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The T-shirt microbiome is distinct between individuals and shaped by washing and fabric type.
Environmental Research ( IF 8.3 ) Pub Date : 2020-03-30 , DOI: 10.1016/j.envres.2020.109449
Eva Baggesgaard Sterndorff 1 , Jakob Russel 1 , Jonas Jakobsen 2 , Martin Steen Mortensen 1 , Klaus Gori 2 , Jakob Herschend 3 , Mette Burmølle 1
Affiliation  

Activity of the microbial population in clothing causes unpleasant odor and textile deterioration. However, little is known about how the textile microbial community is shaped. In this study, we developed a method for extracting DNA from small amounts of detergent-washed clothing, and applied it to both worn and unworn, washed and unwashed cotton and polyester samples of the axillary region of T-shirts from 10 male subjects. The combined application of 16S rRNA gene amplicon sequencing and quantitative PCR allowed us to estimate the absolute abundances of bacteria in the samples. We found that the T-shirt microbiome was highly individual, both in composition, diversity and microbial biomass. Fabric type was influential where Acinetobacter was more abundant in cotton. Intriguingly, unworn cotton T-shirts had a native microbiome dominated by Acinetobacter, whereas unworn polyester had no detectable bacterial microbiome. The native textile microbiome did not seem to have any effect on the microbial composition emerging from wearing the garment. Surprisingly, washing in mild detergent had only minor effects on the composition and biomass of the microbial community, and only few Amplicon Sequence Variants (ASV)s were found to decrease in abundance after washing. Individual variations between test subjects shaped the microbial community more than the type of fabric or wash with detergent. The individuality of T-shirt microbiomes and specificity of the washing procedure suggests that personalized laundry regimes could be applied to increase efficient removal of undesired bacteria.

中文翻译:

T恤微生物组在个体之间是不同的,并通过洗涤和织物类型来塑造。

衣物中微生物种群的活动会导致令人不愉快的气味和纺织品变质。但是,人们对纺织微生物群落的形成知之甚少。在这项研究中,我们开发了一种从少量用洗涤剂洗涤的衣服中提取DNA的方法,并将其应用于10位男性受试者的T恤腋部区域的已穿和未穿,已洗涤和未洗涤的棉花和聚酯样品。16S rRNA基因扩增子测序和定量PCR的结合应用使我们能够估计样品中细菌的绝对丰度。我们发现,T恤微生物组在组成,多样性和微生物生物量方面都是高度独立的。织物类型对棉花中不动杆菌的含量有影响。有趣的是 未穿用的棉质T恤衫具有由不动杆菌占主导的天然微生物组,而未穿用的聚酯则无可检测的细菌微生物组。天然纺织品微生物组似乎对穿衣服后产生的微生物成分没有任何影响。出人意料的是,用温和的洗涤剂洗涤对微生物群落的组成和生物量影响很小,洗涤后发现只有很少的扩增子序列变异体(ASV)降低了丰度。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。而未使用的聚酯没有可检测的细菌微生物组。天然纺织品微生物组似乎对穿衣服后产生的微生物成分没有任何影响。出人意料的是,用温和的洗涤剂洗涤对微生物群落的组成和生物量影响很小,洗涤后发现只有很少的扩增子序列变异体(ASV)降低了丰度。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。而未使用的聚酯没有可检测的细菌微生物组。天然纺织品微生物组似乎对穿衣服后产生的微生物成分没有任何影响。出人意料的是,用温和的洗涤剂洗涤对微生物群落的组成和生物量影响很小,洗涤后发现只有很少的扩增子序列变异体(ASV)降低了丰度。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。天然纺织品微生物组似乎对穿衣服后产生的微生物成分没有任何影响。出人意料的是,用温和的洗涤剂洗涤对微生物群落的组成和生物量影响很小,洗涤后发现只有很少的扩增子序列变异体(ASV)降低了丰度。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。天然纺织品微生物组似乎对穿衣服后产生的微生物成分没有任何影响。出人意料的是,用温和的洗涤剂洗涤对微生物群落的组成和生物量影响很小,洗涤后发现只有很少的扩增子序列变异体(ASV)降低了丰度。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。清洗后发现只有少数扩增子序列变异体(ASV)的丰度降低。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。清洗后发现只有少数扩增子序列变异体(ASV)的丰度降低。测试对象之间的个体差异对微生物群落的影响大于织物的类型或用洗涤剂洗涤的微生物。T恤微生物组的独特性和洗涤程序的特异性表明,可以应用个性化的洗衣方案来提高有效去除有害细菌的能力。
更新日期:2020-03-31
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