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Increasing the species diversity in the Aspergillus section Nidulantes: Six novel species mainly from the indoor environment
Mycologia ( IF 2.8 ) Pub Date : 2020-02-19 , DOI: 10.1080/00275514.2019.1698923
F Sklenář 1, 2 , Ž Jurjević 3 , S W Peterson 4 , M Kolařík 1, 2 , A Nováková 2 , M Flieger 2 , E Stodůlková 2 , A Kubátová 1 , V Hubka 1, 2
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ABSTRACT Aspergillus section Nidulantes encompasses almost 80 homothallic and anamorphic species, mostly isolated from soil, plant material, or the indoor environment. Some species are clinically relevant or produce mycotoxins. This study reevaluated the species boundaries within several clades of section Nidulantes. Five data sets were assembled, each containing presumptive new species and their closest relatives, and phylogenetic and phenotypic analyses were performed. We tested the hypotheses that the newly isolated or reexamined strains constitute separate species (splitting approach) or should be treated as part of broadly defined species (lumping approach). Four DNA sequence loci were amplified, internal transcribed spacer (ITS) and large subunit (LSU) regions of the rDNA and partial sequences of the β-tubulin (benA), calmodulin (CaM), and RNA polymerase II second largest subunit (RPB2) genes. The latter three loci were used for the phylogenetic analysis and served as input for single-locus (GMYC, bGMYC, PTP, and bPTP) and multilocus (STACEY and BP&P) species delimitation analyses. The phenotypic analysis comprised macro- and micromorphology (including scanning electron microscopy) and comparison of cardinal growth temperatures. The phylogenetic analysis supported the splitting hypothesis in all cases, and based on the combined approach, we propose six new species, four that are homothallic and two anamorphic. Four new species were isolated from the indoor environment (Jamaica, Trinidad and Tobago, USA), one originated from soil (Australia), and one from a kangaroo rat cheek pouch (USA).

中文翻译:

增加 Nidulantes 曲霉部分的物种多样性:主要来自室内环境的六种新物种

摘要 曲霉节 Nidulantes 包括近 80 种同质和变形物种,大部分是从土壤、植物材料或室内环境中分离出来的。一些物种具有临床相关性或产生霉菌毒素。这项研究重新评估了 Nidulantes 部分的几个进化枝内的物种边界。组装了五个数据集,每个数据集都包含推定的新物种及其最近的亲属,并进行了系统发育和表型分析。我们测试了新分离或重新检查的菌株构成独立物种(分裂方法)或应作为广义物种的一部分(集总方法)的假设。扩增了四个 DNA 序列位点、rDNA 的内部转录间隔区 (ITS) 和大亚基 (LSU) 区域以及 β-微管蛋白 (benA)、钙调蛋白 (CaM)、和 RNA 聚合酶 II 第二大亚基 (RPB2) 基因。后三个基因座用于系统发育分析,并作为单基因座(GMYC、bGMYC、PTP 和 bPTP)和多基因座(STACEY 和 BP&P)物种定界分析的输入。表型分析包括宏观和微观形态(包括扫描电子显微镜)和基本生长温度的比较。系统发育分析在所有情况下都支持分裂假设,并且基于组合方法,我们提出了六个新物种,四个是同种的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。后三个基因座用于系统发育分析,并作为单基因座(GMYC、bGMYC、PTP 和 bPTP)和多基因座(STACEY 和 BP&P)物种定界分析的输入。表型分析包括宏观和微观形态(包括扫描电子显微镜)和基本生长温度的比较。系统发育分析在所有情况下都支持分裂假设,并且基于组合方法,我们提出了六个新物种,四个是同种的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。后三个基因座用于系统发育分析,并作为单基因座(GMYC、bGMYC、PTP 和 bPTP)和多基因座(STACEY 和 BP&P)物种定界分析的输入。表型分析包括宏观和微观形态(包括扫描电子显微镜)和基本生长温度的比较。系统发育分析在所有情况下都支持分裂假设,并且基于组合方法,我们提出了六个新物种,四个是同种的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。P) 物种定界分析。表型分析包括宏观和微观形态(包括扫描电子显微镜)和基本生长温度的比较。系统发育分析在所有情况下都支持分裂假设,并且基于组合方法,我们提出了六个新物种,四个是同种的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。P) 物种定界分析。表型分析包括宏观和微观形态(包括扫描电子显微镜)和基本生长温度的比较。系统发育分析在所有情况下都支持分裂假设,并且基于组合方法,我们提出了六个新物种,四个是同种的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。四个是同色的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。四个是同色的,两个是变形的。从室内环境中分离出四种新物种(牙买加、特立尼达和多巴哥,美国),一种来自土壤(澳大利亚),一种来自袋鼠鼠颊囊(美国)。
更新日期:2020-02-19
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