Species of the ascomycete genus Mycosphaerella are regarded as some of the most destructive leaf pathogens of a large number of economically important crop plants. Amongst these, approximately 60 Mycosphaerella spp. have been identified from various Eucalyptus spp. where they cause leaf diseases collectively known as Mycosphaerella Leaf Disease (MLD). Species concepts for this group of fungi remain confused, and hence their species identification is notoriously difficult. Thus, the introduction of DNA sequence comparisons has become the definitive characteristic used to distinguish species of Mycosphaerella. Sequences of the Internal Transcribed Spacer (ITS) region of the ribosomal RNA operon have most commonly been used to consider species boundaries in Mycosphaerella. However, sequences for this gene region do not always provide sufficient resolution for cryptic taxa. The aim of this study was, therefore, to use DNA sequences for three loci, ITS, Elongation factor 1-alpha (EF-1alpha) and Actin (ACT) to reconsider species boundaries for Mycosphaerella spp. from Eucalyptus. A further aim was to study the anamorph concepts and resolve the deeper nodes of Mycosphaerella, for which part of the Large Subunit (LSU) of the nuclear rRNA operon was sequenced. The ITS and EF-1alpha gene regions were found to be useful, but the ACT gene region did not provide species-level resolution in Mycosphaerella. A phylogeny of the combined DNA datasets showed that species of Mycosphaerella from Eucalyptus cluster in two distinct groups, which might ultimately represent discrete genera.

中文翻译：

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桉树叶上发生的Mycosphaerella 物种的多基因系统发育。

子囊菌属 Mycosphaerella 被认为是对大量经济上重要的作物植物最具破坏性的叶病原体之一。其中，大约 60 种Mycosphaerella spp。已从各种桉树中鉴定出来。它们会引起叶病，统称为球孢菌叶病 (MLD)。这组真菌的物种概念仍然混乱，因此它们的物种鉴定是出了名的困难。因此，引入 DNA 序列比较已成为用于区分球孢菌属的确定性特征。核糖体 RNA 操纵子的内部转录间隔区 (ITS) 区域的序列最常用于考虑球孢菌中的物种边界。然而，该基因区域的序列并不总是为神秘分类群提供足够的分辨率。因此，本研究的目的是使用三个基因座、ITS、延伸因子 1-α (EF-1alpha) 和肌动蛋白 (ACT) 的 DNA 序列来重新考虑 Mycosphaerella spp 的物种边界。来自桉树。另一个目的是研究变形概念并解析球孢菌的更深节点，为此对核 rRNA 操纵子的大亚基 (LSU) 的一部分进行了测序。发现 ITS 和 EF-1alpha 基因区域是有用的，但 ACT 基因区域在 Mycosphaerella 中没有提供物种级别的分辨率。组合 DNA 数据集的系统发育表明，来自桉树的 Mycosphaerella 物种聚集在两个不同的群体中，这可能最终代表离散的属。因此，使用三个基因座的 DNA 序列，ITS、延伸因子 1-α (EF-1alpha) 和肌动蛋白 (ACT) 来重新考虑 Mycosphaerella spp 的物种边界。来自桉树。另一个目的是研究变形概念并解析球孢菌的更深节点，为此对核 rRNA 操纵子的大亚基 (LSU) 的一部分进行了测序。发现 ITS 和 EF-1alpha 基因区域是有用的，但 ACT 基因区域在 Mycosphaerella 中没有提供物种级别的分辨率。组合 DNA 数据集的系统发育表明，来自桉树的 Mycosphaerella 物种聚集在两个不同的群体中，这可能最终代表离散的属。因此，使用三个基因座的 DNA 序列，ITS、延伸因子 1-α (EF-1alpha) 和肌动蛋白 (ACT) 来重新考虑 Mycosphaerella spp 的物种边界。来自桉树。另一个目的是研究变形概念并解析球孢菌的更深节点，为此对核 rRNA 操纵子的大亚基 (LSU) 的一部分进行了测序。发现 ITS 和 EF-1alpha 基因区域是有用的，但 ACT 基因区域在 Mycosphaerella 中没有提供物种级别的分辨率。组合 DNA 数据集的系统发育表明，来自桉树的 Mycosphaerella 物种聚集在两个不同的群体中，这可能最终代表离散的属。另一个目的是研究变形概念并解析球孢菌的更深节点，为此对核 rRNA 操纵子的大亚基 (LSU) 的一部分进行了测序。发现 ITS 和 EF-1alpha 基因区域是有用的，但 ACT 基因区域在 Mycosphaerella 中没有提供物种级别的分辨率。组合 DNA 数据集的系统发育表明，来自桉树的 Mycosphaerella 物种聚集在两个不同的群体中，这可能最终代表离散的属。另一个目的是研究变形概念并解析球孢菌的更深节点，为此对核 rRNA 操纵子的大亚基 (LSU) 的一部分进行了测序。发现 ITS 和 EF-1alpha 基因区域是有用的，但 ACT 基因区域在 Mycosphaerella 中没有提供物种级别的分辨率。组合 DNA 数据集的系统发育表明，来自桉树的 Mycosphaerella 物种聚集在两个不同的群体中，这可能最终代表离散的属。