Macaques are the most widely used non-human primates in biomedical research. The genetic divergence between these animal models is responsible for their phenotypic differences in response to certain diseases. However, the macaque single nucleotide polymorphism resources mainly focused on rhesus macaque (Macaca mulatta), which hinders the broad research and biomedical application of other macaques. In order to overcome these limitations, we constructed a database named MACSNVdb that focuses on the interspecies genetic diversity among macaque genomes. MACSNVdb is a web-enabled database comprising ~74.51 million high-quality non-redundant single nucleotide variants (SNVs) identified among 20 macaque individuals from six species groups (muttla, fascicularis, sinica, arctoides, silenus, sylvanus). In addition to individual SNVs, MACSNVdb also allows users to browse and retrieve groups of user-defined SNVs. In particular, users can retrieve non-synonymous SNVs that may have deleterious effects on protein structure or function within macaque orthologs of human disease and drug-target genes. Besides position, alleles and flanking sequences, MACSNVdb integrated additional genomic information including SNV annotations and gene functional annotations. MACSNVdb will facilitate biomedical researchers to discover molecular mechanisms of diverse responses to diseases as well as primatologist to perform population genetic studies. We will continue updating MACSNVdb with newly available sequencing data and annotation to keep the resource up to date. Database URL: http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/.

中文翻译：

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MACSNVdb：用于猕猴种间遗传差异调查的高质量 SNV 数据库。

猕猴是生物医学研究中使用最广泛的非人类灵长类动物。这些动物模型之间的遗传差异是导致它们对某些疾病的表型差异的原因。然而，猕猴单核苷酸多态性资源主要集中在恒河猴（Macaca mulatta）上，阻碍了其他猕猴的广泛研究和生物医学应用。为了克服这些限制，我们构建了一个名为 MACSNVdb 的数据库，该数据库专注于猕猴基因组之间的种间遗传多样性。MACSNVdb 是一个启用网络的数据库，包含约 7451 万个高质量非冗余单核苷酸变异 (SNV)，这些变异是在来自六个物种组（muttla、fascicularis、sinica、arctoides、silenus、sylvanus）的 20 只猕猴个体中鉴定出来的。除了个别的 SNV，MACSNVdb 还允许用户浏览和检索用户定义的 SNV 组。特别是，用户可以检索可能对人类疾病和药物靶基因的猕猴直向同源物中的蛋白质结构或功能产生有害影响的非同义 SNV。除了位置、等位基因和侧翼序列，MACSNVdb 还整合了额外的基因组信息，包括 SNV 注释和基因功能注释。MACSNVdb 将促进生物医学研究人员发现对疾病的不同反应的分子机制以及灵长类动物学家进行种群遗传研究。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。用户可以检索可能对人类疾病和药物靶基因的猕猴直向同源物中的蛋白质结构或功能产生有害影响的非同义 SNV。除了位置、等位基因和侧翼序列，MACSNVdb 还整合了额外的基因组信息，包括 SNV 注释和基因功能注释。MACSNVdb 将促进生物医学研究人员发现对疾病的不同反应的分子机制以及灵长类动物学家进行种群遗传研究。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。用户可以检索可能对人类疾病和药物靶基因的猕猴直向同源物中的蛋白质结构或功能产生有害影响的非同义 SNV。除了位置、等位基因和侧翼序列，MACSNVdb 还整合了额外的基因组信息，包括 SNV 注释和基因功能注释。MACSNVdb 将促进生物医学研究人员发现对疾病的不同反应的分子机制以及灵长类动物学家进行种群遗传研究。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。等位基因和侧翼序列，MACSNVdb 集成了额外的基因组信息，包括 SNV 注释和基因功能注释。MACSNVdb 将促进生物医学研究人员发现对疾病的不同反应的分子机制以及灵长类动物学家进行种群遗传研究。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。等位基因和侧翼序列，MACSNVdb 集成了额外的基因组信息，包括 SNV 注释和基因功能注释。MACSNVdb 将促进生物医学研究人员发现对疾病的不同反应的分子机制以及灵长类动物学家进行种群遗传研究。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。我们将继续使用新可用的测序数据和注释更新 MACSNVdb，以使资源保持最新。数据库网址：http://big.cdu.edu.cn/macsnvdb/。