Abstract Cynanchum bungei Decne. and its related species C. auriculatum Royle ex Wight. and C. wilfordii (Maxim.) Hemsl. are well known Chinese herbal medicines known by the name Baishouwu, and have a beneficial effect on health. Endophytic fungi exist widely inside host plants and are important components of plant micro-ecosystems. Previous studies have shown that there are significant differences among the isolated fungi from the three species of Baishouwu. To explore the fungal diversity in Cynanchum genus, we characterized and compared the endophytic fungal communities among different plant organs, species and localities of Baishouwu by a High-throughput 18S rDNA gene Illumina MiSeq sequencing technique. The results showed that the main factor affecting the distribution and population structure of endophytes was plant organs, rather than the species and localities. Moreover, Rank abundance curves demonstrated that the richness and evenness of JTG was the highest, while the evenness of JTY was the lowest, the richness of JTJ was the lowest. Furthermore, the samples from three localities had relatively similar fungal communities, as indicated by PCA and UPGMA analysis. The Fusarium, Exophiala, Plectosphaerella, Botryosphaeria, and Filobasidium were the predominant fungal genera in the seven samples, which might play an important role in the plant micro-ecosystems and were beneficial to their host plant. These findings contribute to an understanding of the diversity of the endophyte microbiome of Baishouwu and may be beneficial to the rational development and utilization of the medicinal plants.

中文翻译：

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金莲属植物内生真菌多样性的高通量测序分析。

摘要 Cynanchum bungei Decne。及其相关物种 C. auriculatum Royle ex Wight。和 C. wilfordii (Maxim.) Hemsl。白首乌是著名的中草药，对健康有好处。内生真菌广泛存在于寄主植物体内，是植物微生态系统的重要组成部分。以往的研究表明，从白首乌三个物种中分离出的真菌之间存在显着差异。为探索牛蒡属真菌的多样性，我们采用高通量18S rDNA基因Illumina MiSeq测序技术对白首乌不同植物器官、物种和产地的内生真菌群落进行了表征和比较。结果表明，影响内生菌分布和种群结构的主要因素是植物器官、而不是物种和地点。此外，Rank丰度曲线表明JTG的丰富度和均匀度最高，而JTY的均匀度最低，JTJ的丰富度最低。此外，PCA 和 UPGMA 分析表明，来自三个地点的样本具有相对相似的真菌群落。Fusarium、Exophiala、Plectosphaerella、Botryosphaeria和Filobasidium是7个样品中的优势真菌属，可能在植物微生态系统中发挥重要作用，对寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。秩丰度曲线表明，JTG的丰富度和均匀度最高，而JTY的均匀度最低，JTJ的丰富度最低。此外，PCA 和 UPGMA 分析表明，来自三个地点的样本具有相对相似的真菌群落。Fusarium、Exophiala、Plectosphaerella、Botryosphaeria和Filobasidium是7个样品中的优势真菌属，可能在植物微生态系统中发挥重要作用，对寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。秩丰度曲线表明，JTG的丰富度和均匀度最高，而JTY的均匀度最低，JTJ的丰富度最低。此外，PCA 和 UPGMA 分析表明，来自三个地点的样本具有相对相似的真菌群落。Fusarium、Exophiala、Plectosphaerella、Botryosphaeria和Filobasidium是7个样品中的优势真菌属，可能在植物微生态系统中发挥重要作用，对寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。此外，PCA 和 UPGMA 分析表明，来自三个地点的样本具有相对相似的真菌群落。Fusarium、Exophiala、Plectosphaerella、Botryosphaeria和Filobasidium是7个样品中的优势真菌属，可能在植物微生态系统中发挥重要作用，对寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。此外，PCA 和 UPGMA 分析表明，来自三个地点的样本具有相对相似的真菌群落。Fusarium、Exophiala、Plectosphaerella、Botryosphaeria和Filobasidium是7个样品中的优势真菌属，可能在植物微生态系统中发挥重要作用，对寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。这可能在植物微生态系统中发挥重要作用，并对其寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。这可能在植物微生态系统中发挥重要作用，并对其寄主植物有益。这些发现有助于了解白首乌内生菌群的多样性，有利于药用植物的合理开发利用。