Brunner-Mendoza

Abstract Air pollution in urban areas is one of the main problems because of its effects on human health and the environment. The levels of critical pollutants such as ozone and airborne particles and their impacts on human health have been widely studied, neglecting the microbiological communities present in the air, which alone or in combination with chemical contaminants can have detrimental effects on human health. In this study, we employed a metagenomic approach to characterise the bacterial and fungal communities, using 16S rRNA and the internal transcribed spacer region of the nuclear ribosomal RNA. The study took place in Mexico City during the dry season, at days with high levels of ozone and suspended particles (March 14 to 18, 2016). We found a total of 147 bacterial genera, of which the most abundant ones were Microbispora (9%), Paracoccus (6%), Exiguobacterium (6%), Kocuria (3.0%), Friedmanniella (3%), Rubellimicrobium (2%), Sphingomonas (2%) and Methylobacterium (2%). We also found a total of 211 fungal genera, mainly Cladosporium (26%), Phoma (15%), Aureobasidium (11%) and Cryptococcus (3%). Some bacterial and fungal genera reported in this study have been reported as a cause of allergic, respiratory or infectious diseases. Our findings may serve as a reference for further monitoring of pathogens present in the air during periods with high levels of ozone and airborne particles, studying their distribution patterns and evaluating the possible combined effects of those particles and pollutants as a risk factor for the health of the general population. Graphic abstract

中文翻译:

墨西哥城旱季生物气溶胶的宏基因组特征

摘要 城市地区的空气污染对人类健康和环境的影响是主要问题之一。臭氧和空气传播颗粒等关键污染物的水平及其对人类健康的影响已得到广泛研究,而忽略了空气中存在的微生物群落,这些微生物群落单独或与化学污染物结合会对人类健康产生不利影响。在这项研究中,我们采用宏基因组方法来表征细菌和真菌群落,使用 16S rRNA 和核核糖体 RNA 的内部转录间隔区。该研究发生在墨西哥城的旱季,在臭氧和悬浮颗粒含量高的日子里(2016 年 3 月 14 日至 18 日)。我们共发现了 147 个细菌属,其中最丰富的是 Microbispora (9%),副球菌 (6%)、Exiguobacterium (6%)、Kocuria (3.0%)、Friedmanniella (3%)、风疹微生物 (2%)、鞘氨醇单胞菌 (2%) 和甲基杆菌 (2%)。我们还发现了总共 211 个真菌属,主要是枝孢菌 (26%)、Phoma (15%)、金球孢菌 (11%) 和隐球菌 (3%)。本研究中报道的一些细菌和真菌属已被报道为过敏、呼吸道或传染病的原因。我们的研究结果可作为参考,以进一步监测在臭氧和空气中颗粒物含量高的时期空气中存在的病原体,研究它们的分布模式,并评估这些颗粒物和污染物作为健康风险因素的可能综合影响。一般人群。图形摘要 鞘氨醇单胞菌 (2%) 和甲基杆菌 (2%)。我们还发现了总共 211 个真菌属,主要是枝孢菌 (26%)、Phoma (15%)、金球孢菌 (11%) 和隐球菌 (3%)。本研究中报道的一些细菌和真菌属已被报道为过敏、呼吸道或传染病的原因。我们的研究结果可作为参考,以进一步监测在臭氧和空气中颗粒物含量高的时期空气中存在的病原体,研究它们的分布模式,并评估这些颗粒物和污染物作为健康风险因素的可能综合影响。一般人群。图形摘要 鞘氨醇单胞菌 (2%) 和甲基杆菌 (2%)。我们还发现了总共 211 个真菌属,主要是枝孢菌 (26%)、Phoma (15%)、金球孢菌 (11%) 和隐球菌 (3%)。本研究中报道的一些细菌和真菌属已被报道为过敏、呼吸道或传染病的原因。我们的研究结果可作为参考,以进一步监测在臭氧和空气中颗粒物含量高的时期空气中存在的病原体,研究它们的分布模式,并评估这些颗粒物和污染物作为健康风险因素的可能综合影响。一般人群。图形摘要 本研究中报道的一些细菌和真菌属已被报道为过敏、呼吸道或传染病的原因。我们的研究结果可作为参考,以进一步监测臭氧和空气中颗粒物含量高的时期空气中存在的病原体,研究它们的分布模式,并评估这些颗粒物和污染物可能作为健康风险因素的综合影响。一般人群。图形摘要 本研究中报道的一些细菌和真菌属已被报道为过敏、呼吸道或传染病的原因。我们的研究结果可作为参考,以进一步监测臭氧和空气中颗粒物含量高的时期空气中存在的病原体,研究它们的分布模式,并评估这些颗粒物和污染物可能作为健康风险因素的综合影响。一般人群。图形摘要 研究它们的分布模式,并评估这些颗粒和污染物作为一般人群健康风险因素可能产生的综合影响。图形摘要 研究它们的分布模式,并评估这些颗粒和污染物作为一般人群健康风险因素可能产生的综合影响。图形摘要
更新日期:2020-06-23
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