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The First Comprehensive Cohort of the Duchenne Muscular Dystrophy in Iranian Population: Mutation Spectrum of 314 Patients and Identifying Two Novel Nonsense Mutations.
Journal of Molecular Neuroscience ( IF 3.1 ) Pub Date : 2020-05-21 , DOI: 10.1007/s12031-020-01594-9
Gholamreza Zamani 1 , Ali Hosseini Bereshneh 2, 3 , Reza Azizi Malamiri 4 , Sayna Bagheri 1, 5 , Kamyar Moradi 1, 5 , Mahmoud Reza Ashrafi 6 , Ali Reza Tavasoli 1 , Mahmoud Mohammadi 1 , Reza Shervin Badv 1 , Masood Ghahvechi Akbari 7 , Morteza Heidari 1, 8
Affiliation  

Mutations in the dystrophin gene could cause Duchenne muscular dystrophy (DMD), which is the most common muscular disorder in pediatrics. Considering the growing evidence on appropriateness of gene therapies for DMD, precise genetic diagnosis seems essential. Hence, we conducted a study to determine mutational patterns in Iranian children with DMD. To detect all probable large mutations in the dystrophin gene, 314 DMD patients were evaluated using the multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA). Subjects who were MLPA-negative underwent the next generation sequencing (NGS) to identify potential point mutations. MLPA detected deletions (79.93%) and duplications (5.41%) along the dystrophin gene of 268 patients. Distribution of large mutations was heterogeneous and followed hotspot pattern throughout the gene. From 46 patients who were MLPA-negative, 43 exhibited point mutations including nonsense in 7.64%, frameshifts in 4.77%, splicing in 0.96%, and missense variations in 0.32% of participants. Most of the point mutations were located between exons 19 and 40. In three patients (1%), no mutation was found using either MLPA or NGS. Two subjects had novel nonsense mutations (L1675X and E1199X) in their dystrophin gene, which were considered as the possible reason for elimination of major domains of the gene. The results of this study provided invaluable information regarding the distribution of various large and small mutations in Iranian individuals with DMD. Besides, the novel nonsense mutations L1675X and E1199X were identified within the highly conserved residues, leading to elimination of significant domains of the dystrophin gene.

中文翻译:

伊朗人群杜氏肌营养不良症的第一个综合队列:314 名患者的突变谱并确定两个新的无意义突变。

肌营养不良蛋白基因突变可能导致杜氏肌营养不良症 (DMD),这是儿科最常见的肌肉疾病。考虑到越来越多的证据表明 DMD 基因疗法的适用性,精确的基因诊断似乎必不可少。因此,我们进行了一项研究,以确定伊朗 DMD 儿童的突变模式。为了检测肌营养不良蛋白基因中所有可能的大突变,使用多重连接依赖性探针扩增 (MLPA) 对 314 名 DMD 患者进行了评估。MLPA 阴性的受试者接受下一代测序 (NGS) 以识别潜在的点突变。MLPA 检测到 268 名患者的肌营养不良蛋白基因的缺失 (79.93%) 和重复 (5.41%)。大突变的分布是异质的,并且在整个基因中遵循热点模式。在 46 名 MLPA 阴性患者中,43 名表现出点突变,包括 7.64% 的无义、4.77% 的移码、0.96% 的剪接和 0.32% 的错义变异。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。43 名参与者表现出点突变,包括 7.64% 的无义、4.77% 的移码、0.96% 的剪接和 0.32% 的错义变异。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。43 名参与者表现出点突变,包括 7.64% 的无义、4.77% 的移码、0.96% 的剪接和 0.32% 的错义变异。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。4.77% 的移码、0.96% 的剪接和 0.32% 的错义变异。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。4.77% 的移码、0.96% 的剪接和 0.32% 的错义变异。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。大多数点突变位于外显子 19 和 40 之间。在三名患者 (1%) 中,使用 MLPA 或 NGS 均未发现突变。两名受试者的抗肌萎缩蛋白基因发生了新的无义突变(L1675X 和 E1199X),这被认为是该基因主要结构域被消除的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。这被认为是消除基因主要结构域的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。这被认为是消除基因主要结构域的可能原因。这项研究的结果提供了关于伊朗 DMD 个体中各种大小突变分布的宝贵信息。此外,在高度保守的残基中鉴定了新的无义突变 L1675X 和 E1199X,从而消除了肌营养不良蛋白基因的重要结构域。
更新日期:2020-05-21
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