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Dependence of the heterosis effect on genetic distance, determined using various molecular markers
Open Life Sciences ( IF 2.2 ) Pub Date : 2020-02-28 , DOI: 10.1515/biol-2020-0001
Agnieszka Tomkowiak 1 , Jan Bocianowski 2 , Michał Kwiatek 1 , Przemysław Łukasz Kowalczewski 3
Affiliation  

Abstract A number of studies have shown that the greater the genetic diversity of parental lines, the greater the heterosis effect. Genetic or phenotypic variation can be estimated by genotype testing on the basis of the observations obtained through prediction (a priori) or the observations and studies (a posteriori). The first method uses data such as the genealogy of a given subject and the information about its geographical origin. The second method is based on the phenotypic observation and studies, as well as on the molecular research. The development of molecular genetics and genotype testing methods at the DNA level has made it possible to rapidly assess the genetic variability regardless of the modifying effect of the environment. The aim of this study was to determine the relationship between the degree of relatedness and the DNA polymorphism (determined using AFLP, RAPD, and SSR markers) of inbred maize lines and the effect of hybrid-form heterosis. Our analysis demonstrated that the parental components for heterosis crosses can be selected on the basis of the genetic similarity determined using the molecular SSR markers and the Jaccard, Kluczyński, Nei, and Rogers coefficients. Molecular AFLP markers proved less useful for selecting the parental components, but may be used to group lines with incomplete origin data. In the case of the RAPD markers, no clear relationship between genetic distance and the heterosis effect was found in this study.

中文翻译:

杂种优势效应对遗传距离的依赖性,使用各种分子标记确定

摘要 多项研究表明,亲本遗传多样性越大,杂种优势效应越大。根据通过预测(先验)或观察和研究(后验)获得的观察结果,可以通过基因型测试来估计遗传或表型变异。第一种方法使用数据,例如给定主题的系谱及其地理起源信息。第二种方法基于表型观察和研究,以及分子研究。DNA 水平的分子遗传学和基因型检测方法的发展使得无论环境的改变影响如何,都可以快速评估遗传变异性。本研究的目的是确定相关程度与自交玉米品系的 DNA 多态性(使用 AFLP、RAPD 和 SSR 标记确定)之间的关系以及杂种形式杂种优势的影响。我们的分析表明,可以根据使用分子 SSR 标记和 Jaccard、Kluczyński、Nei 和 Rogers 系数确定的遗传相似性来选择杂种优势杂交的亲本成分。事实证明,分子 AFLP 标记对于选择亲本成分不太有用,但可用于对原始数据不完整的品系进行分组。在RAPD标记的情况下,本研究中没有发现遗传距离与杂种优势效应之间的明确关系。我们的分析表明,可以根据使用分子 SSR 标记和 Jaccard、Kluczyński、Nei 和 Rogers 系数确定的遗传相似性来选择杂种优势杂交的亲本成分。事实证明,分子 AFLP 标记对于选择亲本成分不太有用,但可用于对原始数据不完整的品系进行分组。在RAPD标记的情况下,本研究中没有发现遗传距离与杂种优势效应之间的明确关系。我们的分析表明,可以根据使用分子 SSR 标记和 Jaccard、Kluczyński、Nei 和 Rogers 系数确定的遗传相似性来选择杂种优势杂交的亲本成分。事实证明,分子 AFLP 标记对于选择亲本成分不太有用,但可用于对原始数据不完整的品系进行分组。在RAPD标记的情况下,本研究中没有发现遗传距离与杂种优势效应之间的明确关系。但可用于对原始数据不完整的行进行分组。在RAPD标记的情况下,本研究中没有发现遗传距离与杂种优势效应之间的明确关系。但可用于对原始数据不完整的行进行分组。在RAPD标记的情况下,本研究中没有发现遗传距离与杂种优势效应之间的明确关系。
更新日期:2020-02-28
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