Prenatal exome sequencing in 65 fetuses with abnormality of the corpus callosum: contribution to further diagnostic delineation.,Genetics in Medicine

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Prenatal exome sequencing in 65 fetuses with abnormality of the corpus callosum: contribution to further diagnostic delineation.
Genetics in Medicine ( IF 8.8 ) Pub Date : 2020-06-22 , DOI: 10.1038/s41436-020-0872-8
Solveig Heide ₁ , Myrtille Spentchian ₁ , Stéphanie Valence ₂ , Julien Buratti ₃ , Corinne Mach ₃ , Elodie Lejeune ₃ , Valérie Olin ₃ , Marta Massimello ₁ , Daphné Lehalle ₁ , Linda Mouthon ₁ , Sandra Whalen ₄ , Anne Faudet ₁ , Cyril Mignot ₁ , Catherine Garel ₅ , Eleonore Blondiaux ₅ , Mathilde Lefebvre ₆ , Geneviève Quenum-Miraillet ₇ , Sandra Chantot-Bastaraud ₇ , Mathieu Milh ₈ , Florence Bretelle ₉ , Vincent des Portes ₁₀ , Laurent Guibaud ₁₁ , Audrey Putoux ₁₂ , Vassili Tsatsaris ₁₃ , Marta Spodenkiewic ₁₄ , Valérie Layet ₁₅ , Rodolphe Dard ₁₆ , Laurent Mandelbrot ₁₇ , Agnès Guet ₁₈ , Sébastien Moutton ₁₉ , Magali Gorce ₂₀ , Mathilde Nizon ₂₁ , Marie Vincent ₂₁ , Claire Beneteau ₂₁ , Marie-Amélie Rocchisanni ₂₂ , Alexandra Benachi ₂₃ , Julien Saada ₂₃ , Tania Attié-Bitach ₂₄ , Lucie Guilbaud ₂₅ , Paul Maurice ₂₅ , Stéphanie Friszer ₂₅ , Jean-Marie Jouannic ₂₅ , Thierry Billette de Villemeur ₂ , Marie-Laure Moutard ₂ , Boris Keren ₃ , Delphine Héron ₁

Affiliation

UF de Génétique Médicale et CRMR « Déficience intellectuelle », Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
Service de Neurologie Pédiatrique, Hôpital Armand Trousseau, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
UF de Génomique du Développement, Département de Génétique, Groupe Hospitalier Pitié-Salpêtrière, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
Service de Génétique Clinique, Hôpital Armand Trousseau, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
Service de Radiologie Pédiatrique, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
Service de Foetopathologie, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
Service de Cytogénétique, Hôpital Armand Trousseau, HUEP, APHP Sorbonne Université, Paris, France.
Service de Neurologie Pédiatrique, Hôpital La Timone, APHM, Marseille, France.
Service de Gynécologie Obstétrique, Hôpital Nord, APHM, Aix-Marseille Université, Marseille, France.
Service de Neurologie Pédiatrique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France.
Service de Radiologie Pédiatrique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France.
Service de Génétique Clinique, Hospices Civils de Lyon, Bron, France.
Service de Gynécologie Obstétrique, Hôpital Cochin, Paris, France.
Service de Génétique Clinique, CHU de Reims, Reims, France.
Service de Génétique Clinique, Hôpital du Havre, Le Havre, France.
Service de Génétique Clinique, Hôpital de Poissy, Poissy, France.
Service de Gynécologie Obstétrique, APHP, Université de Paris, Hôpital Louis Mourier, Colombes, France.
Service de Pédiatrie, APHP, Hôpital Louis Mourier, Colombes, France.
Service de Génétique Clinique, CHU de Dijon, Dijon, France.
Service de Génétique Clinique, CHU d'Angers, Angers, France.
Service de Génétique Clinique, CHU de Nantes, Nantes, France.
Service de Médecine Néonatale, Hôpital Cochin, APHP, Paris, France.
Service de Gynécologie-Obstétrique, Hôpital Antoine Béclère, APHP, Université Paris Saclay, Clamart, France.
Embryofoetopathologie, Service Histologie-Embryologie-Cytogénétique, Hôpital Necker-Enfants Malades, APHP, Paris, France.
Fetal Medicine Département, Hôpital Armand Trousseau, APHP, Sorbonne Université, Paris, France.

Purpose

Abnormality of the corpus callosum (AbnCC) is etiologically a heterogeneous condition and the prognosis in prenatally diagnosed cases is difficult to predict. The purpose of our research was to establish the diagnostic yield using chromosomal microarray (CMA) and exome sequencing (ES) in cases with prenatally diagnosed isolated (iAbnCC) and nonisolated AbnCC (niAbnCC).

Methods

CMA and prenatal trio ES (pES) were done on 65 fetuses with iAbnCC and niAbnCC. Only pathogenic gene variants known to be associated with AbnCC and/or intellectual disability were considered.

Results

pES results were available within a median of 21.5 days (9–53 days). A pathogenic single-nucleotide variant (SNV) was identified in 12 cases (18%) and a pathogenic CNV was identified in 3 cases (4.5%). Thus, the genetic etiology was determined in 23% of cases. In all diagnosed cases, the results provided sufficient information regarding the neurodevelopmental prognosis and helped the parents to make an informed decision regarding the outcome of the pregnancy.

Conclusion

Our results show the significant diagnostic and prognostic contribution of CMA and pES in cases with prenatally diagnosed AbnCC. Further prospective cohort studies with long-term follow-up of the born children will be needed to provide accurate prenatal counseling after a negative pES result.

中文翻译：

65 例胼胝体异常胎儿的产前外显子组测序：有助于进一步诊断。

目的

胼胝体异常 (AbnCC) 在病因学上是一种异质性疾病，产前诊断病例的预后难以预测。我们研究的目的是确定使用染色体微阵列 (CMA) 和外显子组测序 (ES) 在产前诊断的分离型 (iAbnCC) 和非分离型 AbnCC (niAbnCC) 病例中的诊断率。

方法

对 65 名患有 iAbnCC 和 niAbnCC 的胎儿进行了 CMA 和产前三重奏 ES (pES)。仅考虑了已知与 AbnCC 和/或智力残疾相关的致病基因变异。

结果

pES 结果可在中位数 21.5 天（9-53 天）内获得。在 12 例 (18%) 中鉴定出致病性单核苷酸变异 (SNV)，在 3 例 (4.5%) 中鉴定出致病性 CNV。因此，在 23% 的病例中确定了遗传病因。在所有确诊病例中，结果提供了有关神经发育预后的充分信息，并帮助父母就妊娠结果做出明智的决定。