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Quality Control of RNA Extracted from PAXgene Blood RNA Tubes After Different Storage Periods.
Biopreservation and Biobanking ( IF 1.6 ) Pub Date : 2019-07-26 , DOI: 10.1089/bio.2019.0029
Rong Tang 1 , Qinying She 1 , Yinghui Lu 1 , Ru Yin 1 , Ping Zhu 1 , Ling Zhu 1 , Minlin Zhou 1 , Chunxia Zheng 1
Affiliation  

Background: The PAXgene Blood RNA tube is used to protect RNA of whole blood, and the stability of RNA in this tube has already been reported. However, there are few reports on the quality of RNA from long-term preservation of these tubes. Materials and Methods: Our biobank conducted quality control of RNA extracted from the tubes after varying storage periods. A total of 300 blood samples of renal disease patients were randomly selected at each time point (from 1 month to 7 years). Results: Median RNA yields were 3.46 (2.65-4.87) μg, 4.34 (3.20-5.87) μg, 4.77 (2.88-6.29) μg, 4.19 (2.65-6.26) μg, 3.85 (2.43-6.13) μg, and 3.21 (1.85-6.61) μg at 1 month, 1, 2, 3, 6, and 7 years, respectively. There were no significant differences in RNA yields among all the storage periods. A260/280 ratios were 2.02 ± 0.04, 2.05 ± 0.04, 2.05 ± 0.04, 2.08 ± 0.03, 2.12 ± 0.10, and 2.11 ± 0.05, all of which were ≥1.8. However, A260/280 of the samples stored for 6 and 7 years had a rising trend, compared with the other time points (p < 0.05). Median RNA integrity number (RIN) values were 8.4 (7.6-9.1), 8.3 (7.7-8.9), 8.3 (7.8-8.8), 8.5 (8.3-8.9), 7.6 (7.1-8.1), and 7.9 (7.2-8.3) at each time point. Lower RIN values were found at 6 and 7 years compared with the other storage periods (p < 0.05). The rates of RIN values ≥7.0 were 92%, 84%, 96%, 92%, 86%, and 84%, which exhibited no differences across all the storage periods. In addition, the yields and RIN values of RNA from samples with blood clots were significantly lower than those without (p < 0.001). Conclusions: The quantity and quality of RNA extracted from PAXgene Blood RNA tubes are stable throughout cryopreservation for 7 years.

中文翻译:

在不同的保存期限后从PAXgene血液RNA管中提取的RNA的质量控制。

背景:PAXgene血液RNA管用于保护全血RNA,并且已经报道了该管中RNA的稳定性。然而,很少有关于长期保存这些试管的RNA质量的报道。材料和方法:我们的生物库在不同的储存时间后对从试管中提取的RNA进行了质量控制。在每个时间点(从1个月到7年)随机抽取300例肾病患者的血液样本。结果:中位数RNA产量为3.46(2.65-4.87)μg,4.34(3.20-5.87)μg,4.77(2.88-6.29)μg,4.19(2.65-6.26)μg,3.85(2.43-6.13)μg和3.21(1.85) -6.61)μg,分别在1个月,1、2、3、6和7年。在所有存储期间,RNA产量均无显着差异。A260 / 280的比率为2.02±0.04、2.05±0.04、2.05±0.04、2.08±0.03、2。12±0.10和2.11±0.05,均≥1.8。但是,与其他时间点相比,存储6年和7年的样品中的A260 / 280呈上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。11±0.05,均≥1.8。但是,与其他时间点相比,存储6年和7年的样品中的A260 / 280呈上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。11±0.05,均≥1.8。但是,与其他时间点相比,保存6年和7年的样品的A260 / 280呈上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。但是,与其他时间点相比,存储6年和7年的样品中的A260 / 280呈上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内是稳定的。但是,与其他时间点相比,存储6年和7年的样品中的A260 / 280呈上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。与其他时间点相比,存储了6年和7年的样品中的A260 / 280具有上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。与其他时间点相比,存储了6年和7年的样品中的A260 / 280具有上升趋势(p <0.05)。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他储存期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。RNA完整性中位数(RIN)值分别为8.4(7.6-9.1),8.3(7.7-8.9),8.3(7.8-8.8),8.5(8.3-8.9),7.6(7.1-8.1)和7.9(7.2-8.3) )在每个时间点。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内是稳定的。与其他存储期相比,发现6年和7年时的RIN值较低(p <0.05)。RIN值≥7.0的比率为92%,84%,96%,92%,86%和84%,在所有存储期间均无差异。此外,带有血块的样品的RNA产量和RIN值显着低于没有血块的样品(p <0.001)。结论:从PAXgene血液RNA管提取的RNA的数量和质量在整个冷冻保存7年内都是稳定的。
更新日期:2019-11-01
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