Mycoplasma gallisepticum (MG) and Mycoplasma synoviae (MS) represent the most important avian Mycoplasma species in the poultry industry, causing considerable economic losses. In Italy, the presence of MG or MS has been investigated especially in commercial poultry farms. To our knowledge, no systematic investigations on MG or MS presence using highly specific diagnostic assays have been performed in backyard poultry. The aim of this study was to detect and molecularly characterize MG and MS strains in 11 backyard poultry flocks located in different regions of Italy. Tracheal swabs were collected and DNA was extracted. For MS, a PCR targeting a vlhA gene fragment was performed, and typing and subtyping was attempted. The presence of MG was investigated by a screening PCR, then MG typing by gene-targeted sequencing (GTS). All the amplicons were sequenced, then MG and MS dendrograms were constructed. All the flocks examined resulted Mycoplasma positive: 5 out of 11 (45.45%) were MG and MS positive, 3 (27.27%) were MG positive, and the remaining 3 (27.27%) were MS positive. The MS detections were assigned to types C, D, and F. All strains of type D belonged to subtype D1 and 2 unknown subtypes were identified. A MS sequence showed peculiar characteristics, which did not allow assignment to a known MS type or subtype. MG GTS analysis identified 6 MG strains belonging to 5 subclusters circulating in Italian backyards chicken flocks. The results of this study provide evidence of a risk for commercial poultry farms, especially in areas where backyard and commercial farms are close, suggesting the implementation of biosecurity measures.

中文翻译：

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意大利后院家禽的鸡支原体和滑膜支原体菌株的分子检测和表征。

鸡支原体支原体（MG）和滑膜支原体（MS）是家禽业中最重要的禽支原体种，造成了可观的经济损失。在意大利，已经对MG或MS的存在进行了调查，尤其是在商业家禽养殖场。据我们所知，尚未在后院家禽中使用高度特异性的诊断分析方法对MG或MS的存在进行系统的研究。这项研究的目的是检测和分子鉴定位于意大利不同地区的11个后院家禽群中的MG和MS菌株。收集气管拭子并提取DNA。对于MS，进行靶向vlhA基因片段的PCR，并尝试打字和分型。通过筛选PCR研究MG的存在，然后通过基因靶向测序（GTS）进行MG分型。对所有扩增子进行测序，然后构建MG和MS树状图。检查的所有羊群均呈支原体阳性：11个中的5个（45.45％）为MG和MS阳性，3个（27.27％）为MG阳性，其余3个（27.27％）为MS阳性。MS检测结果指定为C，D和F型。所有D型菌株均属于D1亚型，并鉴定出2种未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。然后构造了MG和MS树状图。检查的所有羊群均呈支原体阳性：11个中的5个（45.45％）为MG和MS阳性，3个（27.27％）为MG阳性，其余3个（27.27％）为MS阳性。MS检测结果指定为C，D和F型。所有D型菌株均属于D1亚型，并且鉴定出2种未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。然后构造了MG和MS树状图。检查的所有羊群均呈支原体阳性：11个中的5个（45.45％）为MG和MS阳性，3个（27.27％）为MG阳性，其余3个（27.27％）为MS阳性。MS检测结果指定为C，D和F型。所有D型菌株均属于D1亚型，并且鉴定出2种未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。11名中的5名（45.45％）为MG和MS阳性，3名（27.27％）为MG阳性，其余3名（27.27％）为MS阳性。MS检测结果指定为C，D和F型。所有D型菌株均属于D1亚型，并且鉴定出2种未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。11名中的5名（45.45％）为MG和MS阳性，3名（27.27％）为MG阳性，其余3名（27.27％）为MS阳性。MS检测结果指定为C，D和F型。所有D型菌株均属于D1亚型，并且鉴定出2种未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。所有D型菌株都属于D1亚型，鉴定出2个未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。所有D型菌株都属于D1亚型，并且鉴定出2个未知亚型。MS序列显示出独特的特征，不允许分配给已知的MS类型或亚型。MG GTS分析确定了在意大利后院鸡群中流通的5个亚群中的6种MG菌株。这项研究的结果提供了商业家禽养殖场风险的证据，尤其是在后院和商业养殖场较近的地区，这表明生物安全措施的实施。