Anthropogenic climate change is causing a world‐wide reduction of alpine habitat, leaving many high‐elevation species restricted to sky‐islands and vulnerable to extinction. Understanding the genetic parameters of these populations provides key insight into species diversity, dispersal capacity and vulnerability to disturbance. We examined the impact of past climatic variation on a threatened alpine endemic lizard, the Guthega skink, Liopholis guthega. We analysed SNP and mtDNA data to determine the population structure and phylogeny within this species, providing an understanding of the species’ relatedness, dispersal and viability. We identified significant genetic structure, with the split between populations in Koscuiszko National Park, New South Wales (NSW) and the Bogong High Plains, Victoria (VIC) consistent with Plio‐Pleistocene divergence. However, we also detected evidence of possible historical introgressive hybridization between some NSW populations and the VIC populations. Marked within‐site population structure and significant population differentiation among sites within each state were found, indicating a limited dispersal capacity. Higher levels of genetic diversity within NSW support the correlation between elevation and diversity and implicate Kosciuszko National Park as a historic refugia. Low contemporary habitat availability, little to no capacity for elevational progression and low genetic diversity, particularly in VIC, leaves L. guthega highly vulnerable to threatening processes associated with climate change. Conservation management should consider genetic rescue as a potential method to enhance genetic diversity across this species’ range.

中文翻译：

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异域差异驱动具有天岛分布的濒危高山特有蜥蜴的遗传结构

人为气候变化正在导致全球范围内的高山栖息地减少，许多高海拔物种仅限于天空岛，容易灭绝。了解这些种群的遗传参数可以提供对物种多样性、传播能力和对干扰的脆弱性的关键洞察。我们研究了过去气候变化对受威胁的高山特有蜥蜴 Guthega 石龙子 Liopholis Guthega 的影响。我们分析了 SNP 和 mtDNA 数据以确定该物种内的种群结构和系统发育，从而了解该物种的相关性、扩散和生存能力。我们确定了显着的遗传结构，新南威尔士州 (NSW) 的 Koscuiszko 国家公园和维多利亚州博贡高原 (VIC) 的种群之间的分裂与上新世-更新世的分化一致。然而，我们还检测到一些新南威尔士州人口与维多利亚州人口之间可能存在历史渐进杂交的证据。在每个州内发现了显着的站点内种群结构和显着的站点间种群差异，表明扩散能力有限。新南威尔士州更高水平的遗传多样性支持海拔和多样性之间的相关性，并暗示 Kosciuszko 国家公园是一个历史性的避难所。当代栖息地可用性低、海拔升高能力很小甚至没有能力以及遗传多样性低，特别是在维多利亚州，使得 L.guthega 极易受到与气候变化相关的威胁过程的影响。保护管理应考虑将基因拯救作为增强该物种范围内遗传多样性的潜在方法。我们还检测到一些新南威尔士州人口与维多利亚州人口之间可能存在历史渐进杂交的证据。在每个州内发现了显着的站点内种群结构和显着的站点间种群差异，表明扩散能力有限。新南威尔士州更高水平的遗传多样性支持海拔和多样性之间的相关性，并暗示 Kosciuszko 国家公园是一个历史性的避难所。当代栖息地可用性低、海拔升高能力很小甚至没有能力以及遗传多样性低，特别是在维多利亚州，使得 L.guthega 极易受到与气候变化相关的威胁过程的影响。保护管理应考虑将基因拯救作为增强该物种范围内遗传多样性的潜在方法。我们还检测到一些新南威尔士州人口与维多利亚州人口之间可能存在历史渐进杂交的证据。在每个州内发现了显着的站点内种群结构和显着的站点间种群差异，表明扩散能力有限。新南威尔士州更高水平的遗传多样性支持海拔和多样性之间的相关性，并暗示 Kosciuszko 国家公园是一个历史性的避难所。当代栖息地可用性低、海拔升高能力很小甚至没有能力以及遗传多样性低，特别是在维多利亚州，使得 L.guthega 极易受到与气候变化相关的威胁过程的影响。保护管理应考虑将基因拯救作为增强该物种范围内遗传多样性的潜在方法。