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Regulation of related genes promoting resistant in Iris against root rot disease, Fusarium oxysporum f. sp. gladioli.
Genomics ( IF 4.4 ) Pub Date : 2020-05-17 , DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.05.013 Masoud Mazaheri Tehrani 1 , Mehdi Nasr Esfahani 2 , Amir Mousavi 3 , Forogh Mortezaiinezhad 4 , Mohammad Hosein Azimi 5
Genomics ( IF 4.4 ) Pub Date : 2020-05-17 , DOI: 10.1016/j.ygeno.2020.05.013 Masoud Mazaheri Tehrani 1 , Mehdi Nasr Esfahani 2 , Amir Mousavi 3 , Forogh Mortezaiinezhad 4 , Mohammad Hosein Azimi 5
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Iris is one of the most popular and best-selling ornamental plants around the globe. Fusarium root rot disease, Fusarium oxysporum f.sp. gladioli (FOG) is one of the most serious disease of Iridaceae and Iris plants. In this study, three resistant and three susceptible Iris genotypes were inoculated with FOG isolates to evaluate expression of related genes promoting defense to disease at intervals times at two, four and six weeks post inoculation. Total RNA was extracted using an AccuZol™ reagent, and the first-strand Cdna was synthesized accordingly. Expression level of WRKY transcription factors (WRKY), lectin receptor kinase (LecRK), pathogenesis-related protein (PR3), lipoxygenase (LOX1) and ribosome-inactivating proteins (RIP) genes was investigated using quantitative polymerase chain reaction (qPCR). The transcriptional level of five defense-related genes were up-regulated in FOG-infected samples. The genes expression in resistant Iris genotypes NIOP3, NIOP15 and NIOP16 was much higher than susceptible NIOP1, NIOP12 and NIOP20 genotypes. The highest level of expression was observed in all the genes and genotypes at 6 weeks post inoculation. The phenotypic symptoms of genotypes and changes in the expression of genes confirmed resistance in Iris genotypes NIOP3, NIOP15 and NIOP16 in comparison to susceptible genotypes NIOP1, NIOP12 and NIOP20, and un-inoculated control Iris plants. Identifying disease-resistant genotypes can contribute to the development of new ornamental cultivars that can be deployed to ensure high quality and lasting Iris plants.
中文翻译：
促进虹膜抗根腐病Fusarium oxysporum f 相关基因的调控。sp. 剑兰。
鸢尾花是全球最受欢迎和最畅销的观赏植物之一。Fusarium root rot disease, Fusarium oxysporum f.sp. 剑兰（FOG）是鸢尾科和鸢尾属植物中最严重的病害之一。在这项研究中，三个抗性和三个易感 Iris 基因型用 FOG 分离株接种，以评估相关基因的表达，在接种后 2、4 和 6 周的间隔时间促进对疾病的防御。使用 AccuZol™ 试剂提取总 RNA，并相应合成第一链 Cdna。使用定量聚合酶链反应 (qPCR) 研究了 WRKY 转录因子 (WRKY)、凝集素受体激酶 (LecRK)、发病机制相关蛋白 (PR3)、脂肪氧化酶 (LOX1) 和核糖体失活蛋白 (RIP) 基因的表达水平。在 FOG 感染的样本中，五种防御相关基因的转录水平上调。抗性 Iris 基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的基因表达远高于易感 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 基因型。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。抗性 Iris 基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的基因表达远高于易感 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 基因型。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。抗性 Iris 基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的基因表达远高于易感 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 基因型。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。
更新日期：2020-05-17
中文翻译：
促进虹膜抗根腐病Fusarium oxysporum f 相关基因的调控。sp. 剑兰。
鸢尾花是全球最受欢迎和最畅销的观赏植物之一。Fusarium root rot disease, Fusarium oxysporum f.sp. 剑兰（FOG）是鸢尾科和鸢尾属植物中最严重的病害之一。在这项研究中，三个抗性和三个易感 Iris 基因型用 FOG 分离株接种，以评估相关基因的表达，在接种后 2、4 和 6 周的间隔时间促进对疾病的防御。使用 AccuZol™ 试剂提取总 RNA，并相应合成第一链 Cdna。使用定量聚合酶链反应 (qPCR) 研究了 WRKY 转录因子 (WRKY)、凝集素受体激酶 (LecRK)、发病机制相关蛋白 (PR3)、脂肪氧化酶 (LOX1) 和核糖体失活蛋白 (RIP) 基因的表达水平。在 FOG 感染的样本中，五种防御相关基因的转录水平上调。抗性 Iris 基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的基因表达远高于易感 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 基因型。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。抗性 Iris 基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的基因表达远高于易感 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 基因型。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。抗性 Iris 基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的基因表达远高于易感 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 基因型。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。在接种后 6 周时在所有基因和基因型中观察到最高水平的表达。与易感基因型 NIOP1、NIOP12 和 NIOP20 以及未接种的对照鸢尾植物相比，基因型的表型症状和基因表达的变化证实了鸢尾基因型 NIOP3、NIOP15 和 NIOP16 的抗性。识别抗病基因型有助于开发新的观赏品种，这些品种可用于确保高质量和持久的鸢尾植物。
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