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Two haplotypes of Lobesia botrana (Denis & Schiffermüller, 1775) predominate in two adjacent regions of southern Turkey
Phytoparasitica ( IF 1.4 ) Pub Date : 2020-01-23 , DOI: 10.1007/s12600-020-00784-w Gül Satar , M. Murat Aslan , Ceyda Ücük
Phytoparasitica ( IF 1.4 ) Pub Date : 2020-01-23 , DOI: 10.1007/s12600-020-00784-w Gül Satar , M. Murat Aslan , Ceyda Ücük
The study was conducted to determine the genetic structure of Lobesia botrana (Denis and Schiffermüller 1775) (Lepidoptera: Tortricidae) populations from South of Turkey by molecular methods. Mitochondrial DNA cytochrome oxidase gene was used for phylogenetic and population genetic analyses comparing specimens from Mediterranean (MED-TR) and South East Anatolia (SEA-TR) Regions of Turkey with reference sequences from the Middle East and Europe deposited in GenBank. The Turkish specimens were allocated to seven haplotypes. Binary genetic distance between MED-TR and SEA-TR was above 0.6, whereas, between the Middle East and MED-TR was only 0.034. Gene flow was infinite between MED-TR and the Middle East, but was 0.23 between SEA-TR and the Middle East as the lowest. The two common haplotypes from Turkey were placed in two clades on the phylogenetic tree, separated with a bootstrap value of 100. The common haplotype from MED-TR clustered on the same branch at the tree with the sequences from Israel and Greece, whereas, the common haplotype from SEA-TR was close to European haplotypes, with this separation supported by haplotype network analysis. Overall, the results showed that L. botrana populations in these two adjacent geographic regions of Turkey consist mostly of two genetically different haplotypes. This could be a consequence of the cultivars grown, the production methods and/or the climatic conditions in SEA-TR. However, the most prevalent haplotype in MED-TR, with a predominantly Mediterranean climate, is likely to be prevalent in other Mediterranean Basin countries with a similar climate.
中文翻译:
Lobesia botrana (Denis & Schiffermüller, 1775) 的两种单倍型在土耳其南部的两个相邻地区占主导地位
进行这项研究是为了通过分子方法确定来自土耳其南部的 Lobesia botrana (Denis and Schiffermüller 1775) (Lepidoptera: Tortricidae) 种群的遗传结构。线粒体 DNA 细胞色素氧化酶基因用于系统发育和群体遗传分析,比较来自土耳其地中海 (MED-TR) 和东南安纳托利亚 (SEA-TR) 地区的标本与 GenBank 中来自中东和欧洲的参考序列。土耳其标本被分配到七个单倍型。MED-TR 和 SEA-TR 之间的二元遗传距离在 0.6 以上,而中东和 MED-TR 之间的二元遗传距离仅为 0.034。基因流在MED-TR和中东之间无限大,但在SEA-TR和中东之间为0.23,最低。来自土耳其的两个常见单倍型被放置在系统发育树上的两个进化枝中,以 100 的引导值分隔。来自 MED-TR 的常见单倍型聚集在树的同一分支上,具有来自以色列和希腊的序列,而来自 SEA-TR 的常见单倍型与欧洲单倍型接近,这种分离得到了单倍型网络分析的支持。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。以 100 的 bootstrap 值分离。 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而 SEA-TR 的常见单倍型与欧洲单倍型接近,这种分离支持通过单倍型网络分析。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。以 100 的 bootstrap 值分离。 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而 SEA-TR 的常见单倍型与欧洲单倍型接近,这种分离支持通过单倍型网络分析。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。来自 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而来自 SEA-TR 的常见单倍型接近欧洲单倍型,这种分离得到了单倍型网络分析的支持。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。来自 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而来自 SEA-TR 的常见单倍型接近欧洲单倍型,这种分离得到了单倍型网络分析的支持。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。单倍型网络分析支持这种分离。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。单倍型网络分析支持这种分离。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。
更新日期:2020-01-23
中文翻译:
Lobesia botrana (Denis & Schiffermüller, 1775) 的两种单倍型在土耳其南部的两个相邻地区占主导地位
进行这项研究是为了通过分子方法确定来自土耳其南部的 Lobesia botrana (Denis and Schiffermüller 1775) (Lepidoptera: Tortricidae) 种群的遗传结构。线粒体 DNA 细胞色素氧化酶基因用于系统发育和群体遗传分析,比较来自土耳其地中海 (MED-TR) 和东南安纳托利亚 (SEA-TR) 地区的标本与 GenBank 中来自中东和欧洲的参考序列。土耳其标本被分配到七个单倍型。MED-TR 和 SEA-TR 之间的二元遗传距离在 0.6 以上,而中东和 MED-TR 之间的二元遗传距离仅为 0.034。基因流在MED-TR和中东之间无限大,但在SEA-TR和中东之间为0.23,最低。来自土耳其的两个常见单倍型被放置在系统发育树上的两个进化枝中,以 100 的引导值分隔。来自 MED-TR 的常见单倍型聚集在树的同一分支上,具有来自以色列和希腊的序列,而来自 SEA-TR 的常见单倍型与欧洲单倍型接近,这种分离得到了单倍型网络分析的支持。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。以 100 的 bootstrap 值分离。 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而 SEA-TR 的常见单倍型与欧洲单倍型接近,这种分离支持通过单倍型网络分析。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。以 100 的 bootstrap 值分离。 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而 SEA-TR 的常见单倍型与欧洲单倍型接近,这种分离支持通过单倍型网络分析。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。来自 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而来自 SEA-TR 的常见单倍型接近欧洲单倍型,这种分离得到了单倍型网络分析的支持。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。来自 MED-TR 的常见单倍型与来自以色列和希腊的序列聚集在树的同一分支上,而来自 SEA-TR 的常见单倍型接近欧洲单倍型,这种分离得到了单倍型网络分析的支持。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。单倍型网络分析支持这种分离。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。单倍型网络分析支持这种分离。总体而言,结果表明,土耳其这两个相邻地理区域中的 L. botrana 种群主要由两种遗传不同的单倍型组成。这可能是 SEA-TR 种植品种、生产方法和/或气候条件的结果。然而,主要是地中海气候的 MED-TR 中最普遍的单倍型很可能在其他具有类似气候的地中海盆地国家中普遍存在。