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Profiling the pattern of human TRB/IGH-CDR3 repertoire in liver transplantation patients via high-throughput sequencing analysis.
Scandinavian Journal of Immunology ( IF 3.7 ) Pub Date : 2020-05-27 , DOI: 10.1111/sji.12912
Fei-Fei Han 1 , Hua Fan 1 , Lu-Lu Ren 1 , Hua-Guang Wang 1 , Chunlin Wang 2 , Xu Ma 3, 4 , Li-Hong Liu 1 , Qiang He 1 , Chang-Long Guo 3, 4
Affiliation  

Immune processes in liver transplantation remain poorly understood. Acute allograft rejection in liver transplantation is a kind of T cell–mediated inflammatory disease accompanied by inflammatory cell infiltration. However, the effect of acute allograft rejection on the immunological characteristics of TCRs in peripheral blood mononuclear cell is unknown. In this study, we characterized the pattern of the human T cell receptor beta chain (TRB) and immunoglobulin heavy chain (IGH) complementarity‐determining region 3 (CDR3) repertoires via high‐throughput sequencing in 11 acute allograft rejection (AG) cases, 23 patients with stable allograft liver function (ST) who had liver transplantation performed and 20 healthy controls (HC). The diversity of TRB‐CDR3 was significantly reduced in the AG group compared with the ST group and healthy controls (HC). The CDR3 and N‐addition length distribution were not significantly different between the AG and ST groups. However, N‐addition length distribution was significantly changed compared to HC. It seemed that AG used more short N‐additions and healthy people used more long N‐additions in TRB‐CDR3 repertoire. Our findings suggested that the TRB‐CDR3 region of AG had distinctive V gene use compared with that of HC. The characteristics of ST seemed to be in between those of AG and HC although the difference is not significant. Cluster analysis showed that the TRB repertoire could not effectively distinguish AG from ST. This research might give to a better understanding of the immune process of liver transplantation.

中文翻译:

通过高通量测序分析来分析肝移植患者中人TRB / IGH-CDR3的库模式。

肝移植的免疫过程仍然知之甚少。肝移植的急性同种异体排斥反应是T细胞介导的炎性疾病,伴有炎性细胞浸润。但是,急性同种异体排斥反应对外周血单核细胞中TCRs免疫学特性的影响尚不清楚。在这项研究中,我们通过高通量测序对11例急性同种异体移植排斥(AG)病例中人类T细胞受体β链(TRB)和免疫球蛋白重链(IGH)互补决定区3(CDR3)组成谱的模式进行了表征,进行肝移植的23名稳定异体移植肝功能(ST)患者和20名健康对照(HC)。与ST组和健康对照组(HC)相比,AG组TRB-CDR3的多样性显着降低。AG组和ST组之间的CDR3和N加成长度分布无明显差异。但是,与HC相比,N加成长度分布发生了显着变化。AG似乎在TRB-CDR3曲目中使用了更多的短N-添加物,而健康的人则使用了更多的长N-添加物。我们的发现表明,与HC相比,AG的TRB-CDR3区具有独特的V基因使用。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。AG组和ST组之间的CDR3和N加成长度分布无明显差异。但是,与HC相比,N加成长度分布发生了显着变化。AG似乎在TRB-CDR3曲目中使用了更多的短N-添加物,而健康的人则使用了更多的长N-添加物。我们的发现表明,与HC相比,AG的TRB-CDR3区具有独特的V基因使用。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。AG组和ST组之间的CDR3和N加成长度分布无明显差异。但是,与HC相比,N加成长度分布发生了显着变化。AG似乎在TRB-CDR3曲目中使用了更多的短N-添加物,而健康的人则使用了更多的长N-添加物。我们的发现表明,与HC相比,AG的TRB-CDR3区具有独特的V基因使用。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。与HC相比,N-加成长度分布发生了显着变化。AG似乎在TRB-CDR3曲目中使用了更多的短N-添加物,而健康的人则使用了更多的长N-添加物。我们的发现表明,与HC相比,AG的TRB-CDR3区具有独特的V基因使用。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。与HC相比,N-加成长度分布发生了显着变化。AG似乎在TRB-CDR3曲目中使用了更多的短N-添加物,而健康的人则使用了更多的长N-添加物。我们的发现表明,与HC相比,AG的TRB-CDR3区具有独特的V基因使用。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。ST的特性似乎介于AG和HC之间,尽管差异不明显。聚类分析表明TRB库不能有效区分AG和ST。这项研究可能会更好地了解肝移植的免疫过程。
更新日期:2020-07-24
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