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Prevalence and antimicrobial susceptibility of Arcobacter species in human stool samples derived from out- and inpatients: the prospective German Arcobacter prevalence study Arcopath.
Gut Pathogens ( IF 4.2 ) Pub Date : 2020-04-15 , DOI: 10.1186/s13099-020-00360-x
Vanessa Brückner 1 , Ulrike Fiebiger 2 , Ralf Ignatius 2, 3 , Johannes Friesen 3 , Martin Eisenblätter 4 , Marlies Höck 5 , Thomas Alter 1 , Stefan Bereswill 2 , Greta Gölz 1 , Markus M Heimesaat 2
Affiliation  

Background Arcobacter species, particularly A. butzleri, but also A. cryaerophilus constitute emerging pathogens causing gastroenteritis in humans. However, isolation of Arcobacter may often fail during routine diagnostic procedures due to the lack of standard protocols. Furthermore, defined breakpoints for the interpretation of antimicrobial susceptibilities of Arcobacter are missing. Hence, reliable epidemiological data of human Arcobacter infections are scarce and lacking for Germany. We therefore performed a 13-month prospective Arcobacter prevalence study in German patients. Results A total of 4636 human stool samples was included and Arcobacter spp. were identified from 0.85% of specimens in 3884 outpatients and from 0.40% of specimens in 752 hospitalized patients. Overall, A. butzleri was the most prevalent species (n = 24; 67%), followed by A. cryaerophilus (n = 10; 28%) and A. lanthieri (n = 2; 6%). Whereas A. butzleri, A. cryaerophilus and A. lanthieri were identified in outpatients, only A. butzleri could be isolated from samples of hospitalized patients. Antimicrobial susceptibility testing of Arcobacter isolates revealed high susceptibilities to ciprofloxacin, whereas bimodal distributions of MICs were observed for azithromycin and ampicillin. Conclusions In summary, Arcobacter including A. butzleri, A. cryaerophilus and A. lanthieri could be isolated in 0.85% of German outpatients and ciprofloxacin rather than other antibiotics might be appropriate for antibiotic treatment of infections. Further epidemiological studies are needed, however, to provide a sufficient risk assessment of Arcobacter infections in humans.

中文翻译:

来自门诊和住院患者的人类粪便样本中 Arcobacter 物种的流行和抗菌药物敏感性:前瞻性德国 Arcobacter 流行研究 Arcopath。

背景 Arcobacter 物种,特别是 A. butzleri,以及 A. cryaerophilus 构成了引起人类胃肠炎的新出现的病原体。然而,由于缺乏标准方案,在常规诊断过程中,弓形杆菌的分离可能经常失败。此外,缺少用于解释 Arcobacter 抗菌素敏感性的定义断点。因此,德国缺乏可靠的人类弓形杆菌感染流行病学数据。因此,我们在德国患者中进行了一项为期 13 个月的前瞻性 Arcobacter 流行率研究。结果 共纳入 4636 份人类粪便样本和 Arcobacter spp。从 3884 例门诊患者的 0.85% 标本和 752 例住院患者的 0.40% 标本中鉴定出。总体而言,A. butzleri 是最普遍的物种(n = 24;67%),其次是 A. cryaerophilus (n = 10; 28%) 和 A. lanthieri (n = 2; 6%)。虽然 A. butzleri、A. cryaerophilus 和 A. lanthieri 在门诊患者中被发现,但只有 A. butzleri 可以从住院患者的样本中分离出来。Arcobacter 分离株的抗菌药敏试验显示对环丙沙星的高度敏感性,而观察到阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出包括A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri在内的Arcobacter,并且环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。兰蒂里 (n = 2; 6%)。虽然 A. butzleri、A. cryaerophilus 和 A. lanthieri 在门诊患者中被发现,但只有 A. butzleri 可以从住院患者的样本中分离出来。Arcobacter 分离株的抗菌药敏试验显示对环丙沙星的高度敏感性,而观察到阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出包括A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri在内的Arcobacter,并且环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。兰蒂里 (n = 2; 6%)。虽然 A. butzleri、A. cryaerophilus 和 A. lanthieri 在门诊患者中被发现,但只有 A. butzleri 可以从住院患者的样本中分离出来。Arcobacter 分离株的抗菌药敏试验显示对环丙沙星的高度敏感性,而观察到阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出包括A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri在内的Arcobacter,并且环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。只有 A. butzleri 可以从住院患者的样本中分离出来。Arcobacter 分离株的抗菌药敏试验显示对环丙沙星的高度敏感性,而观察到阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出包括A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri在内的Arcobacter,并且环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。只有 A. butzleri 可以从住院患者的样本中分离出来。Arcobacter 分离株的抗菌药敏试验显示对环丙沙星的高度敏感性,而观察到阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出包括A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri在内的Arcobacter,并且环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。而阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出包括A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri在内的Arcobacter,并且环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。而阿奇霉素和氨苄青霉素的 MIC 呈双峰分布。结论 综上所述,0.85%的德国门诊患者可分离出A. butzleri、A. cryaerophilus和A. lanthieri等弧杆菌,环丙沙星可能比其他抗生素更适合抗生素治疗感染。然而,需要进一步的流行病学研究来对人类弓形杆菌感染进行充分的风险评估。
更新日期:2020-04-22
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