当前位置: X-MOL 学术J. Hered. › 论文详情
Our official English website, www.x-mol.net, welcomes your feedback! (Note: you will need to create a separate account there.)
Using Ancestry-Informative SNPs to Quantify Introgression of European Alleles into North American Red Foxes
Journal of Heredity ( IF 3.1 ) Pub Date : 2019-09-28 , DOI: 10.1093/jhered/esz053
Yi Hung Kuo 1, 2 , Stevi L Vanderzwan 2 , Adrienne E Kasprowicz 3 , Benjamin N Sacks 4
Affiliation  

A recent study demonstrated that British red foxes introduced to the mid-Atlantic coastal plain (ACP) of the eastern US during the late 18th century successfully interbred with indigenous American red foxes despite half a million year's divergence. However, a large disparity in frequency of European mitochondria (27%) versus Y chromosomes (1%) left unclear the magnitude of genetic exchange. We sought to quantify genomic introgression using 35 autosomal and 5 X chromosome ancestry-informative markers (AIMs) in conjunction with diagnostic Y-SNP markers to characterize the modern state of red foxes in the eastern US and to gain insight into the potential role of reproductive barriers. European admixture was highest in the ACP and apparently restricted to the central eastern US. We estimated only slightly higher (and nonsignificantly) European ancestry in autosomal than X chromosome markers. European ancestry from autosomal and X chromosome markers (36.4%) was higher than the corresponding mtDNA estimate (26.4%) in the ACP. Only 1 of 124 males (<1%) in the ACP had European Y chromosomes, which was similar to the neighboring regions, in which 2 of 99 (2%) males carried a European Y chromosome (the same haplotype). Although we could not rule out drift as the cause of low European Y chromosome frequency, results were also consistent with F1 male infertility. In the future, more extensive genomic sequencing will enable a more thorough investigation of possible barrier genes on the X chromosome as well as throughout the genome.

中文翻译:

使用祖先信息 SNP 量化欧洲等位基因渗入北美红狐

最近的一项研究表明,在 18 世纪后期引入美国东部大西洋中部沿海平原 (ACP) 的英国红狐,尽管经历了 50 万年的分歧,但仍成功地与美国本土红狐杂交。然而,欧洲线粒体 (27%) 与 Y 染色体 (1%) 的频率存在巨大差异,因此尚不清楚遗传交换的程度。我们试图使用 35 个常染色体和 5 个 X 染色体祖先信息标记 (AIM) 结合诊断性 Y-SNP 标记来量化基因组渗入,以表征美国东部红狐的现代状态,并深入了解生殖的潜在作用。障碍。欧洲混合物在 ACP 中最高,显然仅限于美国中东部。我们估计常染色体中的欧洲血统仅比 X 染色体标记略高(且不显着)。来自常染色体和 X 染色体标记的欧洲血统 (36.4%) 高于 ACP 中相应的 mtDNA 估计值 (26.4%)。ACP 中 124 名男性中只有 1 名 (<1%) 具有欧洲 Y 染色体,这与邻近地区相似,其中 99 名 (2%) 男性中有 2 名携带欧洲 Y 染色体(相同的单倍型)。虽然我们不能排除漂移是欧洲 Y 染色体频率低的原因,但结果也与 F1 男性不育症一致。将来,更广泛的基因组测序将使对 X 染色体上以及整个基因组上可能的屏障基因进行更彻底的调查。来自常染色体和 X 染色体标记的欧洲血统 (36.4%) 高于 ACP 中相应的 mtDNA 估计值 (26.4%)。ACP 中 124 名男性中只有 1 名 (<1%) 具有欧洲 Y 染色体,这与邻近地区相似,其中 99 名 (2%) 男性中有 2 名携带欧洲 Y 染色体(相同的单倍型)。虽然我们不能排除漂移是欧洲 Y 染色体频率低的原因,但结果也与 F1 男性不育症一致。将来,更广泛的基因组测序将使对 X 染色体上以及整个基因组上可能的屏障基因进行更彻底的调查。来自常染色体和 X 染色体标记的欧洲血统 (36.4%) 高于 ACP 中相应的 mtDNA 估计值 (26.4%)。ACP 中 124 名男性中只有 1 名 (<1%) 具有欧洲 Y 染色体,这与邻近地区相似,其中 99 名 (2%) 男性中有 2 名携带欧洲 Y 染色体(相同的单倍型)。虽然我们不能排除漂移是欧洲 Y 染色体频率低的原因,但结果也与 F1 男性不育症一致。将来,更广泛的基因组测序将使对 X 染色体上以及整个基因组上可能的屏障基因进行更彻底的调查。其中 99 名 (2%) 男性中有 2 名携带欧洲 Y 染色体(相同的单倍型)。虽然我们不能排除漂移是欧洲 Y 染色体频率低的原因,但结果也与 F1 男性不育症一致。将来,更广泛的基因组测序将使对 X 染色体上以及整个基因组上可能的屏障基因进行更彻底的调查。其中 99 名 (2%) 男性中有 2 名携带欧洲 Y 染色体(相同的单倍型)。虽然我们不能排除漂移是欧洲 Y 染色体频率低的原因,但结果也与 F1 男性不育症一致。将来,更广泛的基因组测序将使对 X 染色体上以及整个基因组上可能的屏障基因进行更彻底的调查。
更新日期:2019-09-28
down
wechat
bug