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Using influenza surveillance networks to estimate state-specific prevalence of SARS-CoV-2 in the United States.
Science Translational Medicine ( IF 17.1 ) Pub Date : 2020-07-29 , DOI: 10.1126/scitranslmed.abc1126
Justin D Silverman 1, 2 , Nathaniel Hupert 3, 4 , Alex D Washburne 5
Affiliation  

Detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections to date has relied heavily on reverse transcription polymerase chain reaction testing. However, limited test availability, high false-negative rates, and the existence of asymptomatic or subclinical infections have resulted in an undercounting of the true prevalence of SARS-CoV-2. Here, we show how influenza-like illness (ILI) outpatient surveillance data can be used to estimate the prevalence of SARS-CoV-2. We found a surge of non-influenza ILI above the seasonal average in March 2020 and showed that this surge correlated with coronavirus disease 2019 (COVID-19) case counts across states. If one-third of patients infected with SARS-CoV-2 in the United States sought care, this ILI surge would have corresponded to more than 8.7 million new SARS-CoV-2 infections across the United States during the 3-week period from 8 to 28 March 2020. Combining excess ILI counts with the date of onset of community transmission in the United States, we also show that the early epidemic in the United States was unlikely to have been doubling slower than every 4 days. Together, these results suggest a conceptual model for the COVID-19 epidemic in the United States characterized by rapid spread across the United States with more than 80% infected individuals remaining undetected. We emphasize the importance of testing these findings with seroprevalence data and discuss the broader potential to use syndromic surveillance for early detection and understanding of emerging infectious diseases.



中文翻译:

使用流感监测网络来估计美国SARS-CoV-2的州特定患病率。

迄今为止,严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染的检测严重依赖于逆转录聚合酶链反应测试。然而,有限的测试可用性,高的假阴性率以及无症状或亚临床感染的存在导致对SARS-CoV-2真正流行率的低估。在这里,我们展示了流感样疾病(ILI)门诊监测数据如何可用于估计SARS-CoV-2的患病率。我们发现2020年3月非流感ILI激增高于季节性平均水平,并表明该激增与各州的2019年冠状病毒病(COVID-19)病例数相关。如果在美国感染SARS-CoV-2的患者中有三分之一寻求护理,那么ILI激增将相当于8例以上。在2020年3月8日至28日的3周内,美国出现了700万新的SARS-CoV-2感染。结合ILI过多计数与美国社区传播的开始日期,我们还显示出这种早期流行病在美国,速度不可能比每4天翻一番。总之,这些结果表明了美国COVID-19流行的概念模型,其特征是在美国迅速传播,超过80%的受感染个体仍未被发现。我们强调使用血清阳性率数据测试这些发现的重要性,并讨论使用综合征监测早期发现和了解新兴传染病的广泛潜力。将过量的ILI计数与美国社区传播的开始日期相结合,我们还表明,美国的早期流行病不可能比每4天慢一倍。总之,这些结果表明了美国COVID-19流行的概念模型,其特征是在美国迅速传播,超过80%的受感染个体仍未被发现。我们强调使用血清阳性率数据测试这些发现的重要性,并讨论使用综合征监测早期发现和了解新兴传染病的广泛潜力。将过量的ILI计数与美国社区传播的开始日期相结合,我们还表明,美国的早期流行病不可能比每4天慢一倍。总之,这些结果表明了美国COVID-19流行的概念模型,其特征是在美国迅速传播,超过80%的受感染个体仍未被发现。我们强调使用血清阳性率数据测试这些发现的重要性,并讨论使用综合征监测早期发现和了解新兴传染病的广泛潜力。这些结果表明了美国COVID-19流行的概念模型,其特征是在美国迅速传播,超过80%的受感染个体仍未被发现。我们强调使用血清阳性率数据测试这些发现的重要性,并讨论使用综合征监测早期发现和了解新兴传染病的广泛潜力。这些结果表明了美国COVID-19流行的概念模型,其特征是在美国迅速传播,超过80%的受感染个体仍未被发现。我们强调使用血清阳性率数据测试这些发现的重要性,并讨论使用综合征监测早期发现和了解新兴传染病的广泛潜力。

更新日期:2020-07-30
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